Skip to main content
. 2021 Jun 23;41(25):5386–5398. doi: 10.1523/JNEUROSCI.1883-20.2021

Table 2.

SD-Induced changes in ribosome-associated transcript abundance in Camk2a::RiboTag mice

Gene name Region Sleep, ΔCT
SD, ΔCT
qPCR p value (sleep vs SD)
n (sleep)
n (SD)
3 h 6 h 3 h 6 h 3 h 6 h 3 h 6 h 3 h 6 h
Arc CTX 5.16 ± 0.37 2.20 ± 0.26 3.9 ± 0.19 0.93 ± 0.17 0.0003 <0.0001 4 6 5 6
HP 4.29 ± 0.07 5.05 ± 0.09 3.98± 0.15 4.53 ± 0.12 0.4663 0.0036 4 6 5 6
Homer1a CTX 5.11 ± 0.29 2.25 ± 0.16 4.053 ± 0.18 0.44 ± 0.04 0.0017 <0.0001 4 6 5 6
HP 5.97 ± 0.09 5.33 ± 0.74 5.12 ±0.232 3.76 ± 0.04 0.0036 <0.0001 4 6 5 6
Narp CTX 5.34 ± 0.05 2.00 ± 0.10 4.861 ± 0.08 1.66 ± .12 0.1688 0.0902 4 6 5 6
HP 6.09 ± 0.13 4.932 ± 0.16 5.98 ±0.21 4.86 ± 0.15 0.8637 0.7475 4 6 5 6
Bdnf CTX 5.02 ± 0.12 1.54 ± 0.06 4.542 ± 0.10 0.90 ± 0.07 0.1688 0.0049 4 6 5 6
HP 3.94 ± 0.03 4.09 ± 0.10 3.92 ± 0.16 3.99 ± 0.07 0.9288 0.7475 4 6 5 6
Npas4 CTX 8.42 ± 0.23 4.34 ± 0.12 7.64 ± 0.20 3.50 ± 0.10 0.1370 0.0031 4 6 5 6
HP 8.61 ± 0.38 8.58 ± 0.18 8.87 ± 0.14 7.80 ± 0.12 0.4478 0.0005 4 6 5 6
cFos CTX 6.17 ± 0.42 3.11 ± 0.31 5.68 ± 0.24 1.81 ± 0.17 0.2664 <0.0001 4 6 5 6
HP 7.64 ± 0.15 8.32 ± 0.13 6.74 ± 0.20 6.52 ± 0.18 0.0209 <0.0001 4 6 5 6
FosB CTX 5.99 ± 0.12 2.87 ± 0.21 5.42 ± 0.26 1.98 ± 0.10 0.2664 0.0031 4 6 5 6
HP 6.45 ± 0.09 6.69 ± 0.13 6.10 ± 0.22 5.71 ± 0.07 0.4478 <0.0001 4 6 5 6
Clock CTX 3.95 ± 0.07 0.97 ± 0.08 3.76 ± 0.02 0.93 ± 0.04 0.6176 0.9770 4 6 5 6
HP 3.45 ± 0.07 3.63 ± 0.06 3.35 ± 0.05 3.56 ± 0.06 0.8666 0.6647 4 6 5 6
Bmal1 CTX 4.68 ± 0.11 1.34 ± 0.10 4.71 ± 0.09 1.27 ± 0.07 0.8745 0.9770 4 6 5 6
HP 4.35 ± 0.09 4.37 ± 0.05 4.39 ± 0.08 4.38 ± 0.06 0.9378 0.9028 4 6 5 6
Cry1 CTX 5.90 ± 0.09 2.33 ± 0.08 5.78 ± 0.10 2.24 ± 0.07 0.8434 0.9592 4 6 5 6
HP 5.88 ± 0.10 6.34 ± 0.10 6.07 ± 0.11 6.10 ± 0.05 0.5022 0.0138 4 6 5 6
Cry2 CTX 4.23 ± 0.03 0.36 ± 0.05 4.36 ± 0.11 0.42 ± 0.04 0.8434 0.977 4 6 5 6
HP 3.80 ± 0.02 3.75 ± 0.04 4.10 ± 0.11 3.95 ± 0.01 0.1126 0.0493 4 6 5 6
Per1 CTX 3.90 ± 0.16 0.23 ± 0.10 3.97 ± 0.13 0.19 ± 0.11 0.8745 0.9770 4 6 5 6
HP 3.62 ± 0.05 3.31 ± 0.03 3.73 ± 0.11 3.34 ± 0.05 0.8666 0.9028 4 6 5 6
Per2 CTX 7.43 ± 0.08 3.71 ± 0.18 6.87 ± 0.10 3.38 ± 0.06 0.0012 0.0654 4 6 5 6
HP 6.62 ± 0.07 6.80 ± 0.07 6.62 ± 0.10 6.56 ± 0.04 0.9744 0.0138 4 6 5 6
Rev-Erba CTX 3.32 ± 0.16 −0.50 ± 0.14 3.48 ± 0.09 0.02 ± 0.06 0.7553 0.0066 4 6 5 6
HP 4.05 ± 0.09 1.92 ± 0.05 3.91 ± 0.05 2.13 ± 0.03 0.3593 0.7601 4 6 5 6
Dbp CTX 5.29 ± 0.15 2.47 ± 0.08 5.54 ± 0.13 2.85 ± 0.07 0.5635 0.0570 4 6 5 6
HP 5.33 ± 0.07 4.05 ± 0.24 5.61 ± 0.09 4.03 ± 0.37 0.0583 0.9171 4 6 5 6
Tef CTX 3.47 ± 0.02 0.62 ± 0.07 3.58 ± 0.07 0.74 ± 0.04 0.7553 0.4556 4 6 5 6
HP 3.14 ± 0.02 2.54 ± 0.05 3.14 ± 0.08 2.33 ± 0.04 0.9679 0.7601 4 6 5 6
Nfil3 CTX 6.34 ± 0.14 3.80 ± 0.19 6.29 ± 0.07 3.62 ± 0.07 0.7553 0.4310 4 6 5 6
HP 6.19 ± 0.07 5.45 ± 0.05 5.94 ± 0.04 4.94 ± 0.07 0.0997 0.083 4 6 5 6
ec1 CTX 3.36 ± 0.16 −0.43 ± 0.15 3.18 ± 0.15 −0.77 ± 0.08 0.7553 0.0754 4 6 5 6
HP 2.74 ± 0.06 1.37 ± 0.05 2.55 ± 0.11 1.21 ± 0.05 0.2666 0.7601 4 6 5 6