Table 4. Comparison of fifteen samples using the two automated circuits implemented in our lab using Thermo Fisher kits: OT2-KF pathogen and OT2-KF Viral Pathogen II.
Kit Pathogen | Kit Viral Pathogen II | |||||||
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Sample | N | ORF | S | MS2 | N | ORF | S | MS2 |
S1 | Undetectable | Undetectable | Undetectable | 26,4 | Undetectable | Undetectable | Undetectable | 26,5 |
S2 | 22,9 | 23,1 | 22,7 | 22,9 | 23,9 | 23,4 | 22,8 | 27,1 |
S3 | 27,3 | 27,9 | 27,8 | 26,7 | 29,2 | 29,2 | 28,7 | 27,5 |
S4 | 31,4 | 31,3 | 31,6 | 26,4 | 32,5 | 34,5 | 33,0 | 27,4 |
S5 | 28,9 | 30 | 29 | 26,7 | 32,7 | 34,7 | 34,1 | 25,6 |
S6 | Undetectable | Undetectable | Undetectable | 26,3 | Undetectable | Undetectable | Undetectable | 27,5 |
S7 | 31,9 | 31,4 | 29,7 | 26,8 | 33,4 | 33,3 | 32,3 | 28,7 |
S8 | Undetectable | Undetectable | Undetectable | 25,9 | 37,9 | Undetectable | Undetectable | 28,2 |
S9 | 17,9 | 18,5 | 18,6 | 26,3 | 20,0 | 20,2 | 19,8 | 28,0 |
S10 | 26,3 | 26,8 | 24,8 | 26,7 | 27,0 | 27,2 | 26,9 | 27,0 |
S11 | 21,8 | 21,9 | 21,9 | 26,9 | 22,5 | 22,7 | 22,3 | 25,1 |
S12 | 25,7 | 26,2 | 24,9 | 27,3 | 26,9 | 26,8 | 26,2 | 27,8 |
S13 | 23,4 | 23,4 | 23,2 | 26,5 | 25,0 | 25,1 | 24,8 | 27,1 |
S14 | 27,8 | 27,9 | 27,5 | 25,7 | 29,3 | 28,7 | 28,4 | 26,8 |
S15 | Undetectable | Undetectable | Undetectable | 25,9 | Undetectable | Undetectable | Undetectable | 27,0 |