Skip to main content
. 2021 Feb 25;11:4588. doi: 10.1038/s41598-021-84149-1

Table 5.

List of primers and PCR conditions used in this study.

Target gene Primers Sequence (5′ → 3′ʼ) PCR conditions Product (bp) Reference
16S-rRNA

MD16S1

MD16S2

ATCTAATGGCTTAACCATTAAAC

GGACGGTAACTAGTTTAGTATT

95 °C/10 min, 35 cycles: 95 °C/30 s, 59 °C/90 s, 72 °C/1 min, and 72 °C/10 min 857 Campylobacter genus identification55,60
mapA

MDmapA1

MDmapA2

CTATTTTATTTTTGAGTGCTTGTG

GCTTTATTTGCCATTTGTTTTATTA

589 C. jejuni species identification55
flaA

flaAF

flaAR

GGATTTCGTATTAACACAAATGGTGC

CTGTAGTAATCTTA AACATTTTG

94 °C/5 min, 30 cycles: 94 °C/1 min, 48 °C/1 min, 72 °C/1 min, and 72 °C/5 min 1700 http://campynet.vetinst.dk/Fla.htm
cadF

F2B

R1B

TGGAGGGTAATTTAGATATG

CTAATACCTAAAGTTGAAAC

94 °C/5 min, 30 cycles: 94 °C/1 min, 54 °C/1 min, 72 °C/1 min, and 72 °C/5 min 400 33
iam

IAMF

IAMR

GCGCAAAATATTATCACCC

TTCACGACTACTATGCGG

94 °C/5 min, 30 cycles: 94 °C/1 min, 55 °C/1 min, 72 °C/1 min, and 72 °C/5 min 518 49
virB11

virBF

virBR

GAACAGGAAGTGGAAAAACTAGC

TTCCGCATTGGGCTATATG

95 °C/5 min, 35 cycles: 95 °C/30 s, 53.5 °C/30 s, 72 °C/30 s, and 72 °C/5 min 708 25
wlaN

wlaN-DL39

Cj1139cF

TTAAGAGCAAGATATGAAGGTG

TGCTGGGTATACAAAGGTTGTG

95 °C/10 min, 25 cycles: 95 °C/30 s, 60 °C/30 s, 72 °C/1 min, and 72 °C/5 min 434 54
cdtA

cdtAF

cdtAR

CCTTGTGATGCAAGCAATC

ACACTCCATTTGCTTTCTG

94 °C/5 min, 30 cycles: 94 °C/1 min, 49 °C/30 s, 72 °C/1 min, and 72 °C/5 min 370 60
cdtB

cdtBF

cdtBR

CAGAAAGCAAATGGAGTGTT

AGCTAAAAGCGGTGGAGTAT

94 °C/5 min, 30 cycles: 94 °C/1 min, 51 °C/30 s, 72 °C/1 min, and 72 °C/5 min 620 27
cdtC

cdtCF

cdtCR

CGATGAGTTAAAACAAAAAGATA

TTGGCATTATAGAAAATACAGTT

94 °C/5 min, 30 cycles: 94 °C/1 min, 47 °C/30 s, 72 °C/1 min, and 72 °C/5 min 182 27