TABLE 1.

Correlations between OTUB1 and gene markers of immune cells in GEPIA.

Cell types	Gene markers	LIHC				ESCA
		Tumor		Normal		Tumor		Normal
		P	R	P	R	P	R	P	R
Naïve T-cell	CCR7	0.0024	0.16	1.5e-07	0.66	8.1e-05	–0.29	0.053	0.55
	LEF1	7.7e-11	0.33	0.00037	0.48	0.94	0.0054	0.0069	0.73
	TCF7	8e-05	0.2	5.6e-05	0.54	0.52	0.048	0.078	0.51
	SELL	1.7e-06	0.25	4.6e-05	0.54	5.6e-05	–0.29	0.15	0.43
Effector T-cell	CX3CR1	1.6e-10	0.33	0.11	0.23	0.00097	–0.24	0.012	0.69
	FGFBP2	0.36	–0.048	0.0042	0.4	0.063	0.14	0.064	0.53
	FCGR3A	3.6e-05	0.21	0.003	0.41	0.46	–0.055	0.57	0.17
	CD8A	7e-04	0.18	1.2e-05	0.58	0.0021	–0.23	0.89	0.041
	CD8B	0.00068	0.18	2.2e-06	0.61	0.0012	–0.24	0.77	–0.091
Effector memory T-cell	PDCD1	5.2e-09	0.3	0.00038	0.48	0.051	–0.14	0.15	0.43
	DUSP4	5.3e-09	0.3	0.00013	0.52	0.0013	–0.24	0.32	–0.3
	GZMK	0.059	0.098	2.2e-06	0.61	1.4e-06	–0.35	0.62	0.15
	GZMA	0.05	0.1	6.1e-05	0.54	0.064	–0.14	0.35	0.28
	IFNG	0.00018	0.19	0.034	0.3	0.07	–0.13	0.86	–0.053
Resident memory T-cell	CD69	0.0013	0.17	0.00083	0.46	0.0019	–0.23	0.52	0.2
	ITGAE	5.8e-16	0.4	0.0044	0.4	0.00024	0.27	0.0033	0.77
	CXCR6	0.0064	0.14	3.3e-06	0.6	4e-05	–0.3	0.71	0.11
	MYADM	4.1e-16	0.41	0.014	0.34	0.044	–0.15	0.71	0.12
Central memory T-cell	CCR7	0.0024	0.16	1.5e-07	0.66	8.1e-05	–0.29	0.053	0.55
	SELL	1.7e-06	0.25	4.6e-05	0.54	5.6e-05	–0.29	0.15	0.43
	IL7R	0.03	0.11	3.3e-05	0.55	0.43	–0.058	0.5	0.21
Exhausted T-cell	HAVCR2	1.4e-08	0.29	0.00044	0.48	0.018	–0.17	0.11	0.47
	GZMB	0.08	0.091	9.2e-06	0.58	0.46	–0.055	0.18	0.4
	TIGIT	5.7e-06	0.23	0.00036	0.49	0.00067	–0.25	0.12	0.45
	LAG3	0.069	0.095	0.0022	0.42	0.46	–0.056	0.038	0.59
	PDCD1	5.2e-09	0.3	0.00038	0.48	0.051	–0.14	0.15	0.43
	CXCL13	0.032	0.11	0.2	0.18	0.013	–0.18	0.7	0.12
	LAYN	1.1e-10	0.33	0.00044	0.48	0.14	0.11	0.16	0.42
Resting Treg	FOXP3	0.42	0.042	0.019	0.33	0.0033	–0.22	0.054	0.54
	IL2RA	1.1e-07	0.27	0.038	0.29	0.072	–0.13	0.061	0.54
Effector Treg	CTLA4	9.1e-06	0.23	0.0022	0.42	0.014	–0.18	0.12	0.45
	CCR8	1.6e-07	0.27	0.035	0.3	0.00095	–0.24	0.072	0.51
	TNFRSF9	8.8e-10	0.31	0.0073	0.38	0.19	–0.099	0.11	0.46
Th1-like	CXCL13	0.032	0.11	0.2	0.18	0.013	–0.18	0.7	0.12
	HAVCR2	1.4e-08	0.29	0.00044	0.48	0.018	–0.17	0.11	0.47
	IFNG	0.00018	0.19	0.034	0.3	0.07	–0.13	0.86	–0.053
	CXCR3	1.1e-05	0.23	6.7e-05	0.53	3.4e-05	–0.3	0.28	0.32
	BHLHE40	0.005	0.15	0.58	–0.079	0.88	0.011	0.004	0.76
