Skip to main content
. 2021 Jan 18;9:e10787. doi: 10.7717/peerj.10787

Table 2. Indices of codon usage of 51 genes from the cp genome of D. grandiflorum.

Gene GC GC3 GC3S ENC Gene GC GC3 GC3S ENC
accD 0.36 0.31 0.28 50.99 psbA 0.43 0.34 0.30 40.89
atpA 0.42 0.31 0.29 49.59 psbB 0.43 0.30 0.25 47.36
atpB 0.42 0.29 0.27 47.81 psbC 0.45 0.33 0.30 46.17
atpE 0.39 0.27 0.25 47.65 psbD 0.44 0.35 0.30 46.28
atpF 0.38 0.34 0.32 44.90 rbcL 0.44 0.31 0.29 49.45
atpI 0.38 0.27 0.24 46.31 rpl14 0.39 0.26 0.24 49.88
ccsA 0.32 0.25 0.20 46.36 rpl16 0.44 0.27 0.21 41.65
cemA 0.32 0.31 0.27 56.82 rpl20 0.37 0.29 0.26 43.10
clpP 0.45 0.34 0.31 55.82 rpl22 0.36 0.30 0.24 47.84
matK 0.31 0.26 0.23 47.53 rpoA 0.36 0.29 0.26 48.30
ndhA 0.36 0.25 0.22 42.71 rpoB 0.40 0.30 0.28 50.41
ndhB 0.37 0.32 0.27 47.37 rpoC1 0.38 0.28 0.25 48.97
ndhC 0.36 0.26 0.20 41.24 rpoC2 0.38 0.29 0.27 50.39
ndhD 0.36 0.29 0.24 48.99 rps11 0.45 0.26 0.22 50.83
ndhE 0.34 0.23 0.20 52.21 rps14 0.41 0.32 0.29 40.28
ndhF 0.33 0.24 0.20 44.71 rps18 0.35 0.24 0.21 37.11
ndhG 0.36 0.26 0.22 43.72 rps2 0.38 0.26 0.23 45.79
ndhH 0.39 0.30 0.25 51.44 rps3 0.36 0.26 0.24 48.96
ndhI 0.37 0.28 0.26 50.38 rps4 0.39 0.27 0.26 51.15
ndhJ 0.41 0.35 0.30 57.52 rps7 0.41 0.24 0.21 46.08
ndhK 0.40 0.30 0.27 51.77 rps8 0.37 0.25 0.22 42.77
petA 0.39 0.32 0.30 50.42 ycf1 0.32 0.29 0.25 49.67
petB 0.43 0.36 0.30 45.84 ycf2 0.38 0.37 0.34 53.44
petD 0.38 0.24 0.21 40.60 ycf3 0.40 0.49 0.46 61.00
psaA 0.44 0.35 0.30 50.76 ycf4 0.40 0.34 0.31 51.36
psaB 0.42 0.34 0.29 51.35 Average 0.39 0.30 0.26 48.12