Table 3.
Run time and memory usage
| Method | Number of cells | Run time | Max. resident set size (kB) |
|---|---|---|---|
| CIDR | 3000 | 00h05m50s | 3 106 072 |
| CIDR | 20 000 | 10h09m22s | 36 010 516 |
| ILoReg | 3000 | 01h15m32s | 660 792 |
| ILoReg | 20 000 | 10h05m38s | 13 916 804 |
| RaceID3 | 3000 | 00h08m47s | 3 038 620 |
| RaceID3 | 20 000 | 37h56m31s | 21 633 488 |
| SC3 | 3000 | 05h37m04s | 5 472 304 |
| SC3 | 20 000 | 44h42m48s | 29 116 792 |
| Seurat | 3000 | 00h00m58s | 819 452 |
| Seurat | 20 000 | 00h04m47s | 5 283 004 |