Table 4A.
The 31 histone acetyl transferases and 18 deacety lasesare differentially expressed in endothelial cells and other cells infected by several coronaviruses such as SARS-CoV, MERS-CoV and mutant coronaviruses.
| Virus | MERS-Cov | SARS-Cov | SARS-Cov (ORF6 mutant) | MA-15 (SARS-CoV) | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Origin | HMECs | Calu-3 cells | Mouse Lung tissues (WT) | ||||||||||||||
| Time | 12(hr) | 24(hr) | 36(hr) | 48(hr) | 12(hr) | 24(hr) | 36(hr) | 48(hr) | 72(hr) | 12(hr) | 24(hr) | 36(hr) | 48(hr) | 72(hr) | 2(d) | 4(d) | 7(d) |
| Histone acetylation | -1.08 | 1.04 | |||||||||||||||
| HAT1 | -1.27 | ||||||||||||||||
| KAT2A | -1.11 | ||||||||||||||||
| KAT2B | -1.66 | -2.30 | -2.19 | -1.46 | -1.05 | -1.05 | |||||||||||
| KAT6A | 1.59 | 1.92 | |||||||||||||||
| KAT6B | -1.04 | -1.34 | -1.07 | ||||||||||||||
| KAT7 | -1.58 | -1.60 | |||||||||||||||
| KAT8 | -1.53 | -1.48 | |||||||||||||||
| ELP3 | -1.09 | -1.18 | |||||||||||||||
| NCOA1 | 1.06 | -1.02 | |||||||||||||||
| NCOA3 | -1.03 | -1.05 | 1.04 | ||||||||||||||
| CLOCK | 1.21 | 2.06 | 1.24 | -1.40 | -1.61 | ||||||||||||
| CREBBP | 1.40 | 1.30 | 1.86 | 1.92 | |||||||||||||
| EP300 | 1.63 | 1.59 | |||||||||||||||
| ATAT1 | -1.22 | -1.52 | -1.34 | -1.34 | -1.02 | -1.58 | |||||||||||
| TAF1 | -1.36 | ||||||||||||||||
| GTF3C4 | 1.31 | 1.38 | 1.22 | -1.35 | -1.66 | -1.17 | -1.17 | 1.31 | 1.52 | ||||||||
| NAT10 | 1.18 | ||||||||||||||||
| NAT9 | -1.58 | -1.39 | |||||||||||||||
| NAT8 | -1.31 | -1.31 | -1.18 | -1.18 | |||||||||||||
| NAT14 | -1.69 | -1.73 | |||||||||||||||
| BPTF | -1.24 | 1.20 | |||||||||||||||
| NAA10 | -1.67 | -1.65 | -1.14 | ||||||||||||||
| NAA20 | -1.12 | -1.66 | -1.81 | -1.04 | 1.07 | ||||||||||||
| NAA30 | 1.01 | 1.40 | 1.05 | 1.64 | -1.01 | -1.46 | |||||||||||
| NAA60 | |||||||||||||||||
| NAA40 | -1.14 | -1.79 | |||||||||||||||
| NAA50 | 1.31 | 1.13 | |||||||||||||||
| TAF5L | -1.23 | -1.11 | 1.11 | 1.10 | |||||||||||||
| TAF6L | -1.34 | -1.31 | |||||||||||||||
| BTAF1 | 2.03 | 1.79 | |||||||||||||||
| Histone deacetylation | |||||||||||||||||
| HDAC4 | -1.48 | ||||||||||||||||
| HDAC5 | 1.09 | 1.16 | -1.16 | -1.05 | -1.05 | ||||||||||||
| HDAC7 | -1.02 | ||||||||||||||||
| HDAC9 | 3.24 | 5.01 | 2.09 | 1.79 | 3.12 | 2.99 | 2.99 | 3.19 | 2.85 | ||||||||
| HDAC6 | -1.75 | -1.68 | -1.44 | -1.44 | -1.07 | ||||||||||||
| HDAC10 | -1.30 | ||||||||||||||||
| HDAC1 | -1.09 | -2.00 | -2.17 | -1.35 | -1.35 | -1.28 | -1.28 | ||||||||||
| HDAC2 | -1.19 | ||||||||||||||||
| HDAC3 | -1.11 | ||||||||||||||||
| HDAC8 | -1.00 | -1.77 | -1.34 | -1.17 | |||||||||||||
| SIRT1 | 1.10 | 2.08 | 2.30 | ||||||||||||||
| SIRT2 | -2.02 | -2.18 | -1.28 | -1.28 | |||||||||||||
| SIRT3 | -1.06 | -1.17 | -1.44 | -1.82 | |||||||||||||
| SIRT4 | -1.21 | -1.66 | -1.27 | -1.06 | 1.68 | ||||||||||||
| SIRT5 | -1.54 | -2.09 | -1.30 | -1.04 | |||||||||||||
| SIRT6 | -1.54 | -1.57 | |||||||||||||||
| SIRT7 | -1.06 | ||||||||||||||||
| HDAC11 | 2.36 | -1.61 | -2.00 | -1.01 | -1.01 | -1.45 | -1.71 | ||||||||||
The Log FC value of genes with P value < 0.05 and |logFC|>1 are shown.