TABLE 2.

Imputation parameter setting 1: comparison of non-MBC analysis (U) with saturation compatible (SC) and constraint compatible (CC). We denote approaches that have all available auxiliary covariates as U*, SC*, and CC* and only necessary auxiliary covariates as U, SC, and CC. Results based on 1000 simulated datasets with sample size 200, 500, 20 000, and 100 000. Monte Carlo standard errors are in parentheses

Size	Parameter	U*	SC*	CC*	U	SC	CC
200	Bias β0	−0.026(0.004)	−0.001(0.004)	−0.003(0.004)	−0.001(0.004)	0.001(0.004)	0.003(0.004)
	Bias β1	0.021(0.002)	−0.001(0.002)	0.002(0.002)	−0.012(0.003)	−0.001(0.003)	−0.002(0.002)
	Bias β2	−0.005(0.008)	0.001(0.008)	−0.006(0.007)	0.003(0.008)	0.001(0.008)	−0.001(0.008)
	103 *MSE β0	14.8(0.66)	14.4(0.64)	14.1(0.64)	14.7(0.66)	14.1(0.64)	14.1(0.64)
	103 *MSE β1	6.1(0.28)	5.9(0.27)	5.5(0.25)	6.9(0.33)	5.9(0.23)	5.4(0.21)
	103 *MSE β2	59.8(2.7)	59.8(2.6)	54.8(2.4)	65.0(2.8)	55.7(2.7)	53.2(2.4)
500	Bias β0	−0.023(0.002)	0.001(0.002)	0.001(0.002)	0.003(0.002)	0.001(0.002)	0.001(0.002)
	Bias β1	0.024(0.001)	0.003(0.002)	0.004(0.001)	−0.011(0.002)	−0.003(0.002)	−0.002(0.002)
	Bias β2	−0.013(0.005)	−0.001(0.005)	−0.001(0.004)	0.001(0.005)	−0.001(0.005)	−0.001(0.005)
	103 *MSE β0	6.0(0.27)	5.6(0.26)	5.2(0.24)	5.6(0.25)	5.7(0.26)	5.7(0.25)
	103 *MSE β1	2.7(0.13)	2.7(0.12)	2.6(0.12)	2.6(0.12)	2.3(0.10)	2.1(0.09)
	103 *MSE β2	21.0(0.98)	23.1(1.1)	21.8(0.99)	23.0(1.1)	21.4(0.97)	18.3(0.88)
20 000	Bias β0	−0.024(0.00)	0.00(0.00)	−0.001(0.00)	0.002(0.00)	0.00(0.00)	0.00(0.00)
	Bias β1	0.021(0.00)	0.00(0.00)	0.001(0.00)	−0.013(0.00)	−0.001(0.00)	−0.001(0.00)
	Bias β2	−0.006(0.001)	−0.001(0.001)	−0.002(0.001)	0.004(0.001)	0.001(0.001)	0.001(0.001)
	103 *MSE β0	0.70(0.02)	0.18(0.01)	0.21(0.02)	0.15(0.01)	0.15(0.01)	0.12(0.01)
	103 *MSE β1	0.48(0.01)	0.14(0.01)	0.11(0.01)	0.30(0.01)	0.06(0.00)	0.05(0.00)
	103 *MSE β2	0.59(0.03)	0.63(0.03)	0.65(0.03)	0.54(0.03)	0.42(0.02)	0.62(0.03)
100 000	Bias β0	−0.024(0.00)	0.00(0.00)	0.00(0.00)	0.002(0.00)	0.00(0.00)	0.00(0.00)
	Bias β1	0.021(0.00)	0.00(0.00)	0.00(0.00)	−0.013(0.00)	0.00(0.00)	0.00(0.00)
	Bias β2	−0.005(0.00)	0.001(0.00)	0.00(0.00)	0.005(0.00)	0.001(0.00)	0.00(0.00)
	103 *MSE β0	0.59(0.01)	0.06(0.00)	0.09(0.01)	0.03(0.00)	0.02(0.00)	0.03(0.00)
	103 *MSE β1	0.43(0.00)	0.19(0.00)	0.27(0.00)	0.26(0.01)	0.01(0.00)	0.01(0.00)
	103 *MSE β2	0.13(0.01)	0.15(0.01)	0.14(0.01)	0.10(0.00)	0.11(0.01)	0.07(0.00)

Abbreviations: MBC, model-based compatibility; MSE, mean squared error.