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. 2021 Mar 4;12:538733. doi: 10.3389/fgene.2021.538733

TABLE 1.

Conserved motifs of RchDof proteins in the Rosa genome.

Motif ID Conservative motifs E-value Width Sites Description
Motif 1 CPRCESTNTKFCYYNNYSLSQPRHFCKTCRRYWTKGGTLRNVPVGGGCRK 6.6e − 1,009 50 24 WDPa
Motif 2 RCVLIPKTLRIDDPSEAAKSSIWATLGIKNDK 3.4e − 026 32 3
Motif 3 MVFSSIPAYLDPPNWQQQ 1.4e − 013 18 3
Motif 4 QIPCFPGAPWPYPWNSAQWSSAFPPPAF 4.9e − 012 28 3
Motif 5 GAGSIRPGSMADRARLAKJPQPETALK 1.3e − 011 27 3
Motif 6 AHHPSLKSNGTVLTFGSDSPLCESMASVLHLADK 2.3e − 011 34 3
Motif 7 QEKTLKKPDKIJP 1.1e − 009 13 4
Motif 8 PAIKLFGKTIPL 8.5e − 009 12 4
Motif 9 KGDEKKHVPEASPVLQANPAALSRSLNFQE 5.8e − 010 30 3
Motif 10 FYPAAAYWGCAVPGSWNVPW 2.4e − 006 20 3
Motif 11 DHHQQQ 1.7e − 005 6 9
Motif 12 YWNGMLGGGSW 1.1e − 002 11 3
Motif 13 NKRSKSSSSSS 6.0e − 002 11 15
Motif 14 MDTAQWPQGIGV 1.6e − 001 12 2
Motif 15 PTLGKHSRDGEILKQSSSQEEE 1.7e + 000 22 4
Motif 16 QVAEVKVED 2.1e + 000 9 4
Motif 17 NKNSASHYRHITISEAL 2.3e + 000 17 3
Motif 18 TRNGFHKSEELVFPAPCGGGENGDDCSNRSSVT 5.3e + 000 33 2
Motif 19 IDLAVVFAKFLNQ 1.2e + 001 13 2
Motif 20 WPELAI 1.2e + 001 6 4
Motif 21 AWTDLSGF 1.4e + 001 8 3
Motif 22 RLLFPFEDLKQI 3.4e + 001 12 2
Motif 23 WQMNNGDHE 4.4e + 001 9 2
Motif 24 GKDHHH 2.3e + 001 6 6
Motif 25 VEEEKVAA 9.8e + 001 8 3
Motif 26 EEEEEEEKD 1.7e + 002 9 2
Motif 27 DHMGIK 1.4e + 002 6 4
Motif 28 HQGQDLNL 2.6e + 002 8 5
Motif 29 RPJJERRGRPPKDQ 4.7e + 002 14 2
Motif 30 FFHGIS 5.4e + 002 6 2

aWDP indicates a part of Dof domain.