Skip to main content
. 2020 Nov 24;11:603819. doi: 10.3389/fpls.2020.603819

TABLE 1.

Summary of variants from all tea samples.

Name SNP INDEL SUM Ho He Ts/Tv Non-syn/Syn
Anhui 3 3676324 1633262 5309586 0.13 0.22 2.68 1.65
Fudingdabai 4423650 1872696 6296346 0.19 0.22 2.67 1.65
Longjing 43 3700123 1655737 5355860 0.13 0.22 2.67 1.64
Baihaozao 3861305 1721101 5582406 0.14 0.22 2.67 1.65
Xinyang 10 3641455 1626369 5267824 0.13 0.22 2.67 1.64
Guihong 3 3745749 1673269 5419018 0.13 0.22 2.67 1.66
Echa 5 4012657 1772592 5785249 0.15 0.22 2.67 1.66
Chuanmu 28 3889553 1727255 5616808 0.15 0.22 2.66 1.66
Xicha 5 3781285 1703838 5485123 0.13 0.22 2.67 1.66
Gancha 3 4012013 1754996 5767009 0.15 0.22 2.69 1.65
Qucha 3568154 1607688 5175842 0.12 0.22 2.66 1.66
Shancha 1 3844480 1708124 5552604 0.13 0.22 2.69 1.64
Xiaoxianghong 21-3 4151438 1760118 5911556 0.15 0.22 2.71 1.62
Zhenong 117 3971472 1729607 5701079 0.14 0.22 2.67 1.64
Yaoshanxiulv 3737713 1677786 5415499 0.13 0.22 2.66 1.65
Yunkang 10 4536915 1869963 6406878 0.17 0.22 2.67 1.62
Zijuan 4567906 1903947 6471853 0.17 0.22 2.67 1.62
Xiuhong 4131555 1601387 5732942 0.16 0.22 2.72 1.60
Yinghong 9 4448683 1731791 6180474 0.17 0.21 2.69 1.61
Qingshui 3 4272540 1667201 5939741 0.16 0.22 2.72 1.61
Changyebaihao 4129310 1653708 5783018 0.12 0.21 2.70 1.60
Yunkang 43 4223486 1717369 5940855 0.14 0.21 2.69 1.61
Yunxuan 9 4143841 1694662 5838503 0.11 0.21 2.68 1.62
Shuangjiangheidaye 4170410 1699774 5870184 0.11 0.21 2.69 1.61
Menghaidaye 4180475 1657480 5837955 0.12 0.21 2.70 1.62
Mengkudaye 4887656 1852883 6740539 0.21 0.22 2.71 1.62
Yunkang 14 4229040 1683084 5912124 0.14 0.21 2.70 1.62
Yunkang 37 4296614 1739395 6036009 0.14 0.21 2.69 1.61
Nannuoshan 14 4300939 1760193 6061132 0.12 0.21 2.68 1.62
Hekai 33 4108626 1659334 5767960 0.11 0.21 2.68 1.62
CTS-1 3584397 1377392 4961789 0.08 0.20 2.588 1.00
CTS-2 3579822 1347100 4926922 0.08 0.20 2.61 1.00
CTS-3 3589847 1374588 4964435 0.08 0.20 2.592 1.00