Table 1. MB concentration and species composition of bacteria in the gut microbiome.
Phylum | Family | Genus | Species | Control Median (Q1, Q3) | MB 15 Median (Q1, Q3) | MB 50 Median (Q1, Q3) |
---|---|---|---|---|---|---|
Bacteroidetes | Muribaculaceae | Muribaculum | intestinale | 0,0492 (0,0447, 0,1107) | 0,3198 (0,0447, 0,3198) | 0,0860 (0,0564, 0,0919) |
Bacteroidetes | Bacteroidaceae | Bacteroides | acidifaciens | 0,0549 (0,0163, 0,1194) | 0,0000 (0,0000, 0,0163) | 0,0459 (0,0284, 0,0539) |
Bacteroidetes | Bacteroidaceae | Bacteroides | coprocola | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) |
Bacteroidetes | Bacteroidaceae | Bacteroides | caecimuris | 0,0030 (0,0016, 0,0054) | 0,0021 (0,0004, 0,0026) | 0,0090 (0,0077, 0,0115) |
Bacteroidetes | Bacteroidaceae | Bacteroides | uniformis | 0,0008 (0,0005, 0,0015) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0089 (0,0064, 0,0132) |
Bacteroidetes | Bacteroidaceae | Bacteroides | massiliensis | 0,0005 (0,0003, 0,0011) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0011 (0,0005, 0,0015) |
Bacteroidetes | Tannerellaceae | Parabacteroides | goldsteinii | 0,0008 (0,0003, 0,0027) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0036 (0,0025, 0,0043) |
Bacteroidetes | Tannerellaceae | Parabacteroides | johnsonii | 0,0001 (0,0000, 0,0011) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0016 (0,0013, 0,0022) |
Bacteroidetes | Rikenellaceae | Alistipes | obesi | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0042 (0,0032, 0,0105) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) |
Bacteroidetes | Rikenellaceae | Alistipes | ihumii | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0026 (0,0021, 0,0051) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) |
Bacteroidetes | Rikenellaceae | Alistipes | putredinis | 0,0071 (0,0051, 0,0205) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0204 (0,0152, 0,0205) |
Bacteroidetes | Rikenellaceae | Alistipes | senegalensis | 0,0016 (0,0015, 0,0090) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0100 (0,0089, 0,0139) |
Bacteroidetes | Rikenellaceae | Rikenella | microfusus | 0,0008 (0,0001, 0,0012) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0005 (0,0001, 0,0029) |
Firmicutes | Lachnospiraceae | Lachnospiraceae_NK4A136_group | bacterium | 0,1908 (0,0997, 0,5423) | 0,1143 (0,0968, 0,3198) | 0,1320 (0,0969, 0,1853) |
Firmicutes | Lachnospiraceae | Lachnospiraceae_UCG-006 | bacterium | 0,0023 (0,0020, 0,0048) | 0,0051 (0,0000, 0,0063) | 0,0068 (0,0051, 0,0310) |
Firmicutes | Lactobacillaceae | Lactobacillus | murinus | 0,2348 (0,1450, 0,4929) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,1287 (0,1015, 0,1762) |
Firmicutes | Lactobacillaceae | Lactobacillus | coleohominis | 0,0167 (0,0073, 0,0302) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0333 (0,0266, 0,0437) |
Firmicutes | Streptococcaceae | Streptococcus | danieliae | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0064 (0,0000, 0,0254) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) |
Firmicutes | Streptococcaceae | Streptococcus | ferus | 0,0002 (0,0000, 0,0015) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0007 (0,0004, 0,0012) |
Firmicutes | Streptococcaceae | Streptococcus | acidominimus | 0,0000 (0,0000, 0,0005) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0003 (0,0000, 0,0013) |
Firmicutes | Erysipelotrichaceae | Ileibacterium | valens | 0,0103 (0,0055, 0,0208) | 0,0026 (0,0000, 0,0051) | 0,0527 (0,0281, 0,0679) |
Firmicutes | Erysipelotrichaceae | Dubosiella | newyorkensis | 0,0060 (0,0028, 0,0093) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0268 (0,0212, 0,0348) |
Firmicutes | Lachnospiraceae | Acetatifactor | muris | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) |
Firmicutes | Erysipelotrichaceae | Erysipelatoclostridium | ramosum | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0063 (0,0000, 0,0064) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) |
Firmicutes | Ruminococcaceae | Intestinimonas | massiliensis | 0,0035 (0,0019, 0,0037) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0076 (0,0049, 0,0324) |
Firmicutes | Erysipelotrichaceae | Faecalibaculum | rodentium | 0,0025 (0,0014, 0,0047) | 0,0000 (0,0000, 0,0051) | 0,0014 (0,0006, 0,0016) |
Actinobacteria | Bifidobacteriaceae | Bifidobacterium | animalis | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0318 (0,0051, 0,0323) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) |
Actinobacteria | Bifidobacteriaceae | Bifidobacterium | pseudolongum | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) |
Actinobacteria | Propionibacteriaceae | Cutibacterium | acnes | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) |
Actinobacteria | Eggerthellaceae | Enterorhabdus | caecimuris | 0,0010 (0,0004, 0,0012) | 0,0106 (0,0000, 0,0132) | 0,0014 (0,0010, 0,0020) |
Actinobacteria | Corynebacteriaceae | Corynebacterium_1 | stationis | 0,0005 (0,0000, 0,0040) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0005 (0,0001, 0,0008) |
Proteobacteria | Pasteurellaceae | Rodentibacter | pneumotropicus | 0,0000 (0,0000, 0,0002) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0015 (0,0006, 0,0016) |
Proteobacteria | Sutterellaceae | Parasutterella | excrementihominis | 0,0016 (0,0005, 0,0024) | 0,0211 (0,0152, 0,0323) | 0,0054 (0,0018, 0,0152) |
Proteobacteria | Moraxellaceae | Enhydrobacter | aerosaccus | 0,0000 (0,0000, 0,0002) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) |
Proteobacteria | Oxalobacteraceae | Massilia | aurea | 0,0000 (0,0000, 0,0003) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) |
Proteobacteria | Sutterellaceae | Sutterella | wadsworthensis | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) |
Proteobacteria | Neisseriaceae | Snodgrassella | alvi | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0032 (0,0000, 0,0042) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) |
Epsilonbacteraeota | Helicobacteraceae | Helicobacter | apodemus | 0,0693 (0,0294, 0,0974) | 0,1907 (0,1613, 0,2763) | 0,2622 (0,1451, 0,4093) |
Epsilonbacteraeota | Helicobacteraceae | Helicobacter | ganmani | 0,0042 (0,0027, 0,0055) | 0,0000 (0,0000, 0,0102) | 0,0084 (0,0052, 0,0134) |
Epsilonbacteraeota | Helicobacteraceae | Helicobacter | mastomyrinus | 0,0040 (0,0027, 0,0065) | 0,0000 (0,0000, 0,0000) | 0,0099 (0,0058, 0,0128) |
Deferribacteres | Deferribacteraceae | Mucispirillum | schaedleri | 0,0084 (0,0048, 0,0110) | 0,0297 (0,0152, 0,0645) | 0,0314 (0,0294, 0,0508) |