Skip to main content
. 2020 Oct 16;33(4):766–781. doi: 10.1007/s42535-020-00162-1

Table 2.

Molecular docking results of 31 ligands with 6LU7

S. No Ligands Binding energy (ΔG) (kcal/mol) Ligand efficiency Inhibition constant (µM) Intermolecular energy Vdw H-bond desolvation
1. Nimbin − 8.66 − 0.22 0.44923 − 11.05 − 11.05
2. Nimbolide − 8.09 − 0.24 1.17 − 9.29 − 9.35
3. Salannin − 7.45 − 0.17 3.49 − 10.13 − 9.93
4. Gedunin − 9.51 − 0.27 0.10606 − 10.41 − 10.31
5. Epoxyazadiradione − 8.47 − 0.25 0.61357 − 9.37 − 9.31
6. Curcumin − 7.57 − 0.28 2.82 − 10.55 − 10.4
7. Turmerone − 6.43 − 0.4 19.4 − 7.62 − 7.57
8. Zingiberene − 6.8 − 0.45 10.43 − 7.99 − 8.00
9. Curlone − 7.05 − 0.44 6.79 − 8.24 − 8.19
10. α-Curcumene − 6.42 − 0.43 19.7 − 7.61 − 7.61
11. α-Santalene − 6.62 − 0.44 14.09 − 7.51 − 7.51
12. 6-Gingerol − 5.65 − 0.27 72.02 − 9.23 − 9.12
13. Zingerone − 5.28 − 0.38 135.49 − 6.77 − 6.67
14. Gingerenone-A − 7.00 − 0.27 7.36 − 10.28 − 10.10
15. 6-Shogaol − 6.61 − 0.33 14.33 − 9.59 − 9.43
16. 6-Dehydrogingerdione − 6.97 − 0.33 7.79 − 9.95 − 9.61
17. β-Bisabolene − 4.98 − 0.33 222.12 − 6.18 − 6.16
18. α-Farnesene − 6.37 − 0.42 21.3 − 8.16 − 817
19. Apigenin − 7.36 − 0.38 2.88 − 8.75 − 8.61
20. Linalool − 5.15 − 0.47 167.82 − 6.64 − 6.6
21. Eugenol − 4.96 − 0.41 230.21 − 6.16 − 6.13
22. β-Elemene − 6.49 − 0.43 17.57 − 7.38 − 7.38
23. α-Bergamotene − 7.27 − 0.48 4.71 − 8.16 − 8.17
24. α-Guaiene − 6.88 − 0.46 9.09 − 7.18 − 7.18
25. Germacrene D − 6.42 − 0.43 19.7 − 6.72 − 6.71
26. Cubenol − 6.99 − 0.44 7.57 − 7.58 − 7.49
27. τ-Cadinol − 7.24 − 0.45 4.97 − 7.83 − 7.82
28. α-Gurjunene − 6.59 − 0.44 14.78 − 6.59 − 6.59
29. δ-Cadinene − 6.63 − 0.44 13.71 − 6.93 − 6.94
30. Ginsenosides − 9.63 − 0.3 0.08745 − 11.42 − 11.28
31. Genistein − 7.02 − 0.35 7.14 − 8.21 − 8.1
32. N3 (Control) − 8.13 − 0.17 1.07 − 13.54 − 13.34