Table 6.
List of physico-chemical properties of MHC-II restricted T-cell epitopes.
MHC-I restricted T-cell epitopes | Positively charged | Negatively charged | Polarity | Non polarity | Aliphaticity | Aromaticity | Acidicity | Basicity | Hydrophobicity | Hydrophilicity | Neutral | Hydroxylic | Sulphur content |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
FCAGSTFISDEVARD | 0.067 | 0.2 | 0.267 | 0.467 | 0.333 | 0.133 | 0.2 | 0.067 | 0.533 | 0.067 | 0.467 | 0.2 | 0.067 |
DTFCAGSTFISDEVA | 0 | 0.2 | 0.333 | 0.467 | 0.333 | 0.133 | 0.2 | 0 | 0.6 | 0 | 0.533 | 0.267 | 0.067 |
VGNICYTPSKLIEYT | 0.067 | 0.067 | 0.4 | 0.4 | 0.4 | 0.133 | 0.067 | 0.067 | 0.533 | 0.2 | 0.333 | 0.2 | 0.067 |
ASAVVLLILMTARTV | 0.067 | 0 | 0.2 | 0.733 | 0.667 | 0 | 0 | 0.067 | 0.867 | 0.067 | 0.2 | 0.2 | 0.067 |
LNIIPLTTAAKLMVV | 0.067 | 0 | 0.133 | 0.733 | 0.667 | 0 | 0 | 0.067 | 0.867 | 0.2 | 0.133 | 0.133 | 0.067 |
ILRVYANLGERVRQA | 0.2 | 0.067 | 0.133 | 0.533 | 0.533 | 0.067 | 0.067 | 0.2 | 0.467 | 0.267 | 0.2 | 0 | 0 |
RNRDVDTDFVNEFYA | 0.133 | 0.267 | 0.133 | 0.333 | 0.2 | 0.2 | 0.267 | 0.133 | 0.4 | 0.267 | 0.333 | 0.067 | 0 |
YRNRDVDTDFVNEFY | 0.333 | 0.067 | 0.267 | 0.333 | 0.133 | 0.2 | 0.067 | 0.333 | 0.4 | 0.333 | 0.2 | 0.067 | 0.133 |
NYVFTGYRVTKNSKV | 0.2 | 0 | 0.333 | 0.333 | 0.267 | 0.2 | 0 | 0.2 | 0.4 | 0.333 | 0.267 | 0.2 | 0 |
ECFDKFKVNSTLEQY | 0.133 | 0.2 | 0.333 | 0.267 | 0.133 | 0.2 | 0.2 | 0.133 | 0.4 | 0.2 | 0.4 | 0.133 | 0.067 |
KCSRIIPARARVECF | 0.267 | 0.067 | 0.2 | 0.467 | 0.4 | 0.067 | 0.067 | 0.267 | 0.6 | 0.333 | 0.133 | 0.067 | 0.133 |
AHKDKSAQCFKMFYK | 0.333 | 0.067 | 0.267 | 0.333 | 0.133 | 0.2 | 0.067 | 0.333 | 0.4 | 0.333 | 0.2 | 0.067 | 0.133 |
IWDYKRDAPAHISTI | 0.2 | 0.133 | 0.2 | 0.467 | 0.4 | 0.133 | 0.133 | 0.2 | 0.533 | 0.267 | 0.267 | 0.133 | 0 |
WDYKRDAPAHISTIG | 0.2 | 0.133 | 0.2 | 0.467 | 0.4 | 0.133 | 0.133 | 0.2 | 0.467 | 0.267 | 0.333 | 0.133 | 0 |
PKGIMMNVAKYTQLC | 0.133 | 0 | 0.267 | 0.533 | 0.4 | 0.067 | 0 | 0.133 | 0.6 | 0.267 | 0.2 | 0.067 | 0.2 |
PVSMTKTSVDCTMYI | 0.067 | 0.067 | 0.467 | 0.4 | 0.267 | 0.067 | 0.067 | 0.067 | 0.667 | 0.133 | 0.4 | 0.333 | 0.2 |
TEILPVSMTKTSVDC | 0.067 | 0.133 | 0.4 | 0.4 | 0.333 | 0 | 0.133 | 0.067 | 0.667 | 0.133 | 0.467 | 0.333 | 0.133 |
QDVVNQNAQALNTLV | 0 | 0.067 | 0.267 | 0.467 | 0.467 | 0 | 0.067 | 0 | 0.533 | 0.2 | 0.333 | 0.067 | 0 |
DVVNQNAQALNTLVK | 0.067 | 0.067 | 0.2 | 0.467 | 0.467 | 0 | 0.067 | 0.067 | 0.533 | 0.267 | 0.267 | 0.067 | 0 |
LHSYFTSDYYQLYST | 0.067 | 0.067 | 0.667 | 0.2 | 0.133 | 0.333 | 0.067 | 0.067 | 0.333 | 0.067 | 0.467 | 0.333 | 0 |
HSYFTSDYYQLYSTQ | 0.067 | 0.067 | 0.733 | 0.133 | 0.067 | 0.333 | 0.067 | 0.067 | 0.267 | 0.067 | 0.533 | 0.333 | 0 |
WNLVIGFLFLTWICL | 0 | 0 | 0.133 | 0.8 | 0.533 | 0.267 | 0 | 0 | 0.867 | 0.067 | 0.133 | 0.067 | 0.067 |
NYKLNTDHSSSSDNI | 0.133 | 0.133 | 0.4 | 0.133 | 0.133 | 0.067 | 0.133 | 0.133 | 0.2 | 0.333 | 0.467 | 0.333 | 0 |
IGYYRRATRRIRGGD | 0.333 | 0.067 | 0.2 | 0.4 | 0.4 | 0.133 | 0.067 | 0.333 | 0.267 | 0.333 | 0.333 | 0.067 | 0 |