Primer	Sequence 5’-3’	Annealing temperature (T)/extension time (time)
Ltn1-F-deletion	TAAGCCATCAAAAAAAGTTCAAGCAATAGTTGGTTCTTAATGCGTACGCTGCAGGTCGAC	T = 54 °C/Time = 3 min
Ltn1-R-deletion	AAATGTCGTACATTTATATGAAATTTATATGCGATAGTCTAATCGATGAATTCGAGCTCG
Ltn1F1	GGAGAGGTCTCCGGTTCGATTCC	T = 60 °C/Time = 1 min
KanB	CTGCAGCGAGGAGCCGTAAT
Ltn1F1	GGAGAGGTCTCCGGTTCGATTCC	T = 56 °C/Time = 1 min
Ltn1R1	CAGTTTAGCATATATCTGCGACCAACA
Ltn1C	TAACAAATATCCAAGTTAATGGCGT	T = 54 °C/Time = 1 min
Ltn1D	GAACAATTGAGAGAATGAAAAAGGA
KanF1	TATGGAACTGCCTCGGTGAG	T = 54 °C/Time = 1 min
Ltn1D	GAACAATTGAGAGAATGAAAAAGGA
Asc1-F-deletion	CCAAAAAATCCTTATAACACACTAAAGTAAATAAAGTGAAAAATGCGTACGCTGCAGGTC	T = 54 °C/Time = 3 min
Asc1-R-deletion	CTAGAAGATACATAAAAGAACAAATGAACTTTATACATATTCTTAATCGATGAATTCGAG
Asc1F1	CCTGGCCATCTGTAGCCTTA	T = 54 °C/Time = 1 min
KanB	CTGCAGCGAGGAGCCGTAAT
Asc1F1	CCTGGCCATCTGTAGCCTTA	T = 54 °C/Time = 1 min
Asc1R1	TGGCAACATCCCATAATCTCAAGG
Asc1F2	GGACGGTGAAATTATGTTGTGG	T = 54 °C/Time = 1 min
Asc1R2	CGCAGCAAACAGAAAGCATAG
KanF1	TATGGAACTGCCTCGGTGAG	T = 54 °C/Time = 1 min
Asc1R2	CGCAGCAAACAGAAAGCATAG
Hel2-F-deletion	TCGAAAAAATAGTGGCTATACTTCTTTTGAAGAATTAGGATGCGTACGCTGCAGGTCGAC	T = 54 °C/Time = 3 min
Hel2-R-deletion	ATGCTATTGTCAGTTACAGGTTAGAAATATATTTCCAACTAATCGATGAATTCGAGCTCG
Hel2A	AGTGACCTCGTTATACATATCCCTG	T = 54 °C/Time = 1 min
KanB	CTGCAGCGAGGAGCCGTAAT
Hel2A	AGTGACCTCGTTATACATATCCCTG	T = 54 °C/Time = 1 min
Hel2B	AAAGTCACAAACTTGTTCATCCTTC
Hel2C	TTGAAAAGTCTCAACCTACCTCAAC	T = 54 °C/Time = 1 min
Hel2D	ATTTTGTTGGAGTTGTCTTATGAGC
Rqc2-F-deletion	TTATCCGGTCTAAGAAGTCAGGCAGGCAAGAGATTAATAGCGATGCGTACGCTGCAGGTCGAC	T = 54 °C/Time = 3 min
Rqc2-R-deletion	AAAATTATAATTGCTGTCTATTTTCTTTTCATCTCATATGATTTATCGATGAATTCGAGCTCG
Rqc2A	TCTGTGGTTACGATTAAAATTGGAT	T = 54 °C/Time = 1 min
KanB	CTGCAGCGAGGAGCCGTAAT
Rqc2A	TCTGTGGTTACGATTAAAATTGGAT	T = 54 °C/Time = 1 min
Rqc2B	CAATCGACAACAACATTGAGTTTAG
Rqc2C	ACAAGTTAAAAGTAACAATCGCTGG	T = 54 °C/Time = 1 min
Rqc2D	ATTGATAATGGTGTTATCCTCGAAA
KanF1	TATGGAACTGCCTCGGTGAG	T = 54 °C/Time = 1 min
Rqc2D	ATTGATAATGGTGTTATCCTCGAAA
TAP-TAG-F-BoxI	NNNNNNNGACCTACGTCGGTCGACGGATCCCCGGGTT	T = 65 °C/Time = 3 min
TAP-TAG-R-NotI	ATAAGAATGCGGCCGCTCGATGAATTCGAGCTCGTT
RFP-F	GATCAGAGGGGTGAACTTCCC	T = 55 °C/Time = 1 min
TAP-TAG-R	CTTCATCGTGTTGCGCAAGG
RFP-F	GATCAGAGGGGTGAACTTCCC	T = 55 °C/Time = 2 min
Plasmid-R	CCAGAAAGCATTCATCGCGT