Skip to main content
. 2021 Apr 23;13:32. doi: 10.1186/s13321-021-00505-3

Table 1.

Extended n-ary similarity indices

Additive indices
Label Type Notation Name Equation
eAC eAC_1 eACw

extended

Austin-Colwell

seAC1s_wd=2πarcsin1-sfsΔn(k)Cn(k)+0-sfsΔn(k)Cn(k)sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eACnw seAC1s_d=2πarcsin1-sfsΔn(k)Cn(k)+0-sfsΔn(k)Cn(k)sCn(k)+dCn(k)
eBUB eBUB_1 eBUBw

extended

Baroni-Urbani-Buser

seBUB1s_wd=1-sfsΔn(k)Cn(k)0-sfsΔn(k)Cn(k)+1-sfsΔn(k)Cn(k)1-sfsΔnkCnk0-sfsΔnkCnk+1-sfsΔnkCnk+dfdΔnkCnk
eBUBnw seBUB1s_d=1-sfsΔn(k)Cn(k)0-sfsΔn(k)Cn(k)+1-sfsΔn(k)Cn(k)1-sCnk0-sCnk+1-sCnk+dCnk
eCT1 eCT1_1 eCT1w

extended

Consoni-Todeschini (1)

seCT11s_wd=ln1+1-sfsΔn(k)Cn(k)+0-sfsΔn(k)Cn(k)ln1+sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eCT1nw seCT11s_d=ln1+1-sfsΔn(k)Cn(k)+0-sfsΔn(k)Cn(k)ln1+sCn(k)+dCn(k)
eCT2 eCT2_1 eCT2w

extended

Consoni-Todeschini (2)

seCT21s_wd=ln1+sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)-ln1+dfdΔn(k)Cn(k)ln1+sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eCT2nw seCT21s_d=ln1+sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)-ln1+dfdΔn(k)Cn(k)ln1+sCn(k)+dCn(k)
eFai eFai_1 eFaiw

extended

Faith

seFai1s_wd=1-sfsΔn(k)Cn(k)+0.50-sfsΔn(k)Cn(k)sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eFainw seFai1s_d=1-sfsΔn(k)Cn(k)+0.50-sfsΔn(k)Cn(k)sCn(k)+dCn(k)
eGK eGK_1 eGKw

extended

Goodman–Kruskal

seGK1s_wd=2min1-sfsΔn(k)Cn(k),0-sfsΔn(k)Cn(k)-dfdΔn(k)Cn(k)2min1-sfsΔn(k)Cn(k),0-sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eGKnw seGK1s_d=2min1-sfsΔn(k)Cn(k),0-sfsΔn(k)Cn(k)-dfdΔn(k)Cn(k)2min1-sCn(k),0-sCn(k)+dCn(k)
eHD eHD_1 eHDw

extended

Hawkins-Dotson

seHD1s_wd=121-sfsΔn(k)Cn(k)1-sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)+0-sfsΔn(k)Cn(k)0-sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eHDnw seHD1s_d=121-sfsΔn(k)Cn(k)1-sCn(k)+dCn(k)+0-sfsΔn(k)Cn(k)0-sCn(k)+dCn(k)
eRT eRT_1 eRTw

extended

Rogers-Tanimoto

seRT1s_wd=sfsΔn(k)Cn(k)sfsΔn(k)Cn(k)+2dfdΔn(k)Cn(k)
eRTnw seRT1s_d=sfsΔn(k)Cn(k)sCn(k)+2dCn(k)
eRG eRG_1 eRGw

extended

Rogot-Goldberg

seRG1s_wd=1-sfsΔn(k)Cn(k)21-sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)+0-sfsΔn(k)Cn(k)20-sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eRGnw seRG1s_d=1-sfsΔn(k)Cn(k)21-sCn(k)+dCn(k)+0-sfsΔn(k)Cn(k)20-sCn(k)+dCn(k)
eSM eSM_1 eSMw

