Skip to main content
. 2020 Nov 13;10:559915. doi: 10.3389/fcimb.2020.559915

Table 3.

Analysis and grouping of the ankF gene in 52 C. burnetii strains.

Genome Group Strain AnkF group Accession # Sequence Reference
I RSA493 (NM-I) 1 AE016828 (Seshadri et al., 2003)
RSA315 (Turkey) 1 NOLO00000000 (Beare et al., 2017b)
RSA435 (Dyer) 1 NOLQ00000000 (Beare et al., 2017b)
RSA270 (Ohio314) 1 NOLT00000000 (Beare et al., 2017c)
RSA329 (California33) 1 NOLV00000000 (Beare et al., 2017c)
RSA350 (California16) 1 NOLU00000000 (Beare et al., 2017c)
RSA514 (NM-Crazy) 1 NOVG00000000 (Beare et al., 2018)
Cb_C2 1 CCAJ010000000 (Sidi-Boumedine et al., 2014)
(I) Cb175_Guyana 1 HG825990 (D’Amato et al., 2015)
IIa RSA331 (Henzerling) 1 CP000890, CP014559 (Beare et al., 2006; Kuley et al., 2017)
Heizberg 1 CP014561 (Kuley et al., 2017)
RSA461 (M44_Clone1) 1 NOVI00000000 (Beare et al., 2018)
Cb185 1 CBTH01000000 (Million et al., 2014)
IIb CbCVIC1 1 CP014549 (Kuley et al., 2017)
Z3055 1 LK937696 (D’Amato et al., 2014b)
NL-Limburg 1 JZWL01 (Hammerl et al., 2015)
NL3262 1 CP013667 (Kuley et al., 2016)
NLhu3345937 1 CP014354 (Kuley et al., 2016)
602 (14160-002) 1 CP014836 (Kuley et al., 2017)
42785537 1 CP014548 (Kuley et al., 2017)
EV-Cb_C13 1 CCAM010000000 (Sidi-Boumedine et al., 2014)
Q540 1 PPFP01000000 (Hemsley et al., 2019)
Cb_D2 (DSTL_2) 1 RQJT01000000 (Hemsley et al., 2019)
Cb_D8 (DSTL_8) 1 RQJS01000000 (Hemsley et al., 2019)
Cb_D10 (DSTL_10) 1 RQJR01000000 (Hemsley et al., 2019)
Cb109 1 AKYP01000000 (Rouli et al., 2012)
III Idaho Goat_Q195 1 NOLR00000000 (Beare et al., 2017c)
2574 1 CP014555 (Kuley et al., 2017)
601 (14160-001) 1 CP014551 (Kuley et al., 2017)
18430 1 CP014557 (Kuley et al., 2017)
701CbB1 1 CP014553 (Kuley et al., 2017)
Cb_B1 1 CCAH010000000 (Sidi-Boumedine et al., 2014)
Cb_B18 1 CCAI010000000 (Sidi-Boumedine et al., 2014)
EV-Cb_BK18 1 CCAL010000000 (Sidi-Boumedine et al., 2014)
Q532 1 PPFQ01000000 (Hemsley et al., 2019)
Q545 1 PPFO01000000 (Hemsley et al., 2019)
Cb_D1 (DSTL_1R) 1 RQJU01000000 (Hemsley et al., 2019)
Q556 1 PPFN01000000 (Hemsley et al., 2019)
Q559 1 PPFM01000000 (Hemsley et al., 2019)
IV Schperling 4 CP014563 (Kuley et al., 2017)
Cbu_K154 4 CP001020 (Beare et al., 2009)
‘MSU Goat Q177 (Priscilla) 4 CP018150 (Walter et al., 2016) Unpublished
Leningrad-2 4 PDLP00000000 (Freylikhman et al., 2017) Unpublished
Namibia 5 CP007555 (Walter et al., 2014)
AuQ01 (Arandale) 4 JPVV01000000 (Walter et al., 2014)
Cb196_SaudiArabia 4 CCXO01000000 (D’Amato et al., 2014b)
Cb_O184 4 CCAK010000000 (Sidi-Boumedine et al., 2014)
V Cbu G_Q212 2 CP001019 (Beare et al., 2009)
Scurry S_Q217 2 CP014565 (Kuley et al., 2017)
Ko_Q229 2 NOLP00000000 (Beare et al., 2017b)
Dog Utad 2 CCNR01000000; CCYB01000000 (D’Amato et al., 2014a)
VI Dugway 5J108-111, 7D77-80, 7E65-68 3 CP000733; NOLN01000000, NOLM01000000 (Beare et al., 2009; Beare et al., 2017a)