Table 1.
Spoligotyping patterns and 12 locus MIRU-VNTR profiles of 42 M. bovis isolates.
| No ofisolates | Spoligotyping | Spoligotype(oktal) | Family | Spoligotype name | 12 LokusMIRU-VNTR | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SpoIDB4 | M.bovis.org | |||||
| H-1 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis BCG | SIT482 | SB0120 | 232324244222 |
| H-2 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis BCG | SIT482 | SB0120 | 232324254322 |
| H-3 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis | SIT482 | SB0120 | 232324254322 |
| H-6 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis | SIT482 | SB0120 | 232324254322 |
| H-7 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis | SIT482 | SB0120 | 232324254321 |
| H-9 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis | SIT482 | SB0120 | 232324254323 |
| B-2 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis | SIT482 | SB0120 | 222324254423 |
| B-6 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis | SIT482 | SB0120 | 222324254322 |
| B-7 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis | SIT482 | SB0120 | 232324254222 |
| B-11 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis | SIT482 | SB0120 | 232324254422 |
| B-13 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis | SIT482 | SB0120 | 232324254323 |
| B-17 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis | SIT482 | SB0120 | 232324254222 |
| B-20 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis | SIT482 | SB0120 | 232324254322 |
| B-21 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis | SIT482 | SB0120 | 232324244322 |
| B-27 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis | SIT482 | SB0120 | 232324254322 |
| B-24 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis | SIT482 | SB0120 | 232324254223 |
| B-29 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis | SIT482 | SB0120 | 232324244222 |
| B-32 | ■■□■■■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 676773777777600 | M.bovis | SIT482 | SB0120 | 232324254322 |
| H-4 | ■■□■■■■□□□□□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 674073777777600 | M.bovis | SIT685 | SB0288 | 232324254323 |
| H-5 | ■■□■■□■□□□□□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 664073777777600 | M.bovis | SIT683 | SB0140 | 232324254321 |
| B-1 | □■□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■■■□■■■■■■ | 200003777377600 | M.bovis subsp.caprae | SIT647 | SB0418 | 232324254321 |
| B-3 | □■□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■■■□■■■■■■ | 200003777377600 | M.bovis subsp.caprae | SIT647 | SB0418 | 232324244322 |
| B-8 | □■□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■■■□■■■■■■ | 200003777377600 | M.bovis subsp.caprae | SIT647 | SB0418 | 232324254422 |
| B-12 | □■□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■■■□■■■■■■ | 200003777377600 | M.bovis subsp.caprae | SIT647 | SB0418 | 232324244322 |
| B-14 | □■□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■■■□■■■■■■ | 200003777377600 | M.bovis subsp.caprae | SIT647 | SB0418 | 232324254222 |
| B-25 | □■□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■■■□■■■■■■ | 200003777377600 | M.bovis subsp.caprae | SIT647 | SB0418 | 232324244223 |
| B-31 | □■□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■■■□■■■■■■ | 200003777377600 | M.bovis subsp.caprae | SIT647 | SB0418 | 232324254223 |
| H-8 | ■■□■■□■□□□□□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 664073777777600 | M.bovis | SIT683 | SB0140 | 232324244423 |
| H-10 | ■■□■■□■□□□□□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 664073777777600 | M.bovis | SIT683 | SB0140 | 232324244222 |
| B-9 | ■■□■■□■□□□□□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 664073777777600 | M.bovis | SIT683 | SB0140 | 232324254323 |
| B-10 | ■■□■■□■□□□□□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 664073777777600 | M.bovis | SIT683 | SB0140 | 232324254422 |
| B-15 | ■■□■■□■□□□□□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 664073777777600 | M.bovis | SIT683 | SB0140 | 232324254322 |
| B-16 | ■■□■■□■□□□□□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 664073777777600 | M.bovis | SIT683 | SB0140 | 232324254422 |
| B-18 | ■■□■■□■□□□□□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 664073777777600 | M.bovis | SIT683 | SB0140 | 232324254323 |
| B-23 | ■■□■■□■□□□□□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 664073777777600 | M.bovis | SIT683 | SB0140 | 232324254222 |
| B-28 | ■■□■■□■□□□□□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 664073777777600 | M.bovis | SIT683 | SB0140 | 232324254322 |
| B-30 | ■■□■■□■□□□□□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 664073777777600 | M.bovis | SIT683 | SB0140 | 232324254222 |
| B-4 | ■■□■■■■□□□□□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 674073777777600 | M.bovis | SIT685 | SB0288 | 232324254323 |
| B-5 | ■■□■■■■□□□□□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 674073777777600 | M.bovis | SIT685 | SB0288 | 232324254323 |
| B-22 | ■■□■■■■□□□□□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 674073777777600 | M.bovis | SIT685 | SB0288 | 232324254222 |
| B-19 | □■□□■□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■■■□■■■■■■ | 220003777377600 | - | - | - | 232324254322 |
| B-26 | ■■□■■■■□□□□□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■ | 674077777777600 | - | - | - | 232324254223 |