TABLE 3.

Mean detection limit of classifiers at select false detection rates.

	High ANI				Moderate ANI				Low ANI
Classifier	0.1%	1%	5%	10%	0.1%	1%	5%	10%	0.1%	1%	5%	10%
MCP	0.0068	0.0016	0	0	0.069	0.048	0.0027	0	0.52	0.52	0.069	0.014
Unfiltered MCP	0.25	0.23	0.023	0.011	0.23	0.21	0.056	0.025	0.98	0.98	0.26	0.079
MCP w/ MGDB	0.014	0.00097	0	0	0.17	0.14	0	0	1.5	1.5	0.037	0.0039
Ganon	0.30	0.27	0.045	0.021	0.38	0.35	0.095	0.046	2.2	2.2	1.1	0.62
Kraken	0.39	0.37	0.097	0.038	0.51	0.47	0.18	0.10	2.6	2.6	2.2	0.9
Bracken	0.41	0.38	0.11	0.042	0.58	0.54	0.21	0.11	2.9	2.9	2.6	1.1
MetaCache	0.36	0.33	0.049	0.021	0.49	0.43	0.098	0.037	2.7	2.7	2.2	0.55
Centrifuge	0.25	0.22	0.026	0.012	0.49	0.45	0.16	0.061	5.5	5.5	5.3	4.6
DIAMOND-LCA	0.14	0.13	0.042	0.018	0.15	0.15	0.053	0.032	0.33	0.33	0.3	0.12
Kaiju	0.27	0.24	0.085	0.032	0.62	0.60	0.12	0.061	1.8	1.8	1.5	0.56
mOTUs	4.0	3.9	0.13	0	2.6	2.6	0.7	0.041	19	19	18	10
MetaPhlAn	2.3	2.3	0.43	0.0094	2.9	2.9	1.6	0.063	2.5	2.5	0.96	0.15