Skip to main content
. 2020 Nov 26;9(12):1649. doi: 10.3390/plants9121649

Table 1.

Isolates sampled for Xiphinema malaka sp. nov. from several localities of Málaga and Almería provinces (Southern Spain), and Xiphinema adenohystherum sequences used in this study.

Sample Code—Host-Plant Locality D2-D3 Haplotype coxI Haplotype D2-D3 ITS1 18S coxI
Xiphinema malaka sp. nov.
Maritime Pine (Pinus pinaster Aiton)
1. SA03-DF91 Canillas de Albaida (Málaga) a D2-D3-Hm3 coxI-Hm2 MT584052 MT584088 MT584086 MT580263
2. SA03-DF92 Canillas de Albaida (Málaga) a D2-D3-Hm10 coxI-Hm2 MT584053 - - MT580264
3. SA03-DF15 Canillas de Albaida (Málaga) a D2-D3-Hm10 coxI-Hm2 MT584054 - - MT580265
4. SA03-DF90 Canillas de Albaida (Málaga) a D2-D3-Hm10 - MT584055 - - -
5. SA03-DF93 Canillas de Albaida (Málaga) a D2-D3-Hm10 - MT584056 - - -
6. SA03-DF94 Canillas de Albaida (Málaga) a D2-D3-Hm10 - MT584057 - - -
7. SA02-DF42 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm12 - MT584058 MT584089 -
8. SA02-AU62 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm12 - MT584059 - -
9. SA05_DF16 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm11 - MT584060 MT584090 -
10. SA05_DH96 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm1 - MT584061 - - -
11. SA05_DH97 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm2 - MT584062 - - -
12. SA05_DH98 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm3 - MT584063 - - -
13. SA05_DH99 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm3 - MT584064 - - -
14. SA06-DG12 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm12 - MT584065 MT584091 - -
15. SA06-DG13 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm5 - MT584066 MT584092 - -
16. SA06-DI01 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm4 - MT584067 - - -
17. SA06-DI02 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm5 - MT584068 - - -
18. SA06-DI03 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm6 - MT584069 - - -
19. SA06-DI04 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm4 - MT584070 - - -
20. SA07-AU46 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm9 coxI-Hm3 MT584071 MT584093 MT584087 MT580266
21. SA07-AU47 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm9 - MT584072 MT584094 - -
22. SA07-AU48 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm9 - MT584073 - - -
23. SA08-DF19 Canillas de Albaida (Málaga) D2-D3-Hm2 coxI-Hm1 MT584074 MT584095 - MT580267
Black pine (Pinus nigraArnold) -
24. SN01-DI10 Igualeja (Málaga) D2-D3-Hm7 coxI-Hm5 MT584075 MT584096 - MT580268
25. SN01-DE88 Igualeja (Málaga) D2-D3-Hm3 coxI-Hm5 MT584076 - - MT580269
26. SN01-DF46 Igualeja (Málaga) D2-D3-Hm3 coxI-Hm6 MT584077 - - MT580270
27. SN03-DE93 Igualeja (Málaga) D2-D3-Hm7 coxI-Hm5 MT584078 MT584097 - MT580271
Cork oak (Quercus suber L.)
28. SN14-DF11 Monda (Málaga) D2-D3-Hm8 - MT584079 MT584098 - -
29. SN14-DI12 Monda (Málaga) D2-D3-Hm8 - MT584080 - - -
30. SN14-DI13 Monda (Málaga) D2-D3-Hm8 - MT584081 - - -
31. SN14-DI14 Monda (Málaga) D2-D3-Hm8 - MT584082 - - -
32. SN14-DI15 Monda (Málaga) D2-D3-Hm8 coxI-Hm4 MT584083 - - MT580272
33. SN14-DI16 Monda (Málaga) D2-D3-Hm8 coxI-Hm4 MT584084 - - MT580273
Yellow broom (Cytisus scoparius (L.) Link)
34. RAMB-AO44 Tabernas, Almería D2-D3-Hm13 coxI-Hm1 MT584085 MT584099 - MT580274
Xiphinema adenohystherum
Grapevine (Vitis vinifera L.)
406f Villalba del Alcor, Huelva - - - MT584100 - -
Wild olive (Olea europaea L. subsp europaea var. sylvestris)
AR139 Aroche, Huelva - - - MT584101 - -
European holly (Ilex aquifolium L.)
Z137f Arevalo de la Sierra, Soria - - - MT584102 - -

a Type locality (paratype specimens); (-) Not obtained or not performed.