Skip to main content
. 2020 Sep 29;10(10):1764. doi: 10.3390/ani10101764

Table 2.

Microbial community members with occurrences of at least 0.5% in rectal swabs of pigs fed a normal diet and a diet supplemented with coconut oil and the significance of changes between groups during feeding.

Taxonomic Rank Relative Abundance (%) p-Value
Phyllum Class Order Family Genus OTU Normal diet
Before treatment		 Normal diet
After treatment		 Oil supp. group
Before treatment		 Oil supp. group
After treatment		 In-time change in Normal diet group In-time change in Oil supp. group Difference Normal-Oil Before treatment Difference Normal-Oil After treatment
Actinobacteria 0.87 2.60 1.33 1.85 0.020 0.232 0.315 0.356
Actinobacteria 0.87 2.60 1.33 1.85 0.020 0.232 0.315 0.356
Actinomycetales 0.42 0.79 0.52 0.21 0.098 0.193 0.842 0.006
Corynebacteriaceae 0.41 0.77 0.51 0.20 0.098 0.160 0.780 0.006
Corynebacterium 0.41 0.77 0.51 0.20 0.098 0.160 0.780 0.006
Coriobacteriales 0.45 1.79 0.79 1.42 0.004 0.002 0.315 0.780
Coriobacteriaceae 0.45 1.79 0.79 1.42 0.004 0.002 0.315 0.780
Enterorhabdus 0.03 0.36 0.12 0.53 0.012 0.004 0.010 0.211
OTU053 0.03 0.36 0.12 0.52 0.012 0.006 0.006 0.243
Olsenella 0.31 1.15 0.52 0.45 0.203 0.695 0.842 0.211
OTU067 0.05 0.61 0.05 0.07 0.039 0.944 0.773 0.015
Bacteroidetes 49.53 30.31 34.96 29.49 0.008 0.492 0.013 0.905
Bacteroidia 49.46 30.28 34.96 29.48 0.008 0.492 0.013 0.905
Bacteroidales 49.46 30.28 34.96 29.48 0.008 0.492 0.013 0.905
Porphyromonadaceae 0.42 1.13 0.49 1.10 0.020 0.037 0.905 0.905
Barnesiella 0.35 0.93 0.38 0.90 0.098 0.037 0.842 0.905
OTU022 0.29 0.85 0.29 0.60 0.098 0.049 0.720 0.604
Prevotellaceae 48.98 29.00 34.44 28.22 0.008 0.432 0.017 1.000
Alloprevotella 1.14 0.18 0.35 1.04 0.012 0.037 0.182 0.001
OTU033 1.01 0.12 0.16 0.34 0.012 0.131 0.030 0.133
OTU066 0.05 0.05 0.09 0.59 0.834 0.084 0.189 0.008
Prevotella 47.80 28.77 34.05 27.12 0.008 0.322 0.017 0.842
OTU002 12.16 3.29 8.62 5.11 0.004 0.275 0.243 0.315
OTU003 7.54 6.48 5.52 6.23 0.496 0.922 0.113 0.780
OTU004 4.25 3.74 3.38 2.47 0.910 0.432 0.243 0.278
OTU006 3.31 2.10 2.66 2.61 0.164 0.625 0.400 0.842
OTU008 3.06 0.44 2.40 0.03 0.129 0.002 0.968 0.013
OTU009 2.29 1.15 0.78 1.24 0.652 0.432 0.004 0.905
OTU010 1.08 2.81 0.68 0.61 0.129 0.922 0.133 0.053
OTU012 1.73 0.64 1.32 1.18 0.027 1.000 0.278 0.028
OTU015 0.98 0.80 1.00 1.10 0.496 0.846 0.720 0.604
OTU016 0.88 1.19 1.13 0.34 0.426 0.557 0.968 0.065
OTU017 2.67 0.01 0.58 0.05 0.107 0.193 0.837 0.263
OTU023 0.80 0.61 0.54 0.34 0.820 0.906 0.487 0.243
OTU024 0.73 0.67 0.48 0.33 0.820 0.322 0.079 0.079
OTU026 0.77 0.26 0.36 0.40 0.055 1.000 0.053 0.780
OTU027 1.11 0.12 0.40 0.15 0.008 0.049 0.053 0.967
OTU030 0.55 0.25 0.41 0.38 0.004 0.625 0.356 0.356
OTU031 0.31 0.72 0.06 0.23 0.496 0.084 0.165 0.356
OTU037 0.06 0.07 0.10 0.81 0.353 0.037 0.539 0.006
OTU039 0.52 0.09 0.22 0.12 0.008 0.160 0.156 0.400
OTU041 0.25 0.54 0.12 0.02 0.834 0.294 0.838 0.072
