Table 1.
Sample Code—Host-Plant Locality | D2-D3 Haplotype | coxI Haplotype | D2-D3 | ITS1 | 18S | coxI | |
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Xiphinema malaka sp. nov. | |||||||
Maritime Pine (Pinus pinaster Aiton) | |||||||
1. SA03-DF91 | Canillas de Albaida (Málaga) a | D2-D3-Hm3 | coxI-Hm2 | MT584052 | MT584088 | MT584086 | MT580263 |
2. SA03-DF92 | Canillas de Albaida (Málaga) a | D2-D3-Hm10 | coxI-Hm2 | MT584053 | - | - | MT580264 |
3. SA03-DF15 | Canillas de Albaida (Málaga) a | D2-D3-Hm10 | coxI-Hm2 | MT584054 | - | - | MT580265 |
4. SA03-DF90 | Canillas de Albaida (Málaga) a | D2-D3-Hm10 | - | MT584055 | - | - | - |
5. SA03-DF93 | Canillas de Albaida (Málaga) a | D2-D3-Hm10 | - | MT584056 | - | - | - |
6. SA03-DF94 | Canillas de Albaida (Málaga) a | D2-D3-Hm10 | - | MT584057 | - | - | - |
7. SA02-DF42 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm12 | - | MT584058 | MT584089 | - | |
8. SA02-AU62 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm12 | - | MT584059 | - | - | |
9. SA05_DF16 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm11 | - | MT584060 | MT584090 | - | |
10. SA05_DH96 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm1 | - | MT584061 | - | - | - |
11. SA05_DH97 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm2 | - | MT584062 | - | - | - |
12. SA05_DH98 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm3 | - | MT584063 | - | - | - |
13. SA05_DH99 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm3 | - | MT584064 | - | - | - |
14. SA06-DG12 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm12 | - | MT584065 | MT584091 | - | - |
15. SA06-DG13 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm5 | - | MT584066 | MT584092 | - | - |
16. SA06-DI01 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm4 | - | MT584067 | - | - | - |
17. SA06-DI02 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm5 | - | MT584068 | - | - | - |
18. SA06-DI03 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm6 | - | MT584069 | - | - | - |
19. SA06-DI04 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm4 | - | MT584070 | - | - | - |
20. SA07-AU46 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm9 | coxI-Hm3 | MT584071 | MT584093 | MT584087 | MT580266 |
21. SA07-AU47 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm9 | - | MT584072 | MT584094 | - | - |
22. SA07-AU48 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm9 | - | MT584073 | - | - | - |
23. SA08-DF19 | Canillas de Albaida (Málaga) | D2-D3-Hm2 | coxI-Hm1 | MT584074 | MT584095 | - | MT580267 |
Black pine (Pinus nigraArnold) | - | ||||||
24. SN01-DI10 | Igualeja (Málaga) | D2-D3-Hm7 | coxI-Hm5 | MT584075 | MT584096 | - | MT580268 |
25. SN01-DE88 | Igualeja (Málaga) | D2-D3-Hm3 | coxI-Hm5 | MT584076 | - | - | MT580269 |
26. SN01-DF46 | Igualeja (Málaga) | D2-D3-Hm3 | coxI-Hm6 | MT584077 | - | - | MT580270 |
27. SN03-DE93 | Igualeja (Málaga) | D2-D3-Hm7 | coxI-Hm5 | MT584078 | MT584097 | - | MT580271 |
Cork oak (Quercus suber L.) | |||||||
28. SN14-DF11 | Monda (Málaga) | D2-D3-Hm8 | - | MT584079 | MT584098 | - | - |
29. SN14-DI12 | Monda (Málaga) | D2-D3-Hm8 | - | MT584080 | - | - | - |
30. SN14-DI13 | Monda (Málaga) | D2-D3-Hm8 | - | MT584081 | - | - | - |
31. SN14-DI14 | Monda (Málaga) | D2-D3-Hm8 | - | MT584082 | - | - | - |
32. SN14-DI15 | Monda (Málaga) | D2-D3-Hm8 | coxI-Hm4 | MT584083 | - | - | MT580272 |
33. SN14-DI16 | Monda (Málaga) | D2-D3-Hm8 | coxI-Hm4 | MT584084 | - | - | MT580273 |
Yellow broom (Cytisus scoparius (L.) Link) | |||||||
34. RAMB-AO44 | Tabernas, Almería | D2-D3-Hm13 | coxI-Hm1 | MT584085 | MT584099 | - | MT580274 |
Xiphinema adenohystherum | |||||||
Grapevine (Vitis vinifera L.) | |||||||
406f | Villalba del Alcor, Huelva | - | - | - | MT584100 | - | - |
Wild olive (Olea europaea L. subsp europaea var. sylvestris) | |||||||
AR139 | Aroche, Huelva | - | - | - | MT584101 | - | - |
European holly (Ilex aquifolium L.) | |||||||
Z137f | Arevalo de la Sierra, Soria | - | - | - | MT584102 | - | - |
a Type locality (paratype specimens); (-) Not obtained or not performed.