Table 1.

Oligonucleotide primers for methylation‐specific PCR, bisulfite sequencing, and real‐time RT‐PCR

Gene symbol	Status	Forward primer (5′–3′)	Reverse primer (5′–3′)	Annealing temp. (°C)
Fosb	M	tagagttggagtcggagatcgtc	gaccaacgaacctaaccccg	60
	U	tagagttggagttggagattg	ccaaaaccatcttccttaaca	60
	BS	ttgttgggatttattaggaaattga	aaacttaaacttcactatatataaaaaaaa	52
	RT	gtgcgagcttccttgttttc	gtctccaacagccagaggag	60
Btd	M	aagttttagcgttaaatatatc	aacaaactcgatatttacctcg	56
	U	gaattgtgtttaaaatttagttgt	aaaacaaactcaatatttacctca	56
	BS	agggagagagttttttatggttgtt	aactaaacttcaaaacatttccaaaac	56
Mab21l2	M	atatgtttcgttttcgtttatc	ataatctcgcccaccgaattcg	60
	U	agatatgttttgtttttgtttatt	aaataatctcacccaccaaattca	60
	BS	tttgggttattagtgtttgg	caaactaatttaccaactcaataaa	52
Fam43a	M	agatgaagttgatcgtgagtgc	ctcataccgatatacccaaacg	56
	U	ttaaagtttttgtttgggtatatt	aaacatttaaactctaccaaaaca	56
Hspa2	M	agagtattaatttcgacgaggc	cataacaccgccaactatttcg	56
	U	taagagtattaattttgatgaggt	atcataacaccaccaactatttca	56
Il1r1	M	ttcggttgttttcggtttgaac	ttctcctacctaaacgtacccg	56
	U	gttttggttgtttttggtttgaat	ttttctcctacctaaacataccca	56
Cyp26a1	M	tgcggagtcggagtaggggaac	actctataacctaaaaccgacg	56
	U	gttggagtaggggaatgtaagttt	aacctaaaaccaacaaatcttaaca	56
Adam11	M	tattgggaggcgttcgagtttc	taaataaaaaacgtcgcttacg	52
	U	gttattgggaggtgtttgagtttt	aataaataaaaaacatcacttaca	56
B4galt6	M	attagagagcgattggagattc	ttaaaacctaaaccgtaacccg	56
	U	taattagagagtgattggagattt	atttaaaacctaaaccataaccca	56
Cdh8	M	gtggagtttggtgcggggatgc	ataaacctaaacgtcaacaccg	60
	U	ttgtggagtttggtgtggggatgt	acataaacctaaacatcaacacca	60
Tram1l1	M	ttttgattgatcggtcggtagc	aattcctaacgttcttcttacg	52
	U	gtttttgattgattggttggtagt	aaaattcctaacattcttcttaca	52
18S rRNA	RT	taccacatccaaggaaggcag	tgccctccaatggatcctc	64

BS, primers for bisulfite sequencing; M, primers specific to methylated DNA; RT, primers for real‐time RT‐PCR; temp., temperature; U, primers specific to unmethylated DNA.