Table 2. PCR primers used in this study.
Marker gene | Primer designation | Primer sequence | Reference |
---|---|---|---|
16S rRNA | fD1 | 5´-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG | [27] |
rP2 | 5´- ACGGCTACCTTGTTACGACTT | ||
27F | 5´- AGAGTTTGATCCTGGCTCAG | [21] | |
1492R | 5´- GGTTACCTTGTTACGACTT | ||
gyrA | gyrA-42f | 5´-CAGTCAGGAAATGCGTACGTCCTT | |
gyrA-1066r | 5´-CAAGGTAATGCTCCAGGCATTGCT | ||
rpoB | rpoB-2292f | 5´- GACGTGGGATGGCTACAACT | |
rpoB-3354r | 5´- ATTGTCGCCTTTAACGATGG | ||
purH | purH-70f | 5´- ACAGAGCTTGGCGTTGAAGT | |
purH-1013r | 5´- GCTTCTTGGCTGAATGAAGG | ||
groEL | groEL-550f | 5´- GAGCTTGAAGTKGTTGAAGG | |
groEL-1497r | 5´- TGAGCGTGTWACTTTTGTWG |