Table 4.
Pairwise distances between Blastocystis subtypes barcoding region sequences showing the average number of base substitutions per site. Analyses were conducted using the Kimura 2-parameter model and included 64 nucleotide sequences (Table 2). There were a total of 587 positions in the final dataset. Red background indicates pairwise distance lower than 0.04.
| Subtypes | ||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 21 | 23 | 24 | 25 | 26 | 27 | 28 | 29 | ||
| Subtypes | 1 | |||||||||||||||||||||||||
| 2 | 0.05 | |||||||||||||||||||||||||
| 3 | 0.09 | 0.08 | ||||||||||||||||||||||||
| 4 | 0.09 | 0.10 | 0.06 | |||||||||||||||||||||||
| 5 | 0.09 | 0.09 | 0.10 | 0.08 | ||||||||||||||||||||||
| 6 | 0.14 | 0.14 | 0.14 | 0.14 | 0.14 | |||||||||||||||||||||
| 7 | 0.18 | 0.17 | 0.15 | 0.17 | 0.18 | 0.09 | ||||||||||||||||||||
| 8 | 0.10 | 0.11 | 0.05 | 0.06 | 0.10 | 0.13 | 0.16 | |||||||||||||||||||
| 9 | 0.14 | 0.14 | 0.13 | 0.11 | 0.14 | 0.03 | 0.09 | 0.12 | ||||||||||||||||||
| 10 | 0.10 | 0.11 | 0.08 | 0.06 | 0.11 | 0.13 | 0.16 | 0.05 | 0.12 | |||||||||||||||||
| 11 | 0.05 | 0.07 | 0.10 | 0.09 | 0.09 | 0.14 | 0.17 | 0.11 | 0.14 | 0.09 | ||||||||||||||||
| 12 | 0.10 | 0.10 | 0.09 | 0.09 | 0.04 | 0.14 | 0.17 | 0.09 | 0.15 | 0.09 | 0.09 | |||||||||||||||
| 13 | 0.10 | 0.10 | 0.10 | 0.09 | 0.05 | 0.13 | 0.18 | 0.10 | 0.14 | 0.09 | 0.09 | 0.04 | ||||||||||||||
| 14 | 0.08 | 0.09 | 0.10 | 0.07 | 0.04 | 0.14 | 0.18 | 0.10 | 0.14 | 0.09 | 0.08 | 0.03 | 0.03 | |||||||||||||
| 15 | 0.19 | 0.18 | 0.15 | 0.16 | 0.17 | 0.15 | 0.15 | 0.16 | 0.16 | 0.15 | 0.17 | 0.15 | 0.17 | 0.16 | ||||||||||||
| 16 | 0.12 | 0.13 | 0.09 | 0.09 | 0.12 | 0.14 | 0.18 | 0.10 | 0.13 | 0.10 | 0.13 | 0.11 | 0.11 | 0.11 | 0.14 | |||||||||||
| 17 | 0.18 | 0.17 | 0.13 | 0.14 | 0.17 | 0.15 | 0.16 | 0.15 | 0.16 | 0.15 | 0.17 | 0.16 | 0.16 | 0.16 | 0.15 | 0.14 | ||||||||||
| 21 | 0.09 | 0.10 | 0.10 | 0.08 | 0.05 | 0.12 | 0.16 | 0.09 | 0.14 | 0.08 | 0.09 | 0.03 | 0.04 | 0.03 | 0.16 | 0.11 | 0.15 | |||||||||
| 23 | 0.11 | 0.12 | 0.07 | 0.06 | 0.11 | 0.12 | 0.18 | 0.06 | 0.12 | 0.01 | 0.10 | 0.10 | 0.09 | 0.09 | 0.15 | 0.10 | 0.15 | 0.08 | ||||||||
| 24 | 0.09 | 0.10 | 0.10 | 0.08 | 0.04 | 0.14 | 0.17 | 0.10 | 0.14 | 0.08 | 0.08 | 0.03 | 0.04 | 0.01 | 0.16 | 0.10 | 0.16 | 0.03 | 0.09 | |||||||
| 25 | 0.08 | 0.09 | 0.09 | 0.07 | 0.04 | 0.13 | 0.16 | 0.09 | 0.13 | 0.08 | 0.07 | 0.03 | 0.04 | 0.01 | 0.16 | 0.10 | 0.16 | 0.03 | 0.09 | 0.01 | ||||||
| 26 | 0.09 | 0.10 | 0.10 | 0.08 | 0.05 | 0.14 | 0.16 | 0.09 | 0.14 | 0.08 | 0.08 | 0.03 | 0.04 | 0.03 | 0.17 | 0.10 | 0.16 | 0.01 | 0.08 | 0.02 | 0.02 | |||||
| 27 | 0.15 | 0.16 | 0.14 | 0.13 | 0.15 | 0.05 | 0.09 | 0.14 | 0.05 | 0.14 | 0.15 | 0.16 | 0.14 | 0.15 | 0.17 | 0.15 | 0.16 | 0.15 | 0.13 | 0.16 | 0.15 | 0.15 | ||||
| 28 | 0.19 | 0.17 | 0.15 | 0.16 | 0.16 | 0.16 | 0.18 | 0.16 | 0.18 | 0.16 | 0.17 | 0.15 | 0.17 | 0.16 | 0.06 | 0.15 | 0.15 | 0.15 | 0.16 | 0.16 | 0.15 | 0.16 | 0.19 | |||
| 29 | 0.16 | 0.16 | 0.15 | 0.17 | 0.18 | 0.16 | 0.17 | 0.16 | 0.16 | 0.15 | 0.17 | 0.16 | 0.16 | 0.16 | 0.20 | 0.15 | 0.20 | 0.16 | 0.15 | 0.16 | 0.16 | 0.16 | 0.16 | 0.18 | ||