Table 3.

Overview of the most efficient protocols to extract specific lipid classes from different tissues of Arabidopsis

Lipid class	Leaves	Flowers	Siliques	Seeds	Seedlings	Stems	Roots
Cer	M2, M3, M4	All	M3, M4	M2, M3, M4	M1, M2, M4	All	All
HexCer	M4	M1, M3, M4	M2, M3, M4	M1, M4	M1, M2, M4	All	All
LPC	M1	M3, M4	M4	M3, M4	M1, M3, M4	M3, M4	All
LPE	M1	M3, M4	ND	M1, M3, M4	ND	ND	All
DGDG	M2, M3, M4	M3, M4	All	All	All	M1, M3, M4	All
MGDG	M2, M3, M4	M2, M3	ND	M2, M3, M4	M1, M3, M4	All	All
SQDG	M4	ND	M4	M4	M4	M1, M4	All
PA	M1, M4	M1, M4	ND	All	M1	M1, M2, M4	ND
PC	M1, M3, M4	M2, M4	All	M3, M4	All	M1, M3	All
PE	M3, M4	M2, M3, M4	All	All	All	All	All
PG	M2, M3, M4	ND	All	ND	All	All	All
PI	M3	ND	M3	ND	ND	All	M1, M3, M4
PS	M1, M4	M3, M4	M1, M3, M4	M1, M3, M4	M3, M4	M2, M4	M1, M3, M4
DAG	M1, M2	M1, M2	M1, M2, M4	M1, M2, M4	M2	M2	M2, M3
TAG	M2, M4	M1, M2, M4	M1, M2, M4	M1, M2, M4	M1, M2, M4	All	All

The methods which did not statistically significantly differ in their extraction efficiencies are provided together. M1: Welti et al. [18], M2: Hummel et al. [24], M3: Burgos et al. [27], M4: Shiva et al. [23]. PC Phosphatidylcholine, PE phosphatidylethanolamine, PG phosphatidylglycerol, PI phosphatidylinositol, PS phosphatidylserine, PA phosphatidic acid, LPC lysophosphatidylcholine, LPE lysophosphatidylethanolamine, Cer-AP ceramides and HexCer hexsolyceramides, DGDG digalactosyldiacylglycerol, MGDG monogalactosylmonoacylglycerol, SQDG sulfoquinovosyldiacylglycerol, DAG diacylglycerol, TAG triacylglycerol, ND Not detected or data inconsistent