Table 1. Protonation state setup for molecular dynamics simulations.
H/H/H | H/H/− | H/−/H | −/H/H | H/−/− | −/H/− | −/−/H | −/−/− | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
E80 | H | H | H | − | H | − | − | − |
E412 | H | H | − | H | − | H | − | − |
E417 | H | − | H | H | − | − | H | − |
H/H/H | H/H/− | H/−/H | −/H/H | H/−/− | −/H/− | −/−/H | −/−/− | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
E80 | H | H | H | − | H | − | − | − |
E412 | H | H | − | H | − | H | − | − |
E417 | H | − | H | H | − | − | H | − |