TABLE 3.

Multi-omics datasets across different TCGA cohorts.

Cohort	Clinical	SNV	CNV	Methylation	mRNA-seq	miRSeq	RPPA	Proteome	Phospho-proteome	Glyco-proteome
ACC	92	92	92	80	80	80	46
BLCA	412	412	412	412	412	409	344
BRCA	1097	1044	1098	1095	1097	1078	887	233	233
CESC	307	305	302	307	307	307	173
CHOL	45	51	36	36	36	36	30
COAD	458	433	460	458	459	406	360	164	101
COADREAD	629					549	491
DLBC	48	37	50	48	48	47	33
ESCA	185	184	185	185	184	184	126
GBM	595	396	599	423	166	0	238	100	100
GBMLGG	1110					512	668
HNSC	528	510	526	528	528	523	212
KICH	113	66	66	66	66	66	63
KIPAN	941					873	756
KIRC	537	339	534	533	534	516	478	110	110
KIRP	291	288	290	291	291	291	215
LAML	200	149	200	140	188	188	0
LGG	515	513	515	516	516	512	430
LIHC	377	375	376	377	376	372	63
LUAD	522	569	518	579	519	513	365	111	111
LUSC	504	497	504	503	504	478	328
MESO	87	83	87	87	87	87	63
OV	591	443	597	602	492	453	426	283	162	122
PAAD	185	183	185	184	178	178	123
PCPG	179	179	179	179	179	179	80
PRAD	499	498	498	498	498	494	352
READ	171	158	167	165	167	143	131	30
SARC	261	255	261	261	261	259	223
SKCM	470	470	470	470	469	448	353
STAD	443	441	443	443	439	436	357
STES	628					620	483
TGCT	134	150	150	150	150	150	118
THCA	503	496	505	507	507	502	222
THYM	124	123	124	124	124	124	90
UCEC	548	542	558	559	559	538	440	104	104
UCS	57	57	57	57	57	56	48
UVM	80	80	80	80	80	80	12
Total	11196	10418	11124	10943	10558	10156	7429	1135	921	122