Skip to main content
. 2020 Nov 18;15(11):e0241784. doi: 10.1371/journal.pone.0241784

Table 1. MB concentration and species composition of bacteria in the gut microbiome.

Phylum Family Genus Species Control Median (Q1, Q3) MB 15 Median (Q1, Q3) MB 50 Median (Q1, Q3)
Bacteroidetes Muribaculaceae Muribaculum intestinale 0,0492 (0,0447, 0,1107) 0,3198 (0,0447, 0,3198) 0,0860 (0,0564, 0,0919)
Bacteroidetes Bacteroidaceae Bacteroides acidifaciens 0,0549 (0,0163, 0,1194) 0,0000 (0,0000, 0,0163) 0,0459 (0,0284, 0,0539)
Bacteroidetes Bacteroidaceae Bacteroides coprocola 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0000 (0,0000, 0,0000)
Bacteroidetes Bacteroidaceae Bacteroides caecimuris 0,0030 (0,0016, 0,0054) 0,0021 (0,0004, 0,0026) 0,0090 (0,0077, 0,0115)
Bacteroidetes Bacteroidaceae Bacteroides uniformis 0,0008 (0,0005, 0,0015) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0089 (0,0064, 0,0132)
Bacteroidetes Bacteroidaceae Bacteroides massiliensis 0,0005 (0,0003, 0,0011) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0011 (0,0005, 0,0015)
Bacteroidetes Tannerellaceae Parabacteroides goldsteinii 0,0008 (0,0003, 0,0027) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0036 (0,0025, 0,0043)
Bacteroidetes Tannerellaceae Parabacteroides johnsonii 0,0001 (0,0000, 0,0011) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0016 (0,0013, 0,0022)
Bacteroidetes Rikenellaceae Alistipes obesi 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0042 (0,0032, 0,0105) 0,0000 (0,0000, 0,0000)
Bacteroidetes Rikenellaceae Alistipes ihumii 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0026 (0,0021, 0,0051) 0,0000 (0,0000, 0,0000)
Bacteroidetes Rikenellaceae Alistipes putredinis 0,0071 (0,0051, 0,0205) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0204 (0,0152, 0,0205)
Bacteroidetes Rikenellaceae Alistipes senegalensis 0,0016 (0,0015, 0,0090) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0100 (0,0089, 0,0139)
Bacteroidetes Rikenellaceae Rikenella microfusus 0,0008 (0,0001, 0,0012) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0005 (0,0001, 0,0029)
Firmicutes Lachnospiraceae Lachnospiraceae_NK4A136_group bacterium 0,1908 (0,0997, 0,5423) 0,1143 (0,0968, 0,3198) 0,1320 (0,0969, 0,1853)
Firmicutes Lachnospiraceae Lachnospiraceae_UCG-006 bacterium 0,0023 (0,0020, 0,0048) 0,0051 (0,0000, 0,0063) 0,0068 (0,0051, 0,0310)
Firmicutes Lactobacillaceae Lactobacillus murinus 0,2348 (0,1450, 0,4929) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,1287 (0,1015, 0,1762)
Firmicutes Lactobacillaceae Lactobacillus coleohominis 0,0167 (0,0073, 0,0302) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0333 (0,0266, 0,0437)
Firmicutes Streptococcaceae Streptococcus danieliae 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0064 (0,0000, 0,0254) 0,0000 (0,0000, 0,0000)
Firmicutes Streptococcaceae Streptococcus ferus 0,0002 (0,0000, 0,0015) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0007 (0,0004, 0,0012)
Firmicutes Streptococcaceae Streptococcus acidominimus 0,0000 (0,0000, 0,0005) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0003 (0,0000, 0,0013)
Firmicutes Erysipelotrichaceae Ileibacterium valens 0,0103 (0,0055, 0,0208) 0,0026 (0,0000, 0,0051) 0,0527 (0,0281, 0,0679)
Firmicutes Erysipelotrichaceae Dubosiella newyorkensis 0,0060 (0,0028, 0,0093) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0268 (0,0212, 0,0348)
Firmicutes Lachnospiraceae Acetatifactor muris 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0000 (0,0000, 0,0000)
Firmicutes Erysipelotrichaceae Erysipelatoclostridium ramosum 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0063 (0,0000, 0,0064) 0,0000 (0,0000, 0,0000)
Firmicutes Ruminococcaceae Intestinimonas massiliensis 0,0035 (0,0019, 0,0037) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0076 (0,0049, 0,0324)
Firmicutes Erysipelotrichaceae Faecalibaculum rodentium 0,0025 (0,0014, 0,0047) 0,0000 (0,0000, 0,0051) 0,0014 (0,0006, 0,0016)
Actinobacteria Bifidobacteriaceae Bifidobacterium animalis 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0318 (0,0051, 0,0323) 0,0000 (0,0000, 0,0000)
Actinobacteria Bifidobacteriaceae Bifidobacterium pseudolongum 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0000 (0,0000, 0,0000)
Actinobacteria Propionibacteriaceae Cutibacterium acnes 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0000 (0,0000, 0,0000)
Actinobacteria Eggerthellaceae Enterorhabdus caecimuris 0,0010 (0,0004, 0,0012) 0,0106 (0,0000, 0,0132) 0,0014 (0,0010, 0,0020)
Actinobacteria Corynebacteriaceae Corynebacterium_1 stationis 0,0005 (0,0000, 0,0040) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0005 (0,0001, 0,0008)
Proteobacteria Pasteurellaceae Rodentibacter pneumotropicus 0,0000 (0,0000, 0,0002) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0015 (0,0006, 0,0016)
Proteobacteria Sutterellaceae Parasutterella excrementihominis 0,0016 (0,0005, 0,0024) 0,0211 (0,0152, 0,0323) 0,0054 (0,0018, 0,0152)
Proteobacteria Moraxellaceae Enhydrobacter aerosaccus 0,0000 (0,0000, 0,0002) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0000 (0,0000, 0,0000)
Proteobacteria Oxalobacteraceae Massilia aurea 0,0000 (0,0000, 0,0003) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0000 (0,0000, 0,0000)
Proteobacteria Sutterellaceae Sutterella wadsworthensis 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0000 (0,0000, 0,0000)
Proteobacteria Neisseriaceae Snodgrassella alvi 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0032 (0,0000, 0,0042) 0,0000 (0,0000, 0,0000)
Epsilonbacteraeota Helicobacteraceae Helicobacter apodemus 0,0693 (0,0294, 0,0974) 0,1907 (0,1613, 0,2763) 0,2622 (0,1451, 0,4093)
Epsilonbacteraeota Helicobacteraceae Helicobacter ganmani 0,0042 (0,0027, 0,0055) 0,0000 (0,0000, 0,0102) 0,0084 (0,0052, 0,0134)
Epsilonbacteraeota Helicobacteraceae Helicobacter mastomyrinus 0,0040 (0,0027, 0,0065) 0,0000 (0,0000, 0,0000) 0,0099 (0,0058, 0,0128)
Deferribacteres Deferribacteraceae Mucispirillum schaedleri 0,0084 (0,0048, 0,0110) 0,0297 (0,0152, 0,0645) 0,0314 (0,0294, 0,0508)