extended

Simple matching,

Sokal-Michener

seSM1s_wd=sfsΔn(k)Cn(k)sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eSMnw seSM1s_d=sfsΔn(k)Cn(k)sCn(k)+dCn(k)
eSS2 eSS2_1 eSS2w

extended

Sokal-Sneath (2)

seSS21s_wd=2sfsΔn(k)Cn(k)2sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eSS2nw seSS21s_wd=2sfsΔn(k)Cn(k)2sCn(k)+dCn(k)
Asymmetric indices
Label Type Notation Name Equation
eCT3 eCT3_1 eCT3w

extended

Consoni-Todeschini (3)

seCT31s_wd=ln1+1-sfsΔn(k)Cn(k)ln1+sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eCT3nw seCT31s_d=ln1+1-sfsΔn(k)Cn(k)ln1+sCn(k)+dCn(k)
eCT3_0 eCT30w seCT3s_wd=ln1+sfsΔn(k)Cn(k)ln1+sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eCT30nw seCT3s_d=ln1+sfsΔn(k)Cn(k)ln1+sCn(k)+dCn(k)
eCT4 eCT4_1 eCT4w

extended

Consoni-Todeschini (4)

seCT41s_wd=ln1+1-sfsΔn(k)Cn(k)ln1+1-sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eCT4nw seCT41s_d=ln1+1-sfsΔn(k)Cn(k)ln1+1-sCn(k)+dCn(k)
eCT4_0 eCT40w seCT4s_wd=ln1+sfsΔn(k)Cn(k)ln1+sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eCT4nw seCT4s_d=ln1+sfsΔn(k)Cn(k)ln1+sCn(k)+dCn(k)
eGle eGle_1 eGlew

extended

Gleason

seGle1s_wd=21-sfsΔn(k)Cn(k)21-sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eGlenw seGle1s_d=21-sfsΔn(k)Cn(k)21-sCn(k)+dCn(k)
eGle_0 eGle0w seGles_wd=2sfsΔn(k)Cn(k)2sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eGle0nw seGles_d=2sfsΔn(k)Cn(k)2sCn(k)+dCn(k)
eJa eJa_1 eJaw

extended

Jaccard

seJa1s_wd=31-sfsΔn(k)Cn(k)31-sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eJanw seJa1s_d=31-sfsΔn(k)Cn(k)31-sCn(k)+dCn(k)
eJa_0 eJa0w seJas_wd=3sfsΔn(k)Cn(k)3sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eJa0nw seJas_d=3sfsΔn(k)Cn(k)3sCn(k)+dCn(k)
eRR eRR_1 eRRw

extended

Russel-Rao

seRR1s_wd=1-sfsΔn(k)Cn(k)sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eRRnw seRR1s_d=1-sfsΔn(k)Cn(k)sCn(k)+dCn(k)
eRR_0 eRR0w seRRs_wd=sfsΔn(k)Cn(k)sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eRR0nw seRRs_d=sfsΔn(k)Cn(k)sCn(k)+dCn(k)
eSS1 eSS1_0 eSSw

extended

Sokal-Sneath (1)

seSS11s_wd=1-sfsΔn(k)Cn(k)1-sfsΔn(k)Cn(k)+2dfdΔn(k)Cn(k)
eSSnw seSS11s_d=1-sfsΔn(k)Cn(k)1-sCn(k)+2dCn(k)
eSS1_1 eSS0w seSS1s_wd=sfsΔn(k)Cn(k)sfsΔn(k)Cn(k)+2dfdΔn(k)Cn(k)
eSS0nw seSS1s_d=sfsΔn(k)Cn(k)sCn(k)+2dCn(k)
eJT eJT_1 eJTw

extended

Jaccard-Tanimoto

seJT1s_wd=1-sfsΔn(k)Cn(k)1-sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eJTnw seJT1s_d=1-sfsΔn(k)Cn(k)1-sCn(k)+dCn(k)
eJT_0 eJT0w seJTs_wd=sfsΔn(k)Cn(k)sfsΔn(k)Cn(k)+dfdΔn(k)Cn(k)
eJT0nw seJTs_d=sfsΔn(k)Cn(k)sCn(k)+dCn(k)