Skip to main content
. 2020 Dec 15;2020:6281635. doi: 10.1155/2020/6281635

Table 2.

Correlation analysis between E2F and relate genes and markers of monocyte, TAM, and macrophages in TIMER.

Description Gene markers GBM
E2F1 E2F2 E2F3 E2F4 E2F5 E2F6 E2F7 E2F8
cor P cor P cor P cor P cor P cor P cor P cor P

Monocyte CD86 -0.359 ∗∗∗ -0.328 ∗∗∗ -0.242 ∗∗ -0.140 0.084 -0.261 -0.312 ∗∗∗ -0.193 0.016 -0.224
CD115 (CSF1R) -0.239 -0.227 -0.097 0.229 -0.006 0.933 -0.349 ∗∗∗ -0.352 ∗∗∗ -0.150 0.062 -0.143 0.076

TAM CCL2 -0.383 ∗∗∗ -0.415 ∗∗∗ -0.309 ∗∗ -0.111 0.17 -0.203 0.011 -0.228 -0.170 0.035 -0.167 0.038
CD68 -0.246 -0.210 -0.097 0.228 0.010 0.901 -0.306 ∗∗ -0.380 ∗∗∗ -0.180 0.025 -0.164 0.042
IL10 -0.392 ∗∗∗ -0.357 ∗∗∗ -0.289 ∗∗ -0.141 0.081 -0.259 -0.398 ∗∗∗ -0.326 ∗∗∗ -0.302 ∗∗

M1 macrophage INOS (NOS2) 0.006 0.936 -0.082 0.308 -0.106 0.19 0.164 0.042 -0.114 0.159 0.041 0.61 0.129 0.11 0.116 0.153
IRF5 -0.246 -0.262 -0.149 0.065 0.064 0.429 -0.362 ∗∗∗ -0.395 ∗∗∗ -0.084 0.296 -0.134 0.098
COX2 (PTGS2) -0.182 0.023 -0.140 0.082 0.064 0.431 0.035 0.661 -0.091 0.259 -0.087 0.279 -0.032 0.691 0.005 0.944

M2 macrophage CD163 -0.205 0.010 -0.234 -0.126 0.118 -0.070 0.386 -0.192 0.017 -0.243 -0.060 0.458 -0.103 0.203
VSIG4 -0.389 ∗∗∗ -0.346 ∗∗∗ -0.282 ∗∗ -0.156 0.052 -0.249 -0.373 ∗∗∗ -0.276 ∗∗ -0.332 ∗∗∗
MS4A4A -0.319 ∗∗∗ -0.295 ∗∗ -0.231 -0.173 0.031 -0.253 -0.313 ∗∗∗ -0.241 -0.233

Description Gene markers LGG
E2F1 E2F2 E2F3 E2F4 E2F5 E2F6 E2F7 E2F8
cor P cor P cor P cor P cor P cor P cor P cor P

Monocyte CD86 -0.203 ∗∗∗ 0.228 ∗∗∗ 0.061 0.166 0.185 ∗∗∗ 0.004 0.910 0.074 0.089 -0.004 0.921 0.157 ∗∗
CD115 (CSF1R) -0.285 ∗∗∗ 0.209 ∗∗∗ 0.048 0.269 0.114 -0.029 0.510 -0.041 0.343 -0.147 ∗∗ 0.055 0.208

TAM CCL2 -0.19 ∗∗∗ 0.065 0.137 -0.027 0.532 0.096 0.028 -0.057 0.188 -0.004 0.922 0.01 0.818 0.062 0.153
CD68 -0.124 0.28 ∗∗∗ 0.076 0.084 0.267 ∗∗∗ 0.057 0.192 0.103 0.018 0.098 0.025 0.224 ∗∗∗
IL10 -0.152 ∗∗ 0.183 ∗∗∗ 0.043 0.321 0.168 ∗∗ 0.002 0.954 0.035 0.421 0.049 0.257 0.145 ∗∗

M1 macrophage INOS (NOS2) 0.197 ∗∗∗ -0.005 0.905 0.011 0.801 0.012 0.771 -0.059 0.178 0.014 0.738 0.093 0.034 0.073 0.093
IRF5 -0.117 0.226 ∗∗∗ 0.008 0.842 0.285 ∗∗∗ -0.076 0.081 0.038 0.386 0.05 0.250 0.183 ∗∗∗
COX2 (PTGS2) 0.009 0.830 0.008 0.849 0.077 0.079 -0.038 0.386 -0.109 0.012 -0.072 0.100 0.047 0.286 0.051 0.242

M2 macrophage CD163 -0.077 0.077 0.224 ∗∗∗ 0.131 0.193 ∗∗∗ 0.023 0.597 0.153 ∗∗ 0.142 0.203 ∗∗∗
VSIG4 -0.255 ∗∗∗ 0.256 ∗∗∗ 0.098 0.024 0.183 ∗∗∗ 0.041 0.349 0.08 0.067 -0.079 0.072 0.107 0.014
MS4A4A -0.157 ∗∗ 0.28 ∗∗∗ 0.134 0.193 ∗∗∗ 0.104 0.017 0.145 ∗∗ 0.07 0.107 0.212 ∗∗∗

Cor: R value of Spearman's correlation; TAM: tumor-associated macrophages. P < 0.01; ∗∗P < 0.001; ∗∗∗P < 0.0001.