Table 1.

Comparison of the characteristics of genital tract Megasphaera species with validly named species of the genus Megasphaera

Strains: 1, M. lornae UPII 199-6^T; 2, M. lornae DNF00751; 3, M. hutchinsoni KA00182^T; 4, M. hutchinsoni UPII 135-E; 5, M. vaginalis BV3C16-1^T; 6, M. vaginalis HL562; 7, M. cerevisiae DSM 20462; 8, M. elsdenii DSM 20460; 9, M. hexanoica MH; 10, M. indica DSM 25563; 11, M. massiliensis DSM 26228; 12, M. micronuciformis DSM 17226; 13, M. paucivorans DSM 16981; 14, M. stantonii AJH120; 15, M. sueciensis DSM 17042. Substrate utilization was evaluated using the Biolog anaerobe identification panel. +, Positive; −, negative; w, weak; ng, no growth; nd, not determined; R, resistant; S, susceptible. For tinidazole and secnidazole, the lowest concentrations (μg ml⁻¹) at which we noted a clearance zone are shown. Production of SCFAs was measured after growth in PYG-mod-YG at 37 °C for 24–72 h. ;

Characteristic	1	2	3	4	5	6	7	8	9*	10	11	12	13	14*	15
Cell size (µm)†	0.9–1.5	−	0.5–0.7	−	1.0–1.4	−	1.4	1.2–1.9	0.8–1.2	1.2–2.3	0.87	0.4–0.6	1.2–1.9	1.1–1.8	1.0–1.4
Growth at 45 °C†	−	nd	−	nd	−	nd	−	−	−	−	+	nd	−	+	−
Utilization of:
d-Glucose‡	−	−	−	−	−	−	+/−	−/+	−	+	+	−	−	−	−
d-Fructose‡	ng	nd	−	ng	−	−	+	+	+	+	+	−	−	+	−
Lactose‡	−	nd	−	ng	−	−	−	−	nd	−	−	−	−	nd	−
Sucrose	−	−	−	−	−	−	−	−	nd	−	+	−	−	nd	−
Dextrin	−	−	−	−	−	−	−	−	nd	+	+	−	−	nd	−
d-Mannitol	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	+	−	−	−	−
d,l-Lactate	+	+	+	+	+	+	+	+	w	+	+	+	+	−	+
Pyruvate	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Succinate	w	w	+	+	w	+	−	−	nd	−	−	−	−	nd	−
α-Ketovalerate	+	+	+	+	+	+	+	+	nd	+	+	+	+	nd	+
l-Alanine	−	−	−	−	+	+	−	+	nd	+	+	+	+	nd	−
l-Alanyl-l-Glutamine	−	−	+	−	+	+	+	−	nd	+	+	+	+	nd	−
l-Glutamine	−	−	−	−	+	+	+	−	nd	−	+	+	+	nd	−
l-Glutamate	−	+	+	+	+	+	−	+	nd	−	+	−	+	nd	−
l-Serine	+	+	+	+	+	+	+	+	nd	+	+	+	+	nd	+
Production of:
Gas	nd	−	−	nd	−	−	+	+	+	+	+	−	−	nd	−
H2S	−	−	−	−	−	−	−	−	+	−	+	−	−	nd	−
Indole	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	nd	−
Presence of:
Oxidase	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	nd	−
Catalase	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	nd	−
Nitrate reduction	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	−	nd	−
Susceptibility to:
Bile (1 mg)	S	S	S	S	S	S	S	S	S	S	S	S	S	nd	S
Colistin (10 µg)	R	R	S	R	R	R	S	S	S	S	S	S	R	R	R
Vancomycin (5 µg)	R	S	R	R	R	R	R	R	R	R	R	R	R	R	R
Kanamycin (1000 µg)	S	S	S	S	S	S	S	S	nd	S	S	S	S	nd	S
Clindamycin	S	S	S	S	S	S	S	S	nd	S	S	S	S	nd	nd
Metronidazole	S	S	S	S	S	S	S	S	nd	S	S	S	S	nd	nd
Tinidazole	nd	0.5	0.125	nd	0.25	0.125	0.25	1	nd	0.5	1	0.5	0.25	nd	nd
Secnidazole	nd	0.5	0.25	nd	0.25	0.125	0.25	0.5	nd	0.25	0.5	0.5	0.25	nd	nd
Short chain fatty acids:
2-Aminobutyric acid	w	−	+	w	+	+	+	+	nd	+	+	+	+	nd	+
2-Methylbutyric acid	+	−	+	+	+	+	+	+	nd	w	w	+	w	nd	+
Acetic acid	w	+	−	−	−	−	−	+	+	w	−	−	w	+	+
Butyric acid	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Formic acid	w	+	w	w	+	−	w	+	nd	+	−	−	w	+	w
Fumaric acid	+	+	+	+	+	+	+	+	nd	+	+	+	+	nd	+
Isobutyric acid	+	−	+	+	+	+	+	+	+	w	w	+	w	nd	+
Isovaleric acid	+	−	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Lactic acid	w	w	w	w	+	+	−	−	nd	w	w	w	−	−	−
n-caproic acid	−	−	−	−	−	−	−	+	+	+	+	−	−	nd	−
n-valeric acid	−	−	−	−	−	−	−	−	+	−	−	−	+	nd	+
Propionic acid	+	+	−	+	+	+	−	+	+	−	−	+	+	+	+
Succinic acid	−	−	−	−	−	−	+	+	nd	+	+	−	−	nd	−

*Characteristics for 9, M. hexanoica MH are from Jeon et al. [3], and for 14, M. stantonii AJH120 are from Maki and Looft [6].

†Data for cell size and growth at 45 °C was determined for UPII 199-6^T, KA00182^T and BV3C16-1^T. Cell size and growth at 45 °C for the other species were obtained from the original publications [1–7, 9].

‡d-Glucose, d-fructose and lactose fermentation was also assessed using the Pre-Reduced Anaerobically Sterilized (PRAS) medium. +, Positive by both methods, −, negative by both methods; +/−, positive by Biolog and negative by PRAS; −/+, negative by Biolog and positive by PRAS; ng, no growth; nd, not determined.