. 2020 Oct 19;38(49):7697–7701. doi: 10.1016/j.vaccine.2020.10.039

Table 2.

Predicted epitopes for spike protein of SARS-CoV-2 (aa319-541).

Allele	start	end	length	Sequence	score	rank
H2-K^d	350	358	9	VYAWNRKRI	0.745883	0.04
H2-K^d	504	512	9	GYQPYRVVV	0.740992	0.04
H2-D^d	525	533	9	CGPKKSTNL	0.537362	0.02
H2-D^d	382	390	9	VSPTKLNDL	0.499642	0.02
H2-K^d	379	387	9	CYGVSPTKL	0.498969	0.14
H2-K^d	494	503	10	SYGFQPTNGV	0.457492	0.17
H2-D^d	524	533	10	VCGPKKSTNL	0.432674	0.03
H2-K^d	327	335	9	VRFPNITNL	0.3807	0.22
H2-K^d	395	402	8	VYADSFVI	0.372275	0.22
H2-D^d	505	513	9	YQPYRVVVL	0.35273	0.06
H2-K^d	504	513	10	GYQPYRVVVL	0.339094	0.26
H2-K^d	328	335	8	RFPNITNL	0.319452	0.28
H2-K^d	399	407	9	SFVIRGDEV	0.319166	0.28
H2-D^d	503	511	9	VGYQPYRVV	0.313391	0.1
H2-D^d	503	513	11	VGYQPYRVVVL	0.303071	0.11
H2-K^d	378	387	10	KCYGVSPTKL	0.265013	0.36
H2-D^d	369	377	9	YNSASFSTF	0.245941	0.17
H2-D^d	410	418	9	IAPGQTGKI	0.242132	0.18
H2-D^d	445	452	8	VGGNYNYL	0.233027	0.19
H2-D^d	523	533	11	TVCGPKKSTNL	0.213929	0.24
H2-K^d	472	480	9	IYQAGSTPC	0.204669	0.48
H2-D^d	327	335	9	VRFPNITNL	0.20042	0.28
H2-D^d	522	533	12	ATVCGPKKSTNL	0.188822	0.32
H2-D^d	328	335	8	RFPNITNL	0.156347	0.45
H2-D^d	520	533	14	APATVCGPKKSTNL	0.155495	0.46
H2-D^d	444	452	9	KVGGNYNYL	0.153646	0.47
H2-D^d	370	377	8	NSASFSTF	0.152266	0.48
H2-D^d	503	510	8	VGYQPYRV	0.151477	0.49