Table 5.
Target gene | Primers | Sequence (5′ → 3′ʼ) | PCR conditions | Product (bp) | Reference |
---|---|---|---|---|---|
16S-rRNA |
MD16S1 MD16S2 |
ATCTAATGGCTTAACCATTAAAC GGACGGTAACTAGTTTAGTATT |
95 °C/10 min, 35 cycles: 95 °C/30 s, 59 °C/90 s, 72 °C/1 min, and 72 °C/10 min | 857 | Campylobacter genus identification55,60 |
mapA |
MDmapA1 MDmapA2 |
CTATTTTATTTTTGAGTGCTTGTG GCTTTATTTGCCATTTGTTTTATTA |
589 | C. jejuni species identification55 | |
flaA |
flaAF flaAR |
GGATTTCGTATTAACACAAATGGTGC CTGTAGTAATCTTA AACATTTTG |
94 °C/5 min, 30 cycles: 94 °C/1 min, 48 °C/1 min, 72 °C/1 min, and 72 °C/5 min | 1700 | http://campynet.vetinst.dk/Fla.htm |
cadF |
F2B R1B |
TGGAGGGTAATTTAGATATG CTAATACCTAAAGTTGAAAC |
94 °C/5 min, 30 cycles: 94 °C/1 min, 54 °C/1 min, 72 °C/1 min, and 72 °C/5 min | 400 | 33 |
iam |
IAMF IAMR |
GCGCAAAATATTATCACCC TTCACGACTACTATGCGG |
94 °C/5 min, 30 cycles: 94 °C/1 min, 55 °C/1 min, 72 °C/1 min, and 72 °C/5 min | 518 | 49 |
virB11 |
virBF virBR |
GAACAGGAAGTGGAAAAACTAGC TTCCGCATTGGGCTATATG |
95 °C/5 min, 35 cycles: 95 °C/30 s, 53.5 °C/30 s, 72 °C/30 s, and 72 °C/5 min | 708 | 25 |
wlaN |
wlaN-DL39 Cj1139cF |
TTAAGAGCAAGATATGAAGGTG TGCTGGGTATACAAAGGTTGTG |
95 °C/10 min, 25 cycles: 95 °C/30 s, 60 °C/30 s, 72 °C/1 min, and 72 °C/5 min | 434 | 54 |
cdtA |
cdtAF cdtAR |
CCTTGTGATGCAAGCAATC ACACTCCATTTGCTTTCTG |
94 °C/5 min, 30 cycles: 94 °C/1 min, 49 °C/30 s, 72 °C/1 min, and 72 °C/5 min | 370 | 60 |
cdtB |
cdtBF cdtBR |
CAGAAAGCAAATGGAGTGTT AGCTAAAAGCGGTGGAGTAT |
94 °C/5 min, 30 cycles: 94 °C/1 min, 51 °C/30 s, 72 °C/1 min, and 72 °C/5 min | 620 | 27 |
cdtC |
cdtCF cdtCR |
CGATGAGTTAAAACAAAAAGATA TTGGCATTATAGAAAATACAGTT |
94 °C/5 min, 30 cycles: 94 °C/1 min, 47 °C/30 s, 72 °C/1 min, and 72 °C/5 min | 182 | 27 |