Skip to main content
. 2021 Jun 1;11:11474. doi: 10.1038/s41598-021-90822-2

Table 2.

Primer sequences and RT-PCR conditions for Stag2, Poldip3, Madd and Smn transcript amplification.

Transcript and size Primer Primer sequence Temperature profile
Stag2 Exon 29 Fwd GGCATGCAACTAGCACTCC 55 °C 30 min
+ 30b 346 bp Exon 32 Rev CTTCCATTAGGCTTGTACCACG 94 °C 2 min
Δ30b 235 bp 94 °C 40 s
55 °C 30 s 28 cycles
68 °C 1 min
Poldip3 Exon 2 Fwd CCGGTTTCGGATCAAAGGGA 55 °C 30 min
FL 349 bp Exon 4 Rev CATCTGCTTGGGAGGGACAG 94 °C 2 min
Δ3 260 bp 94 °C 40 s
55 °C 30 s 30 cycles
68 °C 1 min
Madd Exon 27 Fwd CTGCGTGGTGTTGCGTAGTA 55 °C 30 min
FL 349 bp Exon 30/31 GAAAACCTTCCGCTCCTGGTTG 94 °C 2 min
Rev 94 °C 40 s
55 °C 30 s 32 cycles
68 °C 1 min
Smn Exon 4 Fwd GAAAGTCAAGTTTCCACAGACG 55 °C 30 min
FL 430 bp Exon 8 Rev CACCCCATCTCCTGAGACAGAGC 94 °C 2 min
94 °C 40 s
60 °C 30 s 28 cycles
68 °C 1 min