Extended Data Table 2.
Construction of mutations | Forward primer | Reverse primer |
---|---|---|
Δ69–70 | ttggttccatgctatctctgggaccaat | attggtcccagagatagcatggaaccaa |
Δ145 | gatccatttttgggtgtttaccacaa | ttgtggtaaacacccaaaaatggatc |
N501Y | aacccactTatggtgttggttaccaaccatac | gttggtaaccaacaccatAagtgggttggaaacc |
A570D | ggcagagacattgAtgacactactgatg | catcagtagtgtcaTcaatgtctctgcc |
P681H | gactaattctcAtcggcgggcacgtagt | actacgtgcccgccgaTgagaattagtc |
T716I | tgccatacccaTaaattttactattag | ctaatagtaaaatttAtgggtatggca |
S982A | tgatatccttGcacgtcttgacaaagt | actttgtcaagacgtgCaaggatatca |
D1118H | atcattactacaCacaacacatttgtg | cacaaatgtgttgtGtgtagtaatgat |
RT-PCR | Forward primer | Reverse primer |
Δ69–70 | tgttatttctagtgatgttcttg | ctacagcatctgtaatggttcca |
Δ145 | tgttatttctagtgatgttcttg | ctacagcatctgtaatggttcca |
N501Y | tccacttttaagtgttatggag | gttaaagcacggtttaattgtg |
A570D | tccacttttaagtgttatggag | gttaaagcacggtttaattgtg |
P681H | tccacttttaagtgttatggag | gttaaagcacggtttaattgtg |
T716I | tccacttttaagtgttatggag | gttaaagcacggtttaattgtg |
S982A | gtacaatcacttctggttgg | caatcaagccagctataaaacc |
D1118H | gtacaatcacttctggttgg | caatcaagccagctataaaacc |
UK-8x | tccacttttaagtgttatggag | gttaaagcacggtttaattgtg |
qPCR | Forward primer | Reverse primer |
CoV19-N | ttacaaacattggccgcaaa | gcgcgacattccgaagaa |
Sanger sequencing | Forward primer | |
Δ69–70 | tgttatttctagtgatgttcttg | |
Δ145 | gctatacatgtctctgggacca | |
N501Y | gattgctgattataattata | |
A570D | gtaatggtgttgaaggtttt | |
P681H | aggatgttaactgcacaga | |
T716I | aggatgttaactgcacaga | |
S982A | gtacaatcacttctggttgg | |
D1118H | gctatcatcttatgtccttc | |
UK-8x | gattgctgattataattata |