TABLE 3.
Oligonucleotides used in this study
| Primer | Sequence (5′–3′) |
|---|---|
| Del1 | ACTAGTGATGGGCAGTGGTGACGACGAC |
| Del2 | AAGCTTCTCAGAACGCTCTGACTCACCCA |
| Del3 | TCTAGAGCTATTGATACCGAGTCCAACCTCG |
| Del4 | GGTACCGGCTTGTCCGGGCAACGT |
| mpa-c1 | GGTCTGCCTAGACAATTGCCAGC |
| P2 | CTGCACGACTTCGAGGTGTTCGA |
| Compl1 | GAATTCCATATGGGTGAGTCAGAGCGTTCTGAG |
| Compl2 | GGATCCAAGCTTCTACAGGTACTGGCCGAGGTTGG |
| MTBpup1 | GAATTCATGGCGCAAGAGCAGACCAAGCGT |
| MTBpup2 | AAGCTTGATCGGGCAACGGCCAGGTCA |
| MTBprcB1 | GAATTCATGACCTGGCCGTTGCCCGATC |
| MTBprcA2 | AAGCTTCGTCGGACTTTCGGACTCAGC |
| c1 | GAATTCCATATGGCTCAGGAGCAGACCAAGCG |
| c2 | GGATCCAAGCTTCTATTCGGTGGGTTTGTCGCCTGA |
| c3 | GAATTCCATATGCAGCGACGAATCATGGGCATC |
| c4 | GGATCCAAGCTTCACATACTGGCGATCAGCCGCTT |
| MSpupBA1 | GAATTCCATATGGCTCAGGAGCAGACCAAGCG |
| MSpupBA2 | GGATCCAAGCTTCTATTCGGTGGGTTTGTCGCCTGA |
| ms-Del1 | ACTAGTGGTCACCGAGCAGCAAGTGC |
| ms-Del2 | AAGCTTGGAGAACGAGGACAGGTCCAC |
| ms-Del3 | TCTAGACCGAATAGTCGCGTCAGGACG |
| ms-Del4 | GGTACCGATCCTGAGCCTGGACTCCGAT |
| conf1 | GCTGCAACGCATCTACCTCGAC |
| conf2 | TGTGGTTGCTGCTGCGCTTCGA |
| dfrA1 | GAATTCCATATGGTGGGGCTGATCTGGGCTC |
| dfrA2 | AAGCTTCTCATGAGCGGTGGTAGCTGTAC |
| P1 | GTTGGACTCGGTGCCGGTCA |
| P2 | GCCGGTGGCCAACACCTTAAC |
| P3 | CCTGGTATCTTTATAGTCCTGTCG |
| P4 | GAGGAACTGGCGCAGTTCCTCTGG |
| Log-Oligoa | ATGTGAAAGAAGGACAGGACCGCCAGTGGGCGGTGTGTGTGTACTGCGCGTCGGGA CCGACGCATGGTTTGTCTGGTCAACCACCGCGGTCTCAGTGGTGTACGGTACAAACC CCATGGACAGCCTGGTGGTGGTCGACAACGTCGAGGCCGCGCTCGAGGCGTGCGCG CCCGAGTAG |
a
Int sequence is underlined.