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. 2020 Sep 25;11:567235. doi: 10.3389/fmicb.2020.567235

TABLE 2.

Cultures processed and country distribution of the bacteria isolates.

Burkina Faso Gabon Ghana Tanzania All countries
Number of all samples processed, n 605 970 1708 769 4052
All bacteria isolated, n (%) 38 (6) 35 (4) 129 (8) 17 (2) 219 (5)
Blood samples processed, n 482 593 1238 696 3009
Bacteria isolated from blood, n (%) 27 (6) 8 (1) 61 (5) 17 (2) 113 (4)
Enterococcus faecalis 4 (15) 0 (0) 0 (0) 0 (0) 4 (4)
Escherichia coli 7 (26) 1 (13) 1 (2) 2 (12) 11 (10)
Klebsiella oxytoca 0 (0) 0 (0) 1 (2) 0 (0) 1 (1)
Klebsiella pneumoniae 1 (4) 1 (13) 1 (2) 0 (0) 3 (3)
Nt Salmonella 10 (37) 4 (50) 55 (90) 0 (0) 69 (61)
Salmonella Typhi 1 (4) 0 (0) 0 (0) 10 (59) 11 (10)
Serratia marcescens 1 (4) 0 (0) 0 (0) 0 (0) 1 (1)
Staphylococcus aureus 3 (11) 2 (25) 3 (5) 5 (29) 13 (12)
Stool samples processed, n 18 91 232 71 412
Bacteria isolated from stool n (%) 1 (6) 3 (3) 5 (2) 0 (0) 9 (2)
Nt Salmonella 1 (100) 2 (67) 5 (100) 0 (0) 8 (89)
Shigella sonnei 0 (0) 1 (33) 0 (0) 0 (0) 1 (11)
Urine samples processed, n 105 286 238 0 629
Bacteria isolated from urine n (%) 10 (10) 24 (8) 63 (26) 0 (0) 97 (15)
Acinetobacter baumannii complex 0 (0) 1 (4) 1 (2) 0 (0) 2 (2)
Enterobacter cloacae 0 (0) 0 (0) 1 (2) 0 (0) 1 (1)
Enterococcus faecium 0 (0) 0 (0) 3 (5) 0 (0) 3 (3)
Escherichia coli 8 (80) 10 (42) 43 (68) 0 (0) 61 (63)
Klebsiella pneumoniae 1 (10) 7 (29) 11 (17) 0 (0) 19 (20)
Proteus mirabilis 0 (0) 2 (8) 1 (2) 0 (0) 3 (3)
Proteus penneri 0 (0) 1 (4) 0 (0) 0 (0) 1 (1)
Proteus vulgaris 0 (0) 1 (4) 0 (0) 0 (0) 1 (1)
Pseudomonas aeruginosa 0 (0) 0 (0) 1 (2) 0 (0) 1 (1)
Nt Salmonella 1 (10) 1 (4) 0 (0) 0 (0) 2 (2)
Staphylococcus aureus 0 (0) 1 (4) 2 (3) 0 (0) 3 (3)

n, sample size; nt Salmonella, non-typhoid Salmonella.