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. 2021 Feb 20;296:100444. doi: 10.1016/j.jbc.2021.100444

Table 1.

Steady-state kinetic analysis of insertion opposite to N6-dA-cross-linked 15-mer peptide

5′-FAM-GGTGGTCCATAAAC
3′-CCACCAGGTATTTGXCTCT-5′
Polymerase X dNTP Km, μM kcat, min−1 kcat/Km, μM−1 min−1 fa
hPol η dA dATP 3.5 ± 1.4 1.7 ± 0.2 0.49 ± 0.15 0.035
dTTP 1.7 ± 0.3 24.5 ± 1.2 14.1 ± 2.4 1
dCTP 3.7 ± 0.6 1.4 ± 0.07 0.39 ± 0.05 0.027
dGTP 14.5 ± 2.4 2.9 ± 0.13 0.21 ± 0.03 0.015
N6-dA-peptide dATP 8.5 ± 2.5 1.2 ± 0.1 0.140 ± 0.03 0.099
dTTP 17 ± 3.4 24 ± 1.4 1.4 ± 0.2 1
dCTP 3 ± 0.5 0.9 ± 0.04 0.32 ± 0.04 0.231
dGTP 20 ± 2 1.5 ± 0.02 0.074 ± 0.006 0.053
hPol ⍳ dA dTTP 3 ± 1 0.9 ± 0.06 0.23 ± 0.08 1
N6-dA-peptide dTTP 2 ± 1.2 0.5 ± 0.05 0.28 ± 0.16 1
hPol κ dA dTTP 1.5 ± 0.3 3.2 ± 0.23 2.03 ± 0.34 1
N6-dA-peptide dTTP 9.5 ± 4.8 0.09 ± 0.008 0.009 ± 0.004 1
a

Misincorporation frequency (f) = (kcat/Km)incorrect/(kcat/Km)correct.