Skip to main content
. 2021 Jan 11;11(2):48. doi: 10.1007/s13205-020-02585-8

Table 1.

PCR conditions used for amplification of genes from Pseudomonas strains

Gene Primers PCR profile (35 cycles each)
16S rRNA FGPS 1509–153 Denaturing: 95 °C 1 min
FGPS 4–281 Annealing: 55 °C 60 s
Extension: 72 °C 90 s
Final extension: 72 °C 10 min
HCN ACa Denaturing: 95 °C 45 s
ACb Annealing: 65 °C 30 s
Extension: 72 °C 60 s
Final extension: 72 °C 10 min
Pyrrolnitrin prnAF Denaturing: 95 °C 1 min
PrnAR Annealing: 55 °C 60 s
Extension: 72 °C 60 s
Final extension: 72 °C 10 min
PCA PCA2a Denaturing: 95 °C 1 min
PCA2b Annealing: 58 °C 60 s
Extension: 72 °C 60 s
Final extension: 72 °C 10 min