Table 1.
Sequences of customised primers for RT-qPCR.
| Gene | Forward Primer Sequence | Reverse Primer Sequence |
|---|---|---|
| Human primers | ||
| VCAM1 | 5′-CGTCTTGGTCAGCCCTTCCT-3′ | 5′-ACATTCATATACTCCCGCATCCTTC-3′ |
| ICAM1 | 5′-TTGGGCATAGAGACCCCGTT-3′ | 5′-GCACATTGCTCAGTTCATACACC-3′ |
| SELE | 5′-GCACAGCCTTGTCCAACC-3′ | 5′-ACCTCACCAAACCCTTCG-3′ |
| SNAI1 | 5′-CAGACCCACTCAGATGTCAAGAA-3′ | 5′-GGGCAGGTATGGAGAGGAAGA-3′ |
| SNAI2 | 5′-ACTCCGAAGCCAAATGACAA-3′ | 5′-CTCTCTCTGTGGGTGTGTGT-3′ |
| TWIST1 | 5′-GTCCGCAGTCTTACGAGGAG-3′ | 5′-GCTTGAGGGTCTGAATCTTGCT-3′ |
| ZEB1 | 5′-GATGATGAATGCGAGTCAGATGC-3′ | 5′-ACAGCAGTGTCTTGTTGTTGT-3′ |
| CDH2 | 5′-GCTTCTGGTGAAATCGCATTA-3′ | 5′-AGTCTCTCTTCTGCCTTTGTAG-3′ |
| ACTA2 | 5′-GTGTTGCCCCTGAAGAGCAT-3′ | 5′-GCTGGGACATTGAAAGTCTCA-3′ |
| KDR | 5′-TGCCTACCTCACCTGTTTC-3′ | 5′-GGCTCTTTCGCTTACTGTTC-3′ |
| PECAM1 | 5′-TGGCGCATGCCTGTAGTA-3′ | 5′-TCCGTTTCCTGGGTTCAA-3′ |
| CDH5 | 5′-AAGCGTGAGTCGCAAGAATG-3′ | 5′-TCTCCAGGTTTTCGCCAGTG-3′ |
| KLF2 | 5′-CAGCACTGGTCTGGTTGCTTG-3′ | 5′-ACCCACTGCACACGATGCTT-3′ |
| KLF4 | 5′-GAAAAGGACCGCCACCCACA-3′ | 5′-AGCGGGCGAATTTCCATCCA-3′ |
| NFE2L2 | 5′-GCACATCCAGTCAGAAACCAGT-3′ | 5′-ACTGAAACGTAGCCGAAGAAAC-3′ |
| YAP1 | 5′-AGAACTGCTTCGGCAGGCAA-3′ | 5′-CCACCATCCTGCTCCAGTGT-3′ |
| WWTR1 | 5′-CGTCAGTTCCACACCAGTGC-3′ | 5′-GGTTCTGCTGGCTCAGGGTA-3′ |
| ACTB | 5′-CATCGAGCACGGCATCGTCA-3′ | 5′-TAGCACAGCCTGGACAGCAAC-3′ |
| GAPDH | 5′-AGCCACATCGCTCAGACAC-3′ | 5′-GCCCAATACGACCAAATCC-3′ |
| B2M | 5′-TCCATCCGACATTGAAGTTG-3′ | 5′-CGGCAGGCATACTCATCTT-3′ |
| Rat primers | ||
| Vcam1 | 5′-GGAAATGCCACCCTCACCTTA-3′ | 5′-TCCAGGGGAGATGTCAACAGT-3′ |
| Icam1 | 5′-CGACATTGGGGAAGACAGCAG-3′ | 5′-TCCACTCGCTCTGGGAACG-3′ |
| Twist1 | 5′-ATGTCCGCGTCCCACTAGCA-3′ | 5′-CCCCACGCCCTGATTCTTGT-3′ |
| Zeb1 | 5′-CCAGTGAAGGTGATCCAGCCA-3′ | 5′-CTTTTTGGGTGGCGTGCAGT-3′ |
| Cdh2 | 5′-ACCCAGGAAAAGTGGCAGGT-3′ | 5′-GCTGTGCTTGGCGAGTTGTC-3′ |
| Kdr | 5′-TGGTCCTTGCCTCAGAAGAGC-3′ | 5′-GCTGGTCTGGTTGGAGCCTT-3′ |
| Pecam1 | 5′-CCGTCCAGGTGTGCGAAATG-3′ | 5′-GGGCGCAGTCCCATTTACTG-3′ |
| Cdh5 | 5′-ACAAGGACGTGGTGCCAGTA-3′ | 5′-GGGCATCCCATTGTCGGAGA-3′ |
| Klf2 | 5′-CACCAACTGCGGCAAGACCT-3′ | 5′-GTAGTGGCGGGTAAGCTCGTCA-3′ |
| Klf4 | 5′-GACTATGCAGGCTGTGGCAAA-3′ | 5′-CGGTAGTGCCTGGTCAGTTCA-3′ |
| Nfe2l2 | 5′-CAGTGGATCTGTCAGCTACTCC-3′ | 5′-CTCTCAACGTGGCTGGGAAT-3′ |
| Yap1 | 5′-TTTCGGCAGGCAATACGGAAT-3′ | 5′-TGCTCCAGTGAGGGCAACTG-3′ |
| Wwtr1 | 5′-GTCAACACGCCTGCCATGAA-3′ | 5′-TGCTCTGCTCCCGTGAATGA-3′ |
| Actb | 5′-ACAACCTTCTTGCAGCTCCTC-3′ | 5′-CCATACCCACCATCACACCCT-3′ |
| Tbp | 5′-TGCCAAGTGTGAGCCTCTCC-3′ | 5′-TGGGTTATCGTCACGCACCAT-3′ |
| B2m | 5′-GGTGACCGTGATCTTTCTGGTG-3′ | 5′-TGAGGAAGTTGGGCTTCCCATT-3′ |