Table 5.
MHC-I restricted T-cell epitopes | Positively charged | Negatively charged | Polarity | Non polarity | Aliphaticity | Aromaticity | Acidicity | Basicity | Hydrophobicity | Hydrophilicity | Neutral | Hydroxylic | Sulphur content |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
STFISDEVAR | 0.1 | 0.2 | 0.3 | 0.4 | 0.3 | 0.1 | 0.2 | 0.1 | 0.5 | 0.1 | 0.5 | 0.3 | 0 |
DTFCAGSTF | 0 | 0.111 | 0.444 | 0.444 | 0.222 | 0.222 | 0.111 | 0 | 0.667 | 0 | 0.556 | 0.333 | 0.111 |
YTPSKLIEY | 0.111 | 0.111 | 0.444 | 0.333 | 0.333 | 0.222 | 0.111 | 0.111 | 0.444 | 0.222 | 0.333 | 0.222 | 0 |
FSAVGNICY | 0 | 0 | 0.333 | 0.556 | 0.444 | 0.222 | 0 | 0 | 0.556 | 0.111 | 0.222 | 0.111 | 0.111 |
TVYDDGARR | 0.222 | 0.222 | 0.222 | 0.333 | 0.333 | 0.111 | 0.222 | 0.222 | 0.333 | 0.222 | 0.444 | 0.111 | 0 |
ILMTARTVY | 0.111 | 0 | 0.333 | 0.556 | 0.444 | 0.111 | 0 | 0.111 | 0.778 | 0.111 | 0.222 | 0.222 | 0.111 |
TTAAKLMVV | 0.111 | 0 | 0.222 | 0.667 | 0.556 | 0 | 0 | 0.111 | 0.889 | 0.111 | 0.222 | 0.222 | 0.111 |
NIIPLTTAAK | 0.1 | 0 | 0.2 | 0.6 | 0.6 | 0 | 0 | 0.1 | 0.8 | 0.3 | 0.2 | 0.2 | 0 |
VENPDILRVY | 0.1 | 0.2 | 0.1 | 0.5 | 0.5 | 0.1 | 0.2 | 0.1 | 0.5 | 0.3 | 0.2 | 0 | 0 |
RVYANLGER | 0.222 | 0.111 | 0.111 | 0.444 | 0.444 | 0.111 | 0.111 | 0.222 | 0.333 | 0.333 | 0.222 | 0 | 0 |
DTDFVNEFY | 0 | 0.333 | 0.222 | 0.333 | 0.111 | 0.333 | 0.333 | 0 | 0.444 | 0.111 | 0.444 | 0.111 | 0 |
YVFTGYRVTK | 0.2 | 0 | 0.4 | 0.4 | 0.3 | 0.3 | 0 | 0.2 | 0.5 | 0.2 | 0.3 | 0.2 | 0 |
KVNSTLEQY | 0.111 | 0.111 | 0.444 | 0.222 | 0.222 | 0.111 | 0.111 | 0.111 | 0.333 | 0.222 | 0.444 | 0.222 | 0 |
IPARARVECF | 0.2 | 0.1 | 0.1 | 0.6 | 0.5 | 0.1 | 0.1 | 0.2 | 0.7 | 0.3 | 0.1 | 0 | 0.1 |
KSAQCFKMF | 0.222 | 0 | 0.333 | 0.444 | 0.111 | 0.222 | 0 | 0.222 | 0.556 | 0.222 | 0.222 | 0.111 | 0.222 |
KSAQCFKMFY | 0.2 | 0 | 0.4 | 0.4 | 0.1 | 0.3 | 0 | 0.2 | 0.5 | 0.2 | 0.2 | 0.1 | 0.2 |
DAPAHISTI | 0.111 | 0.111 | 0.222 | 0.556 | 0.556 | 0 | 0.111 | 0.111 | 0.667 | 0.222 | 0.333 | 0.222 | 0 |
NTVIWDYKR | 0.222 | 0.111 | 0.222 | 0.333 | 0.222 | 0.222 | 0.111 | 0.222 | 0.444 | 0.333 | 0.222 | 0.111 | 0 |
KYTQLCQYL | 0.111 | 0 | 0.667 | 0.222 | 0.222 | 0.222 | 0 | 0.111 | 0.444 | 0.111 | 0.333 | 0.111 | 0.111 |
EILPVSMTK | 0.111 | 0.111 | 0.222 | 0.556 | 0.444 | 0 | 0.111 | 0.111 | 0.667 | 0.222 | 0.333 | 0.222 | 0.111 |
ALNTLVKQL | 0.111 | 0 | 0.222 | 0.556 | 0.556 | 0 | 0 | 0.111 | 0.667 | 0.222 | 0.222 | 0.111 | 0 |
NAQALNTLV | 0 | 0 | 0.222 | 0.556 | 0.556 | 0 | 0 | 0 | 0.667 | 0.222 | 0.222 | 0.111 | 0 |
FTSDYYQLY | 0 | 0.111 | 0.667 | 0.222 | 0.111 | 0.444 | 0.111 | 0 | 0.333 | 0 | 0.444 | 0.222 | 0 |
YYQLYSTQL | 0 | 0 | 0.778 | 0.222 | 0.222 | 0.333 | 0 | 0 | 0.333 | 0 | 0.444 | 0.222 | 0 |
KLLEQWNLV | 0.111 | 0.111 | 0.111 | 0.556 | 0.444 | 0.111 | 0.111 | 0.111 | 0.556 | 0.222 | 0.222 | 0 | 0 |
LVIGFLFLTW | 0 | 0 | 0.1 | 0.9 | 0.6 | 0.3 | 0 | 0 | 0.9 | 0 | 0.2 | 0.1 | 0 |
SSDNIALLV | 0 | 0.111 | 0.222 | 0.556 | 0.556 | 0 | 0.111 | 0 | 0.556 | 0.111 | 0.333 | 0.222 | 0 |
SSSDNIALL | 0 | 0.111 | 0.333 | 0.444 | 0.444 | 0 | 0.111 | 0 | 0.444 | 0.111 | 0.444 | 0.333 | 0 |
GYYRRATRR | 0.444 | 0 | 0.333 | 0.222 | 0.222 | 0.222 | 0 | 0.444 | 0.222 | 0.444 | 0.222 | 0.111 | 0 |
IGYYRRATR | 0.333 | 0 | 0.333 | 0.333 | 0.333 | 0.222 | 0 | 0.333 | 0.333 | 0.333 | 0.222 | 0.111 | 0 |