Skip to main content
. 2021 Apr 29;100(7):101210. doi: 10.1016/j.psj.2021.101210

Table 2.

Recombination events of CK/CH/SCMY/160315 as assessed using 7 different methods within the RPD4 software.

Breakpoints
Major Minor P value of the detection methods
Recombinant event Beginning Ending (Similarity) (Similarity) RDP GENECONV BootScan MaxChi Chimaera SiScan 3Seq
1 9 5,870 H120(97.8%) 4/91(99.8%) 5.993 × 10−120 1.443 × 10−116 5.492 × 10−58 2.087 × 10−39 1.114 × 10−38 1.968 × 10−26 1.866 × 10−66
2 16,351 22,884 4/91(94.2%) LDT3-A(99.7%) NS 2.428 × 10−306 NS 2.876 × 10−21 3.130 × 10−76 3.733 × 10−99 2.470 × 10−322
3 22,885 23,810 LDT3-A(86.5%) 4/91(99.8%) 1.003 × 10−57 2.501 × 10−65 3.398 × 10−65 2.427 × 10−16 2.384 × 10−16 8.575 × 10−18 NS
4 23,811 24,175 H120(89.9%) LDT3-A(97.3%) 1.228 × 10−24 8.905 × 10−24 9.431 × 10−24 1.843 × 10−18 5.718 × 10−17 3.337 × 10−25 2.220 × 10−15
5 24,155 25,911 4/91(92.4%) LJL/08-1(97%) 6.599 × 10−85 9.441 × 10−70 2.080 × 10−87 1.860 × 10−26 1.279 × 10−03 2.913 × 10−32 2.828 × 10−48
6 26,594 27,083 LDT3-A(90.1%) 4/91(99.6%) NS 9.947 × 10−15 3.247 × 10−17 5.360 × 10−08 1.336 × 10−04 8.825 × 10−14 3.515 × 10−02