Table 1.
Oligonucleotide primers and PCR conditions used in this study
| Primer name | Sequence (5′-3′) | Size (bp) | PCR condition |
|---|---|---|---|
|
rPLU5 rPLU6 |
cctgttgttgccttaaacttc ttaaaattgttgcagttaaaacg |
1100 | 95 °C × 3 min, 35 cycles (94 °C × 60 s, 60 °C × 90 s, 72 °C × 90 s), 72 °C × 10 min |
|
rFAL1 rFAL2 |
ttaaactggtttgggaaaaccaaatatatt acacaatgaactcaatcatgactacccgtc |
205 | 95 °C × 3 min, 35 cycles (94 °C × 60 s, 55 °C × 90 s, 72 °C × 90 s), 72 °C × 10 min |
|
rVIV2 rVIV1 |
cgcttctagcttaatccacataactgatac acttccaagccgaagcaaagaaagtcctt |
120 | 95 °C × 3 min, 35 cycles (94 °C × 60 s, 55 °C × 90 s, 72 °C × 90 s), 72 °C × 10 min |
|
K13 PCR F K13 PCR R |
gggaatctggtggtaacagc cggagtgaccaaatctggga |
2097 | 95 °C × 10 min, 35 cycles (94 °C × 60 s, 55 °C × 90 s, 72 °C × 90 s), 72 °C × 10 min |
|
K13 Nested F K13 Nested R |
gccttgttgaaagaagcaga gccaagctgccattcatttg |
849 | 95 °C × 5 min, 35 cycles (94 °C × 60 s, 60 °C × 90 s, 72 °C × 90 s), 72 °C × 10 min |