Table A4.

Minor polymorphisms, control populations, day 28. Stop codons are symbolized as *.

Gene	Mutation	Annotation	C1	C2	C3	C4	C5
caiT←	A→T	N41K (AAT→AAA)	0.000	0.149	0.000	0.000	0.000
yadL←	T→A	N179I (AAT→ATT)	0.096	0.000	0.000	0.000	0.000
afuC←	A→G	I315T (ATA→ACA)	0.160	0.000	0.000	0.000	0.000
yagG→	G→A	S392N (AGC→AAC)	0.000	0.168	0.000	0.000	0.000
yahG→	G→A	G212R (GGA→AGA)	0.000	0.000	0.243	0.000	0.000
prpD→	G→C	T241T (ACG→ACC)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.169
hyi→	A→T	D198V (GAT→GTT)	0.135	0.000	0.000	0.000	0.000
sfmZ←	A→T	V50D (GTT→GAT)	0.000	0.000	0.000	0.072	0.000
nadA→	A→G	A58A (GCA→GCG)	0.000	0.236	0.000	0.000	0.000
flgE→	T→C	L325P (CTG→CCG)	0.000	0.000	0.000	0.113	0.000
nhaB←	A→T	V475E (GTG→GAG)	0.000	0.000	0.000	0.242	0.000
sapB←	A→G	F48S (TTT→TCT)	0.123	0.000	0.000	0.000	0.000
kilR←	G→A	A3V (GCA→GTA)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.179
ldhA←/→ ydbH	A→T	intergenic (−200/−8)	0.000	0.000	0.000	0.083	0.000
hipB←	A→G	F4L (TTT→CTT)	0.119	0.000	0.000	0.000	0.000
ydfZ→	A→T	T22S (ACC→TCC)	0.000	0.000	0.000	0.160	0.000
cheW←/←cheA	C→T	intergenic (−18/+3)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.236
yedQ←/←yodC	A→T	intergenic (−105/+66)	0.000	0.159	0.000	0.000	0.000
metG→	C→T	Q31 * (CAG→TAG)	0.000	0.139	0.000	0.000	0.000
fucP→	G→A	A263A (GCG→GCA)	0.110	0.000	0.000	0.000	0.000
tcdA←/←mltA	T→A	intergenic (−118/+121)	0.000	0.000	0.000	0.123	0.000
ygeV←/→ ygeW	A→G	intergenic (−68/−408)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.197
ygeV←/→ ygeW	G→A	intergenic (−344/−132)	0.000	0.000	0.000	0.182	0.000
serA←	C→T	D43N (GAT→AAT)	0.000	0.160	0.000	0.000	0.000
ygiD←/→ zupT	C→G	intergenic (−39/−104)	0.000	0.000	0.000	0.000	0.098
gltB→	T→C	Y199Y (TAT→TAC)	0.136	0.000	0.000	0.000	0.000
crp→	A→T	M60L (ATG→TTG)	0.000	0.200	0.000	0.000	0.000
bcsE→	A→G	E243E (GAA→GAG)	0.000	0.000	0.000	0.094	0.000
yibG→	G→A	E28K (GAA→AAA)	0.084	0.000	0.000	0.000	0.000
metL→	C→T	A681V (GCG→GTG)	0.000	0.000	0.226	0.000	0.000