Table 3.
Transmembrane/cytoplasmic proteins | Periplasmic/outer membrane proteins cloned in both the BACHT and the BACHT-TM system | Periplasmic proteins cloned only in the BACHT-TM system | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
T18TraCN | TraCNT18 | T18TraBN TT18 |
T18TraEN | TraGNT18 | TraLNT18 | T18AtlAN | TM18AtlAN | AtlANTT18 | T18TraHN | TM18TraHN | T18TraKN | TM18TraKN | T18TraNN | TM18TraNN | T18TraUN | TM18TraUN | T18TraVN | TM18TraVN | TM18DsbCN | TM18LtgXN | TM18TraFN | TM18TraWN | TM18TrbCN | TM18YagN | ||
Transmembrane/cytoplasmic proteins | T25TraCN | − | + | − | − | − | − | |||||||||||||||||||
TraCNT25 | + | − | − | − | − | − | ||||||||||||||||||||
T25TraBN | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | + | − | − | − | − | − | + | + | − | − | + | w | − | |
T25TraEN | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
TraGN T25 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
TraLNT25 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
Periplasmic/outer membrane proteins cloned in both the BACHT and the BACHT-TM system | T25AtlAN | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||||
TM25AtlAN | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |||
AtlANT25 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |||||||||
T25TraHN | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |||||||||
TM25TraHN | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | + | − | − | |||
T25TraKN | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | |||||||||
TM25TraKN | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |||
T25TraNN | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |||||||||
TM25TraNN | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |||
T25TraUN | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |||||||||
TM25TraUN | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | |||
T25TraVN | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | |||||||||
TM25TraVN | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | |||
Periplasmic proteins cloned only in the BACHT-TM system | TM25DsbCN | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | |||||||||
TM25LtgXN | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||||||||||
TM25TraFN | − | − | − | − | − | + | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | ||||||||||
TM25TraWN | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | − | ||||||||||
TM25TrbCN | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | ||||||||||
TM25YagN | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
+, −, and w indicate respectively interaction, no interaction, and weak interaction. Space indicates that the interaction was not tested. The placement of T18 and T25 relative to the protein name indicates N or C-terminal fusion. T18 or T25 indicate that the gene encoding the protein was cloned into the BACTH vectors. TM18 or TM25 indicates that the gene encoding the protein was cloned into the BACTH-TM vectors.