Table 1.

Virtual screening results of drugs ongoing clinical trials (accessed on 2020-09-03) for the drug targets

available at DockThor-VS. Affinity predictions (kcal/mol) are given for the top-energy pose according to the ensemble docking strategy.

Name	# Studies1	PLpro	Mpro	RdRp	NendoU	N protein	Spike
Acetylcysteine	5	− 6.13	− 6.28	− 6.48	− 6.32	− 6.28	− 6.74
Amodiaquine	1	− 7.57	− 8.23	− 7.23	− 7.64	− 7.96	− 7.79
Atorvastatin	4	− 7.65	− 8.73	− 7.37	− 6.92	− 7.97	− 8.71
Atovaquone	2	− 7.68	− 8.28	− 7.91	− 8.50	− 8.33	− 8.12
Azithromycin	71	− 7.90	− 7.73	− 7.73	− 7.88	− 7.75	− 8.40
Baricitinib	12	− 7.53	− 7.96	− 6.43	− 8.26	− 7.98	− 7.61
Chloroquine	29	− 7.92	− 8.06	− 7.49	− 7.88	− 8.10	− 7.65
Chlorpromazine	2	− 7.68	− 8.41	− 6.74	− 7.71	− 7.45	− 7.61
Ciclesonide	4	− 8.04	− 8.68	− 7.42	− 8.45	− 8.92	− 8.00
Cobicistat	2	− 8.36	− 9.46	− 8.58	− 8.82	− 9.16	− 9.31
Daclatasvir	6	− 8.83	− 9.43	− 8.63	− 9.02	− 9.50	− 9.02
Darunavir	3	− 8.07	− 8.45	− 7.84	− 8.27	− 8.32	− 7.87
Deferoxamine	3	− 7.56	− 7.86	− 7.43	− 7.87	− 8.20	− 7.81
Dexamethasone	18	− 7.28	− 7.83	− 6.90	− 8.01	− 7.74	− 7.60
Disulfiram	1	− 7.23	− 7.80	− 6.74	− 7.75	− 7.52	− 7.22
Eltrombopag	1	− 7.96	− 8.48	− 7.78	− 7.60	− 8.56	− 8.40
Emtricitabine	3	− 6.47	− 7.03	− 6.51	− 6.55	− 6.64	− 6.60
Fingolimod	1	− 7.96	− 7.46	− 6.83	− 8.10	− 7.64	− 7.94
Hydroxychloroquine	185	− 7.76	− 7.83	− 7.42	− 7.66	− 8.10	− 7.70
Ibuprofen	2	− 6.86	− 7.43	− 6.70	− 7.26	− 7.19	− 6.89
Icatibant	1	− 6.95	− 7.58	− 8.97	− 7.50	− 8.34	− 9.04
Imatinib	4	− 8.79	− 10.10	− 7.69	− 8.78	− 8.66	− 8.61
Isotretinoin	5	− 7.04	− 7.20	− 6.93	− 7.03	− 8.03	− 7.72
Ivermectin	36	− 8.37	− 9.26	− 8.62	− 8.94	− 9.44	− 8.78
Ledipasvir	3	− 8.47	− 10.59	− 9.16	− 9.25	− 9.36	− 9.66
Leflunomide	2	− 7.15	− 7.83	− 7.13	− 7.79	− 7.42	− 7.17
Lopinavir	43	− 8.80	− 8.47	− 7.77	− 10.12	− 9.06	− 8.76
Losartan	12	− 7.56	− 8.42	− 7.51	− 8.51	− 8.39	− 8.03
Mefloquine	1	− 7.77	− 7.46	− 7.03	− 7.49	− 7.17	− 7.47
Methylprednisolone	17	− 7.76	− 7.99	− 6.81	− 8.05	− 7.74	− 7.68
Montelukast	1	− 8.38	− 9.08	− 8.65	− 8.52	− 9.02	− 9.28
Niclosamide	3	− 7.44	− 8.04	− 7.28	− 7.29	− 7.47	− 7.68
Nitazoxanide	19	− 7.41	− 7.77	− 6.87	− 7.29	− 7.57	− 7.18
Oseltamivir	9	− 7.12	− 7.03	− 6.83	− 7.33	− 7.25	− 7.64
Prazosin	2	− 8.84	− 8.57	− 7.56	− 8.41	− 8.53	− 7.38
Ribavirin	7	− 6.91	− 6.45	− 6.10	− 6.80	− 6.84	− 6.54
Ritonavir	48	− 8.69	− 8.70	− 7.63	− 9.00	− 8.85	− 8.61
Ruxolitinib	19	− 8.16	− 8.41	− 7.06	− 7.83	− 7.95	− 7.89
Sildenafil	2	− 8.26	− 8.64	− 7.79	− 8.08	− 8.62	− 8.07
Sofosbuvir	7	− 7.92	− 8.49	− 7.29	− 8.10	− 7.40	− 7.48
Telmisartan	9	− 8.55	− 9.38	− 8.12	− 8.42	− 9.09	− 8.60
Tenofovir	1	− 6.86	− 6.89	− 6.86	− 6.65	− 6.73	− 6.90
Thalidomide	2	− 7.15	− 7.40	− 6.66	− 7.17	− 6.71	− 7.21
Tranexamic acid	4	− 6.34	− 6.59	− 6.15	− 6.18	− 6.54	− 7.12

The top-scored drug for each target is underlined and the most promising target for each drug is highlighted in bold. The molecular weight (MW) and the number of rotatable bonds (RotB) of each compound are listed in Table S2.

¹Number of clinical trials reported related to COVID-19 by Mapped Drug Intervention at the ClinicalTrials.gov (accessed on 2020-09-03, https://clinicaltrials.gov/ct2/covid_view/drugs).