OTU045 0.00 0.00 0.35 0.58 0.201 0.813 0.007 0.256
Firmicutes 48.86 64.46 62.71 66.03 0.027 0.625 0.013 0.780
Bacilli 1.61 2.55 1.22 3.17 0.098 0.064 0.661 0.780
Lactobacillales 1.61 2.55 1.22 3.17 0.098 0.064 0.661 0.780
Lactobacillaceae 1.60 2.52 1.16 3.10 0.098 0.049 0.720 0.604
Lactobacillus 1.60 2.52 1.16 3.10 0.098 0.049 0.720 0.604
OTU013 0.71 0.75 0.63 1.58 0.734 0.027 0.968 0.035
OTU014 0.44 1.03 0.21 1.28 0.129 0.432 0.905 0.004
OTU025 0.43 0.70 0.26 0.15 0.129 0.105 0.720 0.010
Clostridia 1.16 1.57 2.29 1.94 0.570 0.846 0.497 0.497
Clostridiales 1.16 1.57 2.29 1.94 0.570 0.846 0.497 0.497
Lachnospiraceae 0.52 0.71 0.88 0.51 0.496 0.131 0.400 0.604
Ruminococcaceae 0.49 0.67 1.00 0.98 0.250 0.922 0.315 0.133
Negativicutes 46.00 60.15 59.03 60.85 0.039 0.922 0.053 0.968
Selenomonadales 46.00 60.15 59.03 60.85 0.039 0.922 0.053 0.968
Acidaminococcaceae 0.38 0.59 1.21 1.33 0.164 0.846 0.278 0.356
Phascolarctobacterium 0.21 0.28 0.86 1.20 0.496 0.695 0.356 0.113
OTU021 0.21 0.28 0.86 1.20 0.496 0.695 0.356 0.113
Veillonellaceae 45.62 59.56 57.83 59.51 0.039 0.922 0.053 0.968
Dialister 1.85 3.34 2.62 1.99 0.203 0.432 0.780 0.243
OTU005 1.79 3.21 2.48 1.83 0.203 0.432 0.842 0.211
Megasphaera 37.27 52.80 50.08 55.24 0.027 0.375 0.182 0.780
OTU001 35.28 50.88 47.74 53.03 0.027 0.322 0.182 0.780
OTU020 0.54 0.26 0.65 0.59 0.098 0.492 0.842 0.156
Mitsuokella 1.78 1.93 1.26 0.62 0.820 0.004 0.095 0.028
OTU018 0.88 0.59 0.49 0.13 0.129 0.002 0.079 0.095
OTU019 0.60 0.66 0.46 0.29 0.910 0.037 0.243 0.035
OTU029 0.18 0.62 0.13 0.17 0.250 0.846 0.278 0.013
Propionispira 1.58 0.45 1.39 0.86 0.020 0.131 1.000 0.156
OTU007 1.57 0.45 1.38 0.85 0.020 0.131 1.000 0.156
Selenomonas 2.96 0.95 2.26 0.53 0.004 0.010 0.315 0.243
OTU011 2.33 0.42 1.54 0.30 0.004 0.027 0.243 0.447
Proteobacteria 0.60 2.21 0.82 2.42 0.004 0.275 0.447 0.211
Deltaproteobacteria 0.14 0.63 0.43 0.90 0.020 0.193 0.133 0.549
Bdellovibrionales 0.12 0.43 0.41 0.84 0.055 0.275 0.035 0.497
Bdellovibrionaceae 0.12 0.43 0.41 0.84 0.055 0.275 0.035 0.497
Vampirovibrio 0.12 0.43 0.41 0.84 0.055 0.275 0.035 0.497
Epsilonproteobacteria 0.05 0.66 0.10 0.44 0.012 0.275 0.437 0.182
Campylobacterales 0.05 0.66 0.10 0.44 0.012 0.275 0.437 0.182
Campylobacteraceae 0.05 0.66 0.10 0.41 0.012 0.275 0.437 0.182
Campylobacter 0.05 0.66 0.10 0.41 0.012 0.275 0.437 0.182
OTU050 0.05 0.52 0.10 0.41 0.164 0.275 0.437 1.000
Gammaproteobacteria 0.40 0.91 0.28 1.07 0.055 0.922 0.549 0.079
Enterobacteriales 0.09 0.21 0.02 0.74 0.426 1.000 0.966 0.066
Enterobacteriaceae 0.09 0.21 0.02 0.74 0.426 1.000 0.966 0.066
Escherichia/Shigella 0.00 0.12 0.02 0.74 0.036 0.726 0.131 0.537
OTU028 0.00 0.12 0.02 0.74 0.036 0.726 0.131 0.537
Gammaproteobacteria 0.40 0.91 0.28 1.07 0.055 0.922 0.549 0.079
Pseudomonadales 0.20 0.50 0.12 0.02 0.426 0.037 0.182 0.003
Moraxellaceae 0.20 0.50 0.12 0.02 0.426 0.037 0.182 0.003
Psychrobacter 0.20 0.50 0.12 0.02 0.426 0.027 0.182 0.002
OTU043 0.20 0.50 0.12 0.02 0.426 0.027 0.182 0.002