Skip to main content
. 2021 Apr 2;92:104823. doi: 10.1016/j.meegid.2021.104823

Table 6.

List of physico-chemical properties of MHC-II restricted T-cell epitopes.

MHC-I restricted T-cell epitopes Positively charged Negatively charged Polarity Non polarity Aliphaticity Aromaticity Acidicity Basicity Hydrophobicity Hydrophilicity Neutral Hydroxylic Sulphur content
FCAGSTFISDEVARD 0.067 0.2 0.267 0.467 0.333 0.133 0.2 0.067 0.533 0.067 0.467 0.2 0.067
DTFCAGSTFISDEVA 0 0.2 0.333 0.467 0.333 0.133 0.2 0 0.6 0 0.533 0.267 0.067
VGNICYTPSKLIEYT 0.067 0.067 0.4 0.4 0.4 0.133 0.067 0.067 0.533 0.2 0.333 0.2 0.067
ASAVVLLILMTARTV 0.067 0 0.2 0.733 0.667 0 0 0.067 0.867 0.067 0.2 0.2 0.067
LNIIPLTTAAKLMVV 0.067 0 0.133 0.733 0.667 0 0 0.067 0.867 0.2 0.133 0.133 0.067
ILRVYANLGERVRQA 0.2 0.067 0.133 0.533 0.533 0.067 0.067 0.2 0.467 0.267 0.2 0 0
RNRDVDTDFVNEFYA 0.133 0.267 0.133 0.333 0.2 0.2 0.267 0.133 0.4 0.267 0.333 0.067 0
YRNRDVDTDFVNEFY 0.333 0.067 0.267 0.333 0.133 0.2 0.067 0.333 0.4 0.333 0.2 0.067 0.133
NYVFTGYRVTKNSKV 0.2 0 0.333 0.333 0.267 0.2 0 0.2 0.4 0.333 0.267 0.2 0
ECFDKFKVNSTLEQY 0.133 0.2 0.333 0.267 0.133 0.2 0.2 0.133 0.4 0.2 0.4 0.133 0.067
KCSRIIPARARVECF 0.267 0.067 0.2 0.467 0.4 0.067 0.067 0.267 0.6 0.333 0.133 0.067 0.133
AHKDKSAQCFKMFYK 0.333 0.067 0.267 0.333 0.133 0.2 0.067 0.333 0.4 0.333 0.2 0.067 0.133
IWDYKRDAPAHISTI 0.2 0.133 0.2 0.467 0.4 0.133 0.133 0.2 0.533 0.267 0.267 0.133 0
WDYKRDAPAHISTIG 0.2 0.133 0.2 0.467 0.4 0.133 0.133 0.2 0.467 0.267 0.333 0.133 0
PKGIMMNVAKYTQLC 0.133 0 0.267 0.533 0.4 0.067 0 0.133 0.6 0.267 0.2 0.067 0.2
PVSMTKTSVDCTMYI 0.067 0.067 0.467 0.4 0.267 0.067 0.067 0.067 0.667 0.133 0.4 0.333 0.2
TEILPVSMTKTSVDC 0.067 0.133 0.4 0.4 0.333 0 0.133 0.067 0.667 0.133 0.467 0.333 0.133
QDVVNQNAQALNTLV 0 0.067 0.267 0.467 0.467 0 0.067 0 0.533 0.2 0.333 0.067 0
DVVNQNAQALNTLVK 0.067 0.067 0.2 0.467 0.467 0 0.067 0.067 0.533 0.267 0.267 0.067 0
LHSYFTSDYYQLYST 0.067 0.067 0.667 0.2 0.133 0.333 0.067 0.067 0.333 0.067 0.467 0.333 0
HSYFTSDYYQLYSTQ 0.067 0.067 0.733 0.133 0.067 0.333 0.067 0.067 0.267 0.067 0.533 0.333 0
WNLVIGFLFLTWICL 0 0 0.133 0.8 0.533 0.267 0 0 0.867 0.067 0.133 0.067 0.067
NYKLNTDHSSSSDNI 0.133 0.133 0.4 0.133 0.133 0.067 0.133 0.133 0.2 0.333 0.467 0.333 0
IGYYRRATRRIRGGD 0.333 0.067 0.2 0.4 0.4 0.133 0.067 0.333 0.267 0.333 0.333 0.067 0