Table 1.

Dock score of interaction between phytochemicals from Phyllanthus amarus and Andrographis paniculata with SARS-CoV-2 proteins; S protein [PDB ID:6VSB,6VXX (closed), 6YVB (open)], 3 chymotrypsin like protease (3CLpro) (PDB ID:6LU7), papain like protease (PLpro) (PDB ID:4OVZ) and RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) (PDB ID:6NUS)

Group	Sl. No.	Compound	S protein	S protein (Closed)	S protein (Open)	3CLpro	PLpro	RdRp
			Binding affinity (kcal/mol)	Binding affinity (kcal/mol)	Binding affinity (kcal/mol)	Binding affinity (kcal/mol)	Binding affinity (kcal/mol)	Binding affinity (kcal/mol)
Positive control	1	Remdesivir	− 8.00	− 8.40	− 8.50	− 7.90	− 9.50	− 7.60
Phytochemicals from P.amarus
Alkaloids	1	Epibubbialine	− 6.80	− 7.30	− 6.70	− 5.90	− 7.50	− 6.30
	2	Isobubbialine	− 7.40	− 8.20	− 7.30	− 6.00	− 7.70	− 6.40
	3	nor-securinine	− 6.80	− 7.20	− 7.20	− 5.70	− 7.30	− 6.80
	4	Securinine	− 7.10	− 7.40	− 7.10	− 5.90	− 7.70	− 7.30
Flavonoids	5	Astragalin*	− 9.80	− 8.30	− 8.30	− 8.40	− 9.70	− 7.60
	6	Kaempferol*	− 8.30	− 8.30	− 8.40	− 7.70	− 9.60	− 7.00
	7	Quercetin*	− 8.10	− 8.80	− 8.80	− 7.50	− 8.60	− 8.60
	8	Quercetin-3-O-glucoside*	− 9.80	− 8.60	− 8.60	− 8.20	− 10.30	− 7.70
	9	Quercitrin*	− 9.20	− 8.60	− 8.60	− 8.60	− 8.80	− 8.10
Phenylpropanoid	10	Cinnamic acid	− 5.80	− 5.70	− 6.00	− 4.70	− 6.30	− 5.60
	11	Hinokinin*	− 8.40	− 8.50	− 8.40	− 7.40	− 9.80	− 8.20
	12	Niranthin	− 6.30	− 5.90	− 6.10	− 6.30	− 7.60	− 6.10
	13	Nirtetralin	− 7.40	− 7.00	− 7.00	− 6.60	− 6.70	− 7.00
	14	Phenylalanine	− 5.50	− 5.70	− 5.80	− 4.80	− 6.00	− 5.60
	15	Phyllanthin	− 6.10	− 5.60	− 5.90	− 5.70	− 7.60	− 6.40
Tannins	16	Corilagin*	− 8.80	− 9.60	− 9.50	− 8.70	− 8.50	− 9.30
	17	Furosin*	− 10.20	− 9.60	− 9.40	− 8.70	− 9.20	− 9.10
	18	Geraniin*	− 10.60	− 10.10	− 10.10	− 9.30	− 9.20	− 9.10
	19	Melatonin	− 6.60	− 6.60	− 7.20	− 5.80	− 7.00	− 5.50
Triterpenes	20	farnesyl farnesol	− 5.20	− 5.40	− 5.80	− 4.50	− 5.80	− 4.70
	21	Phenazine	− 6.70	− 7.00	− 7.10	− 5.80	− 7.50	− 7.00
Phytochemicals from A. paniculata
Bioactive compounds	1	Andrograpanin	− 7.30	− 7.10	− 6.60	− 6.10	− 6.80	− 7.20
	2	Andrographolide	− 7.90	− 7.50	− 7.60	− 6.50	− 8.00	− 7.30
	3	Isoandrographolide*	− 9.10	− 7.30	− 8.10	− 7.00	− 9.30	− 8.30
Diterpenes	4	14-acetylandrographolide	− 7.60	− 7.50	− 8.00	− 6.70	− 8.40	− 7.00
	5	14-deoxy-11,12-didehydroandrographolide	− 7.70	− 7.60	− 7.70	− 7.60	− 7.30	− 7.10
	6	14-deoxy-14,15-didehydroandrographolide	− 8.00	− 8.20	− 7.40	− 6.80	− 7.80	− 7.90
	7	14-Deoxyandrographolide	− 8.00	− 8.20	− 7.60	− 7.30	− 8.30	− 7.80
	8	19-O-acetyl-14-deoxy-11,12-didehydroandrographolide	− 8.40	− 7.40	− 7.50	− 6.80	− 8.80	7.10
	9	Deoxyandrographolide	− 7.80	− 7.40	− 8.10	− 7.30	− 7.00	7.50
	10	Neoandrographolide	− 8.20	− 8.10	− 8.40	− 7.80	− 7.80	− 8.50
Flavonoids	11	5-hydroxy-7,8,2′,3′-tetramethoxyflavone,	− 7.60	− 8.00	− 7.40	− 6.90	− 8.40	− 7.00
	12	5-hydroxy-7,8,2′,5′-tetramethoxy flavone	− 8.20	− 7.90	− 7.50	− 7.60	− 8.60	− 7.80
	13	5-hydroxy-7,8-dimethoxyflavanone	− 7.80	− 7.40	− 7.80	− 7.20	− 8.90	− 7.30
	14	5-Hydroxy-7,8-dimethoxyflavone	− 7.90	− 7.20	− 8.00	− 7.50	− 9.00	− 7.50

The docking score of respective phytochemicals higher than the positive control (remdesivir) has been denoted in bold

*The phytochemicals showing better binding affinity with all the viral proteins