Table 3.
SCCmec markers and resistance genes a.
| Clonal Complex | Strain | Number | mecA | Delta mecR | ccrA-2 | ccrB-2 | ccrAA | ccrC | blaZ/I/R | erm(C) | lnu(A) | msr(A) | mpB(C) | aacA-aphD | aphA3+sat | dfrA |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CC06 | CC6-MRSA-IV | 1 | POS | POS | POS | POS | NEG | NEG | NEG | POS | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| CC22 | CC22-MRSA-IV (PVL+/tst+) | 5 | POS | POS | POS | POS | NEG | NEG | POS | VAR b | NEG | NEG | NEG | POS | NEG | POS |
| CC772 | CC772-MRSA-V(PVL+), “Bengal Bay “ | 1 | POS | NEG | NEG | NEG | POS | POS | POS | NEG | NEG | POS | POS | POS | POS | NEG |
| CC15 | CC15-MSSA | 1 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | POS | POS | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| CC96 | CC96-MSSA | 1 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | POS | NEG | NEG | NEG | NEG |
| CC2990 | CC2990-MSSA | 1 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 01 | ST(4-13-1-105-11-5-x)-MSSA | 2 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 02 | ST(1-421-1-1-12-238-11)-MSSA | 2 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 03 | ST(1-3-1-15-28-x-1)-MSSA | 4 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 04 | MSSA | 1 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 05 | ST(1-1-1-1-28-4-11)-MSSA | 2 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 06 | ST(1-421-1-x-x-1-11)-MSSA | 1 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 07 | ST(12-x-1-66-11-x-x)-MSSA | 3 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 08 | ST(1-38-1-1-x-238-x)-MSSA | 2 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 09 | MSSA | 1 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 10 | ST(3-3-1-66-28-x-x)-MSSA | 2 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 11 | MSSA | 1 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 12 | ST(4-421-1-105-1-5-x)-MSSA | 1 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 13 | ST(1-3-1-x-1-1-11)-MSSA | 2 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 14 | ST(3-38-1-15-1-x-40)-MSSA | 1 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 15 | ST(1-421-1-1-12-1-11)-MSSA | 2 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 16 | ST(3-3-1-66-4-1-x)-MSSA | 2 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
| UNKNOWN 17 | MSSA | 1 | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG | NEG |
a The table shows only genes that were found at least once in this study. Genes that were not present in any of the study strains are other ccrA/B genes, mecR, mecI, kdp-operon genes, heavy metal resistance genes, mecC, blaZ SCCmec XI, erm(A), erm(B), lnu(A), mef(A), vat(A), vat(B), vga(A), vga(A), vgb(A), far1, fusC, mupR, tet(K), tet(M), cat, cfr, fexA, qacA, qacC, vanA, vanB, and vanZ. b Variable, present in four out of five isolates.