	CD4	0.00023	0.19	0.19	0.19	3e-04	–0.27	0.45	0.23
	TNF	8e-09	0.29	0.0029	0.41	0.085	0.13	0.0036	0.76
	Tbx21	0.057	0.099	3.7e-07	0.65	0.00019	–0.27	0.58	0.17
	STAT4	3.5e-05	0.21	0.0018	0.43	0.00038	–0.26	0.45	0.23
	STAT1	2.3e-17	0.42	1.4e-05	0.57	0.25	0.086	0.004	0.76
Natural killer cell	KIR2DL1	0.67	0.022	0.16	0.2	0.13	–0.11	0.32	0.3
	KIR2DL3	0.0032	0.15	0.072	0.26	0.093	–0.13	0.4	0.25
	KIR2DL4	0.0012	0.17	0.079	0.25	0.7	–0.029	0.92	–0.03
	KIR3DL1	0.61	–0.026	0.0027	0.42	0.0085	–0.19	0.76	0.096
	KIR3DL2	2e-04	0.19	0.76	–0.044	0.06	–0.14	0.089	–0.49
	KIR3DL3	0.024	0.12	0.44	0.11	0.75	–0.023	0.45	0.23
	KIR2DS4	0.2	0.066	0.87	0.024	0.32	–0.074	0.54	–0.19
Th17	STAT3	1.2e-06	0.25	0.73	0.049	0.4	0.063	0.0026	0.78
	IL17A	0.99	0.00059	0.35	0.13	0.41	–0.061	0.13	0.44
Th2	GATA3	6e-05	0.21	0.0079	0.37	0.039	–0.15	0.054	0.54
	STAT6	4.5e-05	0.21	3.2e-07	0.65	0.91	0.0089	0.0033	0.77
	STAT5A	4.4e-11	0.33	1.2e-10	0.76	0.16	–0.11	0.022	0.64
	IL13	0.11	0.082	0.041	0.29	0.039	–0.15	0.52	0.2
Dendritic cell	HLA-DPB1	7.6e-09	0.29	1.2e-08	0.7	0.00035	–0.26	0.093	0.49
	HLA-DQB1	0.00089	0.17	0.58	0.079	0.018	–0.17	0.089	0.49
	HLA-DRA	6.2e-08	0.28	4e-07	0.65	5e-04	–0.26	0.034	0.6
	HLA-DPA1	7.2e-07	0.25	2.4e-06	0.61	0.0012	–0.24	0.061	0.54
	CD1C	2.3e-07	0.27	0.0054	0.39	0.014	–0.18	0.061	0.54
	NRP1	7.5e-09	0.3	0.076	0.25	0.088	–0.13	0.46	0.22
	ITGAX	4.1e-09	0.3	0.0022	0.42	0.0015	–0.23	0.1	0.48
TAM	CCL2	2.8e-05	0.22	0.011	0.36	0.18	–0.099	0.14	0.43
	CD68	6.4e-07	0.26	3.8e-08	0.69	0.96	0.0036	0.0036	0.76
	IL10	0.00026	0.19	0.0016	0.44	0.36	–0.068	0.16	0.41
Monocyte	CD86	1.8e-09	0.31	1.7e-06	0.62	0.32	–0.075	0.14	0.43
	CD115	7.5e-10	0.31	3.7e-05	0.55	0.072	–0.13	0.25	–0.34
Neutrophil	CEACAM8	0.11	0.084	0.053	0.28	0.14	–0.11	0.32	0.3
	ITGAM	1.6e-12	0.36	8.3e-07	0.63	0.13	–0.11	0.33	0.29
	CCR7	0.0024	0.16	1.5e-07	0.66	8.1e-05	–0.29	0.053	0.55
B cell	CD19	0.00061	0.18	0.0034	0.41	0.00023	–0.27	0.093	0.49
	CD79A	0.0029	0.15	0.00078	0.46	2.5e-05	–0.31	0.91	–0.038
M1 macrophage	NOS2	0.33	0.05	0.00068	0.46	0.0057	–0.2	0.026	0.61
	IRF5	2.4e-14	0.38	4.2e-05	0.55	0.29	0.078	0.00044	0.85
	PTGS2	4.1e-05	0.21	0.083	0.25	0.056	0.14	0.05	0.56
M2 macrophage	CD163	0.52	0.034	0.00093	0.45	0.085	–0.13	0.85	0.06
	VSIG4	0.00011	0.2	0.00022	0.5	0.55	–0.044	0.72	–0.11
	MS4A4A	0.0031	0.15	1.2e-05	0.58	0.0018	–0.23	0.46	–0.23