Table 2:

Factor loadings from a seven-factor analysis using principal components method and varimax rotation by each time point

	Start of controlled viremia								Week 0								Week 48
Marker	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	Communality	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	Communality	F1	F2	F3	F4	F5	F6	F7	Communality
IFNα2	0.77	−0.08	0.21	−0.03	0.23	−0.00	0.02	0.69	0.79	0.07	0.03	−0.13	−0.22	0.02	0.04	0.70	0.80	0.04	−0.13	0.22	0.15	−0.03	0.21	0.77
IFNγ	0.76	−0.01	0.23	−0.21	0.02	−0.09	0.13	0.69	0.82	0.13	−0.12	0.05	−0.03	0.09	−0.09	0.72	0.88	0.05	0.07	0.06	0.04	0.08	−0.04	0.79
IL-10	0.74	0.22	0.00	0.00	0.13	0.03	−0.08	0.62	0.81	−0.01	−0.09	0.04	0.13	0.04	0.12	0.70	0.72	0.24	0.17	−0.18	0.35	−0.17	−0.08	0.80
IL-1β	0.77	0.02	−0.09	0.23	−0.07	0.07	−0.01	0.66	0.66	0.17	0.19	−0.16	−0.46	−0.18	−0.07	0.77	0.81	−0.08	−0.12	0.23	−0.20	0.11	0.11	0.80
IL-6	0.51	0.15	0.61	0.14	−0.16	−0.00	0.03	0.71	0.89	0.06	0.13	−0.09	0.03	0.05	−0.09	0.84	0.78	−0.06	−0.25	−0.01	−0.22	0.21	0.00	0.76
IP-10	0.89	0.14	0.15	0.04	−0.04	0.07	−0.04	0.84	0.90	0.13	−0.02	0.01	−0.01	0.07	−0.08	0.84	0.85	0.15	0.12	0.04	−0.03	0.22	−0.01	0.81
TNFα	0.73	0.22	−0.12	0.22	0.27	0.04	0.04	0.73	0.88	0.12	0.06	0.05	−0.03	−0.03	0.07	0.80	0.80	0.06	0.12	−0.03	0.35	−0.05	0.07	0.79
sCD163	−0.13	0.70	0.15	0.09	0.05	0.08	0.06	0.55	0.05	0.44	0.16	0.01	0.62	−0.26	−0.03	0.67	0.21	0.69	0.07	−0.18	0.28	−0.08	0.08	0.65
sICAM-1	0.27	0.79	0.20	0.00	−0.15	0.05	−0.06	0.76	0.14	0.85	0.12	−0.13	−0.16	−0.04	−0.09	0.81	0.00	0.86	0.02	0.12	−0.21	0.23	0.10	0.86
sVCAM-1	0.39	0.75	−0.10	−0.03	0.00	0.00	−0.04	0.74	0.10	0.89	0.11	−0.08	0.06	−0.04	−0.04	0.84	−0.05	0.90	−0.10	0.06	−0.01	0.05	−0.03	0.84
CRP	0.16	0.11	0.74	0.04	−0.15	0.12	0.08	0.63	0.17	0.63	−0.12	0.22	−0.02	0.42	0.13	0.68	0.35	0.48	0.16	0.04	−0.52	0.04	0.08	0.65
sCD14	−0.04	0.05	0.84	−0.12	0.11	−0.10	−0.01	0.74	0.10	−0.00	0.16	−0.13	0.04	0.79	−0.08	0.68	0.27	0.26	0.29	−0.02	−0.38	0.32	0.40	0.64
sE-selectin	−0.06	0.23	0.19	−0.24	0.32	0.67	0.17	0.73	0.04	0.17	0.63	0.06	0.08	0.29	0.01	0.52	0.01	0.31	0.40	0.10	−0.22	0.63	−0.09	0.73
sP-selectin	0.05	0.00	−0.11	0.26	−0.07	0.80	−0.06	0.74	−0.07	0.02	0.83	0.16	0.05	−0.00	−0.03	0.72	0.23	0.03	−0.14	0.08	0.20	0.82	−0.03	0.80
MIP-1β	0.17	0.24	−0.12	0.64	0.01	0.14	−0.16	0.56	0.54	−0.12	0.40	0.21	0.09	−0.08	0.22	0.57	0.16	0.04	0.20	0.82	0.17	−0.02	0.00	0.77
VEGF-A	0.32	−0.10	0.01	0.64	−0.05	0.33	0.11	0.65	0.15	0.17	0.45	0.06	−0.51	−0.22	−0.05	0.56	0.06	0.00	−0.19	0.81	−0.03	0.14	−0.06	0.72
CX3CL1	0.09	−0.31	−0.02	0.27	0.66	−0.02	−0.10	0.62	0.02	−0.06	0.14	0.73	−0.20	0.02	0.07	0.60	−0.12	−0.01	0.27	0.22	0.04	0.26	−0.69	0.68
MCP-1	0.20	0.12	−0.07	−0.01	0.71	0.09	0.09	0.58	0.61	0.06	−0.01	0.44	0.12	0.14	0.09	0.62	0.31	0.06	−0.12	0.23	0.74	0.15	0.03	0.74
Fibrinogen	0.01	0.07	0.25	0.18	−0.34	0.31	−0.52	0.58	0.02	−0.11	0.13	−0.20	0.71	0.07	−0.03	0.58	−0.02	−0.15	0.79	−0.09	0.04	0.12	0.07	0.67
MMP9	−0.23	−0.05	0.10	0.70	0.21	−0.18	0.11	0.64	−0.04	−0.03	0.13	0.74	−0.01	−0.16	−0.18	0.62	0.01	0.13	0.69	0.07	−0.18	−0.13	−0.21	0.59
NFL	0.03	0.02	0.17	0.09	−0.06	0.13	0.87	0.81	0.01	−0.05	−0.00	−0.08	−0.02	−0.06	0.95	0.92	−0.01	0.07	0.03	0.08	0.03	0.06	0.83	0.71
Eigenvalue	4.40	2.08	2.00	1.74	1.44	1.43	1.17		5.52	2.29	1.67	1.54	1.53	1.11	1.09		5.00	2.57	1.72	1.65	1.61	1.54	1.49

Communality refers to the proportion of variance in the biomarker accounted for by the seven factors at a given time point

Factor loadings (0.4 < |F| ≤ 1.0) denoted by light highlighting.

Color corresponds to the factor loading number at each time point (F1=blue, F2=Red, F3=Green, F4=Orange, F5-F7=Grey).