Skip to main content
. 2021 Jun 1;7:e562. doi: 10.7717/peerj-cs.562

Table 3. Classification error rate, sensitivity and Brier score produced by Random Forest, k-Nearest Neighbors and Support Vector Machine classifiers on Breastcancer dataset based on genes selected by the given methods. The best result is shown in bold.

RF KNN SVM
Genes POS RPOS GClust sigF Wilc mRmR POS RPOS GClust sigF Wilc mRmR POS RPOS GClust sigF Wilc mRmR
5 Err 0.296 0.239 0.261 0.490 0.390 0.455 0.314 0.206 0.313 0.448 0.405 0.402 0.310 0.260 0.512 0.522 0.384 0.367
BS 0.013 0.010 0.165 0.287 0.254 0.277 0.014 0.011 0.290 0.275 0.261 0.254 0.021 0.011 0.262 0.251 0.262 0.244
sen 0.784 0.837 0.810 0.621 0.722 0.661 0.706 0.862 0.798 0.703 0.761 0.760 0.704 0.776 0.558 0.506 0.714 0.791
10 Err 0.308 0.224 0.261 0.514 0.360 0.462 0.276 0.240 0.297 0.501 0.390 0.396 0.272 0.214 0.522 0.484 0.351 0.456
BS 0.013 0.011 0.168 0.278 0.225 0.266 0.013 0.013 0.202 0.304 0.251 0.254 0.022 0.013 0.261 0.260 0.237 0.260
sen 0.757 0.858 0.818 0.613 0.709 0.654 0.786 0.842 0.819 0.677 0.754 0.764 0.750 0.796 0.575 0.412 0.704 0.743
15 Err 0.323 0.179 0.202 0.519 0.337 0.414 0.297 0.204 0.241 0.514 0.391 0.401 0.262 0.215 0.515 0.462 0.350 0.427
BS 0.013 0.009 0.145 0.275 0.222 0.246 0.012 0.008 0.182 0.324 0.255 0.256 0.046 0.010 0.262 0.260 0.235 0.255
sen 0.709 0.864 0.848 0.643 0.767 0.719 0.781 0.835 0.810 0.685 0.768 0.763 0.741 0.781 0.564 0.354 0.742 0.798
20 Err 0.290 0.195 0.199 0.481 0.377 0.468 0.279 0.207 0.257 0.473 0.408 0.395 0.225 0.215 0.542 0.409 0.386 0.474
BS 0.014 0.011 0.155 0.265 0.234 0.258 0.014 0.010 0.188 0.284 0.260 0.256 0.041 0.013 0.259 0.254 0.251 0.265
sen 0.767 0.853 0.851 0.694 0.717 0.686 0.794 0.815 0.840 0.734 0.745 0.763 0.793 0.798 0.526 0.390 0.673 0.781
25 Err 0.300 0.186 0.223 0.495 0.366 0.473 0.256 0.186 0.271 0.462 0.404 0.393 0.250 0.223 0.523 0.406 0.377 0.427
BS 0.012 0.010 0.156 0.270 0.229 0.265 0.012 0.010 0.178 0.279 0.260 0.251 0.033 0.010 0.264 0.254 0.246 0.259
sen 0.777 0.883 0.832 0.694 0.726 0.659 0.801 0.829 0.838 0.693 0.753 0.759 0.790 0.798 0.567 0.397 0.691 0.790
30 Err 0.268 0.197 0.242 0.411 0.350 0.454 0.261 0.192 0.258 0.436 0.387 0.394 0.249 0.198 0.455 0.418 0.351 0.457
BS 0.009 0.008 0.158 0.248 0.222 0.261 0.011 0.009 0.182 0.281 0.250 0.253 0.031 0.009 0.260 0.253 0.236 0.262
sen 0.823 0.870 0.836 0.733 0.736 0.694 0.813 0.834 0.818 0.708 0.776 0.767 0.787 0.794 0.661 0.365 0.698 0.767