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. 2021 Apr 16;15(4):e0009290. doi: 10.1371/journal.pntd.0009290

Table 1. Epidemiological data for the sequenced samples.

ID Sample type Date onset symptoms Collection date Age Sex State Municipality Ct value Reads Coverage (%) Acession Number
CB08 Serum 2018-02-23 2018-02-23 33 F MT Cuiaba 18,59 900 43,70 MN428504
CB04 Serum 2018-05-18 2018-05-21 22 F MT Cuiaba 30,98 4318 52,60 MN428505
CB09 Serum 2018-01-29 2018-02-01 23 F MT Cuiaba 19,66 291904 93,60 MN428506
CB10 Serum 2018-07-03 2018-07-05 29 F MT Cuiaba 26,88 620828 82,70 MN428507
CB12 Serum 2018-04-25 2018-04-27 22 F MT Cuiaba 30,65 175360 78,60 MN428508
CB17 Serum 2018-03-11 2018-03-13 27 M MT Cuiaba 22,16 99926 83,90 MN428509
CB18 Serum 2018-04-24 2018-04-25 43 M MT Cuiaba 27,38 554552 79,90 MN428510
CB16 Serum 2018-04-12 2018-04-18 31 F MT Cuiaba 19,87 577642 85,10 MN428511
CB22 Serum 2018-03-10 2018-03-13 26 M MT Cuiaba 28,33 147381 88,50 MN428512
CB19 Serum 2018-04-05 2018-04-26 37 F MT Cuiaba 24,93 514308 82,70 MN428513
CB23 Serum 2018-03-13 2018-03-13 30 F MT Cuiaba 23,62 278973 53,00 MN428514
CB24 Serum 2018-03-18 2018-03-20 62 F MT Cuiaba 20,31 235010 93,50 MN428515
CB26 Serum 2018-03-21 2018-03-23 22 F MT Cuiaba 24,08 4167 86,50 MN428516
CB27 Serum 2018-03-15 2018-03-17 40 F MT Cuiaba 29,33 6855 84,10 MN428517
CB28 Serum 2018-03-07 2018-03-08 19 F MT Cuiaba 20,07 4391 89,40 MN428518
CB29 Serum 2018-03-15 2018-03-16 20 F MT Cuiaba 20,96 6384 88,20 MN428519
CB31 Serum 2018-03-08 2018-03-09 31 F MT Cuiaba 29,22 7537 85,20 MN428520
CB32 Serum 2018-03-16 2018-03-16 29 F MT Cuiaba 21,22 6010 87,10 MN428521
CB30 Serum 2018-03-07 2018-03-08 24 F MT Cuiaba 31,21 9104 83,50 MN428522
CB33 Serum 2018-03-08 2018-03-08 31 F MT Cuiaba 22,16 4753 89,40 MN428523
CB34 Serum 2018-03-05 2018-03-06 34 F MT Cuiaba 22,25 6554 86,50 MN428524
CB35 Serum 2018-03-05 2018-03-06 24 F MT Cuiaba 25,24 4454 89,40 MN428525
CB36 Serum 2018-03-06 2018-03-06 16 F MT Cuiaba 21,42 8795 86,40 MN428526
CB37 Serum 2018-03-05 2018-03-06 23 F MT Cuiaba 26,95 3957 89,40 MN428527

Ct = RT-qPCR quantification cycle threshold value.