Table 1.
Serotype | SPI 1 | SPI 2 | SPI 3 | SPI 4 | SPI 5 | SPI 6 | SPI 7 | SPI 8 | SPI 9 | SPI 10 | SPI 11 | SPI 12 | SPI 13 | SPI 14 | SPI 15 | SPI 16 | SPI 17 | SPI 18 | SPI 19 | SPI 20 | SPI 21 | SPI 22 | SPI 23 |
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Typhimurium (136) 2 | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Newport (43) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | 5% | + | + | + | + | - | + | - | 2% | - | - | - | - | - |
Heidelberg (38) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Choleraesuis (35) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Derby (29) | + | + | + | + | + | + | - | 17% | + | - | + | + | - | - | - | + | 17% | - | - | - | - | - | 83% |
Anatum (16) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | 87% | + | + | + | + | - | - | - | - | - | - | - | - | + |
Agona (14) | + | + | + | + | + | + | - | + | + | - | + | + | - | - | - | + | - | - | + | - | - | - | + |
Kentucky (13) | + | + | + | + | + | + | - | + | + | - | + | + | - | - | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Muenchen (11) | + | + | + | + | + | + | 20% | - | + | - | + | + | + | + | - | + | - | - | - | - | - | - | 27% |
Worthington (9) | + | + | + | + | + | + | - | + | + | - | + | + | - | - | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Mbandaka (9) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | - | - | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Uganda (9) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Senftenberg (8) | + | + | + | + | + | + | - | + | + | - | + | + | - | - | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Oranienburg (7) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | - | + | + | - | + | - | + | - | - | - | - | 86% |
I 4,5,12: i: -(3) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Schwarzengrund (6) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | - | + | + | - | + | - | + | - | - | - | - | - |
Muenster (5) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | + | + | - | + | + | - | - | - | + | - | - | - | - | + |
Reading (5) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | 80% | + | + | - | + | - | 20% | - | - | - | - | - |
Montevideo (4) 3 | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | - | + | + | - | + | - | + | - | - | - | - | - |
Enteritidis (4) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | + | + | + | + | + | - | + | + | - | + | - | - | - | - |
Saintpaul (4) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Give (4) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | - | + | + | - | - | - | + | - | - | - | - | - |
Bredeney (3) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | - | + | + | - | + | - | + | - | - | - | - | - |
Hadar (3) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Albany (2) | + | + | + | + | + | + | - | + | + | - | + | + | - | - | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Braenderup (2) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Cerro (2) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | - | - | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Hartford (2) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Infantis (2) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Java (2) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Tennessee (2) | + | + | + | + | + | + | - | + | + | - | + | + | - | - | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Bovismorbificans (1) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Cubana (1) | + | + | + | + | + | + | - | + | + | - | + | + | - | - | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Gaminara (1) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | - | + | + | - | - | - | + | - | - | - | - | - |
Javiana (1) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | - | + | + | - | + | - | + | - | - | - | - | - |
Johannesburg (1) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | - | + | + | - | - | - | + | - | - | - | - | - |
Krefeld (1) | + | + | + | + | + | + | - | + | + | - | + | - | - | - | - | + | + | - | + | - | - | - | - |
Litchfield (1) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | + | + | + | + | + | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Lille (1) | + | + | + | + | + | + | - | + | + | - | + | + | - | - | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
London (1) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Meleagridis (1) | + | + | + | + | + | + | - | + | + | - | + | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
Miami (1) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | - | + | + | - | + | - | + | - | - | - | - | - |
Norwich (1) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | + | - | - | - | - | - | - | - |
Panama (1) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | - | + | + | - | + | - | + | - | - | - | - | - |
Poona (1) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | + | + | - | + | + | - | + | - | + | - | - | - | - | + |
Havana (1) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | - | - | - | - | + | - | - | + | - | - | - | - |
Arizona (IIIa 56:z4) (1) | + | + | + | - | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | - | - | - | - | + | + | - | - |
Arizona(IIIa 41:z4) (1) | + | + | + | - | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | - | - | - | - | + | - | - | - |
Houtenae (IV 43:z4) (2) | + | + | + | + | + | + | - | - | + | - | + | + | + | + | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
1 Green: SPIs presented in all S. enterica subspecies I and IV isolates; Yellow: SPIs are absent in all S. enterica subspecies I and IV isolates; no color: SPIs presence varied by serotypes; 2 Typhimurium included S. Typhimurium, S. Typhimurium (O5-) and variant of S. Typhimurium.