Table 2.
Comparative genomics of dimorphism genes across sixteen Ustilaginomycotina species. Colors in the left column indicate: green, receptor genes; blue, genes in the cAMP/PKA pathway; yellow, genes in the MAPK pathway; red, genes in the GTPase-mediated signaling; white, other downstream genes. Details about genes in this table can be found in Figure 4 and Table S1. White and black cell colors indicate ortholog presence and absence, respectively. Species abbreviations are as follows: Acain, Acaromyces ingoldii; Cergu, Ceraceosorus guamensis; Exova, Exobasidium vaccinii; Jamro, Jaminaea rosea; Malgl, Malassezia globosa; Meimi, Meira miltonrushii; Moeap, Moesziomyces aphidis; Psean, Pseudozyma antarctica; Psehu, Pseudozyma hubeiensis; Psegl, Pseudomicrostroma glucosiphilum; Spore, Sporisorium reilianum; Tescy, Testicularia cyperi; Tilan, Tilletiaria anomala; Tilwa, Tilletiopsis washingtonensis; Ustma, Ustilago maydis; Viopa, Violaceomyces palustris.
| Gene Name | Ustma GeneID | Acain | Cergu | Exova | Jamro | Malgl | Meimi | Moeap | Psean | Psehu | Psegl | Spore | Tescy | Tilan | Tilwa | Ustma | Viopa |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Msb2 | UMAG_00480 | ||||||||||||||||
| Pra1 | UMAG_02383 | ||||||||||||||||
| Sho1 | UMAG_03156 | ||||||||||||||||
| Ump2 | UMAG_05889 | ||||||||||||||||
| Adr1 | UMAG_04456 | ||||||||||||||||
| Bpp1 | UMAG_00703 | ||||||||||||||||
| Gpa3 | UMAG_04474 | ||||||||||||||||
| Uac1 | UMAG_05232 | ||||||||||||||||
| Ubc1 | UMAG_00525 | ||||||||||||||||
| Ucn1 | UMAG_00936 | ||||||||||||||||
| Uka1 | UMAG_11860 | ||||||||||||||||
| Umpde1 | UMAG_02531 | ||||||||||||||||
| Umpde2 | UMAG_10895 | ||||||||||||||||
| Crk1 | UMAG_11410 | ||||||||||||||||
| Fuz7/Ubc5 | UMAG_01514 | ||||||||||||||||
| Kpp2/Ubc3 | UMAG_03305 | ||||||||||||||||
| Kpp4/Ubc4 | UMAG_04258 | ||||||||||||||||
| Kpp6 | UMAG_02331 | ||||||||||||||||
| Rok1 | UMAG_03701 | ||||||||||||||||
| Ubc2 | UMAG_05261 | ||||||||||||||||
| Cla4 | UMAG_10145 | ||||||||||||||||
| Pdc1 | UMAG_01366 | ||||||||||||||||
| Ras1 | UMAG_01643 | ||||||||||||||||
| Ras2 | UMAG_03172 | ||||||||||||||||
| Rho1 | UMAG_05734 | ||||||||||||||||
| Sql2 | UMAG_10803 | ||||||||||||||||
| Biz1 | UMAG_02549 | ||||||||||||||||
| Chs5 | UMAG_10277 | ||||||||||||||||
| Chs7 | UMAG_05480 | ||||||||||||||||
| Cib1 | UMAG_11782 | ||||||||||||||||
| Clb2 | UMAG_10279 | ||||||||||||||||
| Clp1 | UMAG_02438 | ||||||||||||||||
| Gcn5 | UMAG_10190 | ||||||||||||||||
| Hap2 | UMAG_01597 | ||||||||||||||||
| Hgl1 | UMAG_11450 | ||||||||||||||||
| Hos2 | UMAG_11828 | ||||||||||||||||
| Khd4 | UMAG_03837 | ||||||||||||||||
| Kin1 | UMAG_04218 | ||||||||||||||||
| Kin3 | UMAG_06251 | ||||||||||||||||
| Mcs1 | UMAG_03204 | ||||||||||||||||
| Med1 | UMAG_03588 | ||||||||||||||||
| Myo5 | UMAG_04555 | ||||||||||||||||
| Nit2 | UMAG_10417 | ||||||||||||||||
| Pac2 | UMAG_15096 | ||||||||||||||||
| Prf1 | UMAG_02713 | ||||||||||||||||
| Rac1 | UMAG_00774 | ||||||||||||||||
| Rak1 | UMAG_10146 | ||||||||||||||||
| Rbf1 | UMAG_03167 | ||||||||||||||||
| Rop1 | UMAG_12033 | ||||||||||||||||
| Ros1 | UMAG_05853 | ||||||||||||||||
| Rrm4 | UMAG_03494 | ||||||||||||||||
| Sep3 | UMAG_03449 | ||||||||||||||||
| Tea1 | UMAG_15019 | ||||||||||||||||
| Tea4 | UMAG_01012 | ||||||||||||||||
| Tup1 | UMAG_03280 | ||||||||||||||||
| Yup1 | UMAG_05